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Técnicas de Diagnóstico Genético Genética Humana Prof. Gustavo Moraes Holanda Extração de DNA/RNA • Lise celular: quebra da célula para acessar o DNA; • Remoção de lipídios. Remoção ou separação da membrana lipídica e restos celulares; • Desproteinação do extrato celular; • Remoção do DNA/RNA; • Precipitação/agregação/eluição de DNA/RNA. Extração de DNA/RNA • Detergente: solubilização de membranas; • Sal: dissociação de proteínas; • Solução tampão: estabilização de pH; • Inativador de RNAses/DNAses: proteção do DNA genômico e RNA; • Álcool: precipitação de DNA/RNA. Enzimas de restrição tipo I Construção de moléculas de DNA recombinante Construção de moléculas de DNA recombinante Construção de moléculas de DNA recombinante Clonagem gênica em vetores bacterianos • Óperon lac: ativado na ausência de glicose e presença de lactose; • Bactérias azuis: não houve inserção = degradam lactose; • Colônias brancas: houve inserção = não degradam lactose; • Permite seleção das colônias de interesse. O que é a PCR? • Reação de cadeira da Polimerase (PCR) • Amplificação de um segmento específico de DNA dentro de um genoma (gene ou parte dele, regiões não codificantes, genes de rRNA, etc); • “Xerox” molecular; • Imita o processo in vivo de replicação PCR Objetivo da PCR Amplificar uma sequência específica de DNA, como objetivo de torná-la abundante e disponível para diversas técnicas de biologia molecular. Alvos da PCR Os alvos a serem considerados no PCR são as regiões que flanqueiam a sequência específica de DNA a ser amplificada, a qual pode ser um gene inteiro ou somente uma região pequena. TTAAGGCTCGA . . . . AATTGGTTAA O . . . . Representa o meio da sequência de DNA, e não há problemas em não conhecê-la para poder amplificá-la. PCR: variação de temperatura Ciclos de temperatura 1. Separação das fitas de DNA; ▪ Inicial: 4 min/94 °C 2. Ligação dos primers; ▪ 60 – 90 s 3. Extensão da cadeia de DNA ▪ 1 a 2 min / 72 °C ▪ Varia conforme o tamanho Introdução à eletroforese • ELETROFORESE: migração de moléculas ionizadas acordo com suas cargas elétricas e pesos moleculares em campo elétrico constante. • A migração das partículas depende do seu tamanho e carga, além da DDP a que foram submetidas Introdução à eletroforese Técnica de separação de partículas de DNA, RNA ou proteínas, através da aplicação de uma diferença de potencial (corrente elétrica) as partículas são separadas de acordo com o tamanho (massa) Eletroforese • DNA: carga negativa ▪ Tem tendência a se dirigir ao polo positivo quando sujeito a um campo elétrico • Serve para separar moléculas por tamanho/carga elétrica ▪ Proteína deve ser desnaturada com detergente (SDS) • Técnica utilizada à exaustão em trabalhos de biologia molecular PCR e eletroforese • Eletroforese em gel de agarose; • Diagnóstico molecular; ▪ Patógenos e alterações genéticas; • Testes de identificação humana; • Genotipagem e sequenciamento Sequenciamentopelométodode Sanger Frederick Sanger 13 Aug 1918 – 19 Nov2013 • Prêmio Nobel de Química em 1958 e 1980 • Publicou o método de sequenciamento em 1977 Sequenciamento por Sanger Sequenciamento de Sanger Plataformas de sequenciamento • Roche: 454 • Life technology: SOLiD / Ion Torrent • Illumina: Genome Analyzer / Hiseq/ Miseq/ Miniseq • Pacific Biosciences: PacBio • Oxford: Nanopore Análise de NGS Galaxy Project – Análise de NGS Resultados • Leitura do Artigo “Aconselhamento genético” (PINA-NETO, 2008), disponível em: • https://www.scielo.br/scielo.php?pid=S0021- 75572008000500004&script=sci_arttext • Assistir o vídeo “What Is Genetic Counseling?” disponível em: • https://www.youtube.com/watch?v=7yIW0L9dLCQ Conteúdo do AVA
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