Biologia molecular

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Biologia molecular
Unidade1- obtenção de ácidos nucleicos
1. 
Os nucleotídeos são as unidades moleculares que, ligadas entre si, dão origem às moléculas de DNA e RNA. Sobre os nucleotídeos:
I. Os nucleotídeos são formados por açúcares, grupos fosfato e bases nitrogenadas.
II. Os açúcares dos ácidos nucleicos são compostos por anéis de seis carbonos, apolares.
III. As bases nitrogenadas são componentes carregados eletricamente e os grupos fosfato são neutros e apolares.
​​​​​​​IV. As purinas são a adenina e a guanina, e as pirimidinas são a citosina, a timina e a uracila.
Quais dessas afirmações estão corretas?
Você acertou!
C. 
I e IV.
Os nucleotídeos são formados por:
- açúcares: pentoses de cinco carbonos, polares.
- grupos fosfato: carregados negativamente e, portanto, polares.
- bases nitrogenadas: com anéis aromáticos apolares. Podem ser purinas (adenina e guanina) ou pirimidinas (citosina, timina e uracila).
2. 
Algumas características dos nucleotídeos de moléculas de DNA e de RNA diferenciam essas moléculas entre si biologicamente. Considerando essa afirmação, qual das afirmativas a seguir está correta?​​​​​​​
Você acertou!
C. 
O RNA é composto por ribonucleotídeos que contam com as bases nitrogenadas adenina, guanina, citosina e uracila.
O RNA é composto por ribonucleotídeos que contam com as bases nitrogenadas adenina, guanina, citosina e uracila. O DNA, por desoxirribonucleotídeos que contam com a timina no lugar da uracila.
3. 
A direcionalidade de ácidos nucleicos é uma propriedade fundamental, com consequências para as reações de síntese, de leitura e de processamento de DNAs e RNAs. Que caracterísitica das cadeias dos ácidos nucleicos garante essa propriedade?​​​​​​​
Você acertou!
B. 
A orientação 5’–3’ da ligação fosfodiéster entre nucleotídeos adjacentes.
A direcionalidade das cadeias diz respeito ao sentido 5’–3’ dado pelas ligações fosfodiéster. A ligação ocorre sempre entre o grupo 5’–PO4 de um nucleotídeo livre à extremidade 3’–OH da cadeia pré-existente. A síntese de ácidos nucleicos, assim, ocorre sempre no sentido 5’à3’: a cadeia pré-existente tem na sua ponta externa um grupo 5’–PO4 livre e o nucleotídeo incorporado à cadeia tem um grupo 3’–OH livre.
4. 
A estrutura secundária de ácidos nucleicos é o nível de organização molecular no qual a cadeia polinucleotídica dobra-se sobre si mesma em função de interações entre intramoleculares, intermoleculares e com o meio.
A propriedade de (i) decorre da característica apolar e aromática das bases nitrogenadas que interagem entre si por dipolos, e a propriedade de (ii) diz respeito às ligações de hidrogênio que são formadas entre as bases nitrogenadas complementares de cadeias opostas.
Qual alternativa relaciona corretamente os conceitos em (i) e (ii)?
Você acertou!
D. 
(i) Empilhamento de bases e (ii) pareamento de bases.
As bases nitrogenadas dos nucleotídeos do DNA e do RNA podem realizar empilhamento de bases com os anéis aromáticos planares das bases nitrogenadas, interagindo entre si por indução de dipolos transientes, e podem também realizar pareamento entre bases complementares, que é resultante das ligações de hidrogênio formadas entre grupos amino e carbonila entre bases de cadeias opostas. As propriedades de fitas antiparalelas e de cavidades desiguais de hélices-duplas são decorrentes, respectivamente, da orientação oposta da ligação fosfodiéster entre as fitas e pelo fato de as ligações covalentes entre as pentoses e as bases nitrogenadas de cada fita não estarem diretamente opostas.
5. 
O isolamento de ácidos nucleicos de amostras biológicas envolve uma série de procedimentos. A ordem correta de procedimentos em um protocolo genérico para obtenção de uma solução aquosa enriquecida com DNA e RNA a partir de uma solução homogênea tecidual é:​​​​​​​
Você acertou!
A. 
Separação, precipitação, lavagem, reidratação.
As etapas padrão de um protocolo de extração de ácidos nucleicos a partir de um lisado celular envolvem a separação do ácido nucleico de componentes hidrofóbicos, a precipitação dos ácidos nucleicos na solução aquosa, a lavagem do precipitado de ácidos nucleicos para remoção de impurezas e a reidratação do precipitado em água. A lise celular é uma etapa prévia necessária quando ainda não se tem uma solução amostral homogênea, como quando o tecido ainda está intacto e as células com suas membranas celulares intactas.
Resposta incorreta.
B. 
Precipitação, separação, lavagem, reidratação.
As etapas padrão de um protocolo de extração de ácidos nucleicos a partir de um lisado celular envolvem a separação do ácido nucleico de componentes hidrofóbicos, a precipitação dos ácidos nucleicos na solução aquosa, a lavagem do precipitado de ácidos nucleicos para remoção de impurezas e a reidratação do precipitado em água. A lise celular é uma etapa prévia necessária quando ainda não se tem uma solução amostral homogênea, como quando o tecido ainda está intacto e as células com suas membranas celulares intactas.
Unidade 2- eletroforese
1. 
A eletroforese é uma técnica amplamente empregada em biologia molecular para separar macromoléculas biológicas de acordo com suas propriedades. A propriedade necessária para que uma molécula seja analisada por eletroforese é
Você acertou!
E. 
Ter carga líquida diferente de zero.
Ter carga líquida diferente de zero. A carga líquida é a propriedade responsável por fazer com que as moléculas migrem quando submetidas em um campo elétrico na eletroforese. Com carga nula, as moléculas são incapazes de migrar e não podem ser separadas das demais moléculas em função de suas propriedades de carga, tamanho e forma.
2. 
Os sistemas de eletroforese têm como um de seus componentes uma matriz de migração, que de forma geral é representada por um gel. Esse componente está relacionado às funções:
I. Minimizar a difusão de moléculas durante a migração.
II. Fornecer um ambiente que ofereça resistência friccional à migração das moléculas.
​​​​​​​III. Originar a diferença de potencial elétrico que impulsiona a migração das moléculas.
Quais das alternativas são verdadeiras?
Você acertou!
B. 
I e II
A matriz de migração oferece resistência fricional à movimentação das moléculas durante a migração, permitindo que elas sejam separadas por seu tamanho e forma. Matrizes estacionárias como géis também minimizam a difusão de moléculas durante a migração, aumentando a resolução da técnica. O potencial elétrico que impulsiona o movimento das partículas carregadas está relacionado à presença de um campo elétrico, gerado a partir de eletrodos nas extremidades da matriz.
3. 
Mobilidade eletroforética é o termo que define a velocidade com que uma molécula biológica migrará em uma matriz de eletroforese dado um determinado potencial elétrico aplicado. São fatores que influenciam a mobilidade eletroforética de forma inversamente proporcional:​​​​​​​
Você acertou!
A. 
Tamanho e forma da molécula, tamanho dos poros da matriz e viscosidade do tampão.
O tamanho e a forma da molécula, assim como o tamanho dos poros da matriz e a viscosidade do tampão influenciam na resistência friccional na eletroforese. Essa resistência, por sua vez, é a responsável por retardar a migração das moléculas na matriz e é inversamente proporcional à mobilidade eletroforética, conforme a fórmula μ=q/f (onde μ é a mobilidade eletroforética, q é a carga líquida da molécula e f é a resistência friccional). A carga líquida é, assim, diretamente proporcional à mobilidade eletroforética e a temperatura diminui a viscosidade do tampão, diminuindo a resistência friccional.
4. 
Qual característica intrínseca das moléculas de ácidos nucleicos faz com que, quando submetidas a um campo elétrico, elas tenham a sua mobilidade eletroforética afetada essencialmente por seu tamanho ou forma?​​​​​​​
Você acertou!
C. 
A carga dos ácidos nucleicos é regular ao longo das moléculas, fornecida pela carga líquida negativa dos grupos fosfato.
A carga elétrica negativa fornecida pelos grupos fosfato presentes nos nucleotídeos dos ácidos nucleicos fornece uma carga líquida intrínsecae regular ao longo das moléculas de DNA e RNA. Assim, as moléculas irão diferir em função do seu comprimento (tamanho molecular) e da sua forma (características topológicas), sem a necessidade de um fator como o SDS para fornecer carga regular às moléculas. Caso a carga fosse nula, as moléculas não se moveriam no campo elétrico. Caso ela fosse irregular, as moléculas poderiam ser separadas também em função da sua carga.
5. 
Os ácidos nucleicos podem ser separados por eletroforese em gel de poliacrilamida ou em gel de agarose. Cada uma dessas estratégias oferece vantagens e desvantagens e é ideal para a separação de fragmentos em determinadas faixas de tamanho. Assinale a afirmativa correta a respeito dessas estratégias:
Você acertou!
B. 
A eletroforese em gel de agarose oferece menor poder de resolução para fragmentos pequenos, mas seus poros são grandes o suficiente para a separação de fragmentos com mais de 500 pb.
A eletroforese em poliacrilamida não permite a separação de fragmentos com mais de 500pb, mas tem alto poder de resolução – podendo diferenciar moléculas de apenas 1 pb de diferença. A eletroforese em agarose oferece poros maiores e, assim, pode ser utilizada para a separação de fragmentos mais longos. No entanto, a estratégia perde poder de resolução. Para fragmentos muito extensos (como frações de cromossomos), no entanto, mesmo a eletroforese convencional em agarose não é eficiente, necessitando a aplicação de campo elétrico pulsado.
Unidade3-