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UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ CENTRO DE CIÊNCIAS DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR INTRODUÇÃO À BIOQUÍMICA Lista de exercícios 1. O que são nucleotídios e nucleosídios? 2. Quais são as bases nitrogenadas púricas e pirimídicas e como ocorre o seu pareamento? 3. Como são formadas as ligações fosfodiésteres? 4. Como as propriedades das bases nitrogenadas afetam a estrutura tridimensional dos ácidos nucléicos? 5. Em 1953, Watson e Crick descobriram a estrutura do DNA, e em seu modelo eles propuseram que as fitas eram antiparalelas. O que isso significa? 6. Que forças contribuem para estabilização do DNA? 7. Em relação ao processo de replicação do DNA, por que ele é considerado semi- conservativo? 8. Descreva como se dá a iniciação da replicação em Escherichia coli. 9. Discuta as propriedades das topoisomerases. 10. Qual a principal função das helicases? 11. Se as duas fitas do DNA são complementares, como que elas se mantêm separadas no início da replicação? 12. Compare o papel das atividades exonucleásicas 5’3’ e 3’5’ da DNA polimerase I no metabolismo do DNA. 13. Que propriedades da DNA polimerase III fazem dela uma enzima mais apropriada do que a DNA polimerase I para executar as reações de alongamento durante a replicação do DNA? 14. Na replicação do DNA em procariontes, como se dá a replicação da fita descontínua? 15. De que forma a DNA ligase exerce sua função na replicação do DNA? 16. Como acontece o término da replicação em procariotos? 17. Em que os processos de replicação e transcrição se assemelham e em que eles se diferenciam? 18. O que são promotores? Qual o seu papel na transcrição? 19. Cite as características mais marcantes dos promotores de E. coli. 20. Estruturalmente, como é constituída a RNA polimerase de E. coli? 21. Qual a função da subunidade sigma da RNA polimerase em E. coli? 22. Descreva as etapas envolvidas na iniciação da transcrição em E. coli. 23. Que eventos representam a etapa de elongação da transcrição em E. coli? 24. Como a transcrição em E. coli é finalizada? 25. Descreva o processamento do RNA mensageiro em eucariontes. 26. Explique o que são cap-5’ e cauda poli-A, além de suas funções, no processamento do RNAm. 27. Porque a remoção dos introns e a união dos exons nos transcritos primários precisa ser um processo acurado? 28. Quais as principais características do código genético? 29. O que você entende por pareamento oscilante da terceira base de um códon? 30. Discuta o papel das aminoacil-tRNA sintetases na síntese de proteínas. 31. Como se dá a formação do fMet-tRNAfMet? 32. Qual o papel da seqüência de Shine-Delgarno na síntese de proteínas em procariontes? 33. Na etapa de iniciação participam mRNA, N-formilmetionina-tRNA, códon de iniciação (AUG), ribossomos (subunidades 30S e 50S), fatores de iniciação IF-1, IF- 2 e IF-3, GTP e Mg+2. Explique como cada um dos componentes citados participam da referida etapa. 34. Como é formada a ligação peptídica na etapa do alongamento? 35. Explique porque, quando um dos códons de terminação (UAA, UAG e UGA) ocupa o sítio ribossômico, a síntese de proteínas é terminada? 36. O que são polissomos? São encontrados em que tipo celular?
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