Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
Fosforilação proteica diferencial durante a infecção por Salmonella spp. em Gallus gallus Universidade Federal do Rio Grande do Sul Métodos Moleculares aplicados à Biocomplexidade - BIO12034 Camila Delaix, Laura Boose e Laura Hoefel Orientador: Prof. Henrique B. Ferreira 2022/1 TÓPICOS DO TRABALHO 1. INTRODUÇÃO INTRODUÇÃO Zoonoses Salmonella spp. Ovos contaminados Carne de galinha contaminada Diferentes sorovares geram diferentes quadros infecciosos Gastroenterite Febre tifoide INTRODUÇÃO Gênero: Salmonella Espécie: Salmonella enterica Subespécie: Salmonella enterica enterica Typhimurium EnteritidisSorovares estudadas: Existem importantes diferenças no aspecto virulento e patogênico em cada sorovar estudada INTRODUÇÃO Galinhas assintomáticas A bactéria se torna capaz de persistir no intestino, transmitindo o patógeno para todo o ambiente aviário devido às excreções contaminadas A principal problemática nessa situação é: INTRODUÇÃO Incidência de Salmonelose em humanos Controle da infecção na criação de aves para produção de alimentos Entender os mecanismos pelas quais a infecção ocorre Estratégias para identificação e combate da Salmonella em galinhas Entender e avaliar a expressão de biomoléculas após a infecção INTRODUÇÃO O que foi descrito na literatura a respeito dessa problemática até então? Shi et al (2009) Primeira análise proteômica feita em macrófagos infectados por S. typhimurium. Cerca de 244 proteínas acabam tendo sua expressão gênica diferenciada após a infecção pela bactéria. Qi et al (2017) Estudo em células epiteliais infectadas por Salmonella. Cerca de 194 proteínas foram diferencialmente reguladas, com uma alta expressão de integrinas e de componentes da via glicolítica INTRODUÇÃO Entender a interação patógeno-hospedeiro Perfil de modificações pós-traducionais Fosforilações GlicosilaçõesAcetilações Ubiquitinações Mudanças nas atividades de proteínas Adaptação do patógeno ao microambiente INTRODUÇÃO Salmonella typhimurium em células HeLa Interfere nas vias de fosforilação do hospedeiro Regulação positiva de genes da via apoptótica, de transporte transmembrana, organização nuclear e proliferação celular Inflamação intestinal Proliferação da bactéria Fonte: Rogers et al (2011) TÓPICOS DO TRABALHO 1. INTRODUÇÃO 2. JUSTIFICATIVA E HIPÓTESE JUSTIFICATIVA E HIPÓTESE Salmonella spp. Saúde animal Saúde humana Impacto na exportação de carne aviária 15% do total de doenças transmitidas por água e alimentos Perda da produtividade no cenário avicultor Porque estudar a Salmonella? Em 2017, um relatório do Sistema Rápido de Alerta para Comida e Alimentação da Comissão Europeia (RASFF) colocou o Brasil no top 1 com 320 rechaços para carne de frango com Salmonella JUSTIFICATIVA E HIPÓTESE Explorar as proteínas diferencialmente fosforiladas durante a infecção por Salmonella spp. podem gerar achados importantes, como o descobrimento de novos mecanismos biológicos responsáveis pela infecção em galinhas. Hipótese: TÓPICOS DO TRABALHO 1. INTRODUÇÃO 2. JUSTIFICATIVA E HIPÓTESE 3. OBJETIVOS OBJETIVOS OBJETIVOS ESPECÍFICOS ● Caracterizar o perfil proteômico das amostras infectadas e das amostras controle; ● Identificar diferenças no perfil de fosforilação entre as sorovares; ● Identificar quais proteínas das amostras contaminadas possuem o padrão de fosforilação distinto das condições controle; ● Prever o papel biológico dessas proteínas por análise bioinformática; OBJETIVO GERAL Identificar proteínas diferencialmente fosforiladas durante infecção por Salmonella spp. em Gallus gallus nos aviários de Porto Alegre. TÓPICOS DO TRABALHO 1. INTRODUÇÃO 2. JUSTIFICATIVA E HIPÓTESE 3. OBJETIVOS 4. MATERIAIS E MÉTODOS MATERIAIS E MÉTODOS ● Amostras fecais de galinhas naturalmente infectadas e controles não infectados ● 2 aviários certificados de Porto Alegre ● Amostras de dois tipos de Sorovares de Salmonella: Enteritidis e Typhimurium ● Genotipagem dos sorovares em parceria com grupo de pesquisa brasileiro ● As amostras serão preparadas segundo protocolos prévios para extração proteica de amostras fecais Coleta e preparo das amostras MATERIAIS E MÉTODOS ● Pool de amostras de cada sorovar ● Eletroforese bidimensional: Isoeletrofocalização e SDS-PAGE Pro-Q™ Diamond Phosphoprotein Gel Stain Eletroforese bidimensional com marcação de fluorescência ● Marcação de proteínas totais com CBB e de fosfoproteínas com Pro-Q™ Diamond Phosphoprotein Gel Stain → Comparação dos spots MATERIAIS E MÉTODOS ● Identificação dos spots de proteínas diferencialmente fosforiladas entre amostras controle e infectadas. spot Espectrometria de massas (MALDI-TOF) MATERIAIS E MÉTODOS ● As proteínas identificadas serão analisadas pelo seu enriquecimento funcional com o software GO enrichment analysis → caracterização do seu possível papel biológico relacionado à infecção Análise de dados ● STRING: análises de redes de interação WORKFLOW 6 galinhas contaminadas com sorovar X 6 galinhas contaminadas com sorovar Y 6 galinhas controle Extração das proteínas a partir de amostras fecais Eletroforese bidimensional com fluorescência Espectrometria de massas Perfil proteico amostras controle x perfil proteico amostra Salmonella Perfil proteico amostras controle com marcação x perfil protéico amostras Salmonella com marcação TÓPICOS DO TRABALHO 1. INTRODUÇÃO 2. JUSTIFICATIVA E HIPÓTESE 3. OBJETIVOS 4. MATERIAIS E MÉTODOS 5. RESULTADOS ESPERADOS RESULTADOS ESPERADOS ● Identificar diferenças no perfil proteico de amostras controle e infectadas; ● Identificar proteínas com fosforilação diferencial entre amostras controle e infectadas; ● Identificar diferenças no perfil de fosforilação entre as sorovares; ● Através da predição in silico, conseguir identificar enriquecimento de vias de sinalização e interações proteicas presentes durante a infecção de diferentes sorovares de Salmonella; ● Caracterizar mecanismos biológicos responsáveis pela salmonelose nos aviários de Porto Alegre; ● Entender os impactos que a fosforilação diferencial pode ter durante a infecção de galinhas e como isso pode afetar a saúde animal. TÓPICOS DO TRABALHO 1. INTRODUÇÃO 2. JUSTIFICATIVA E HIPÓTESE 3. OBJETIVOS 4. MATERIAIS E MÉTODOS 5. RESULTADOS ESPERADOS 6. CRONOGRAMA DE EXECUÇÃO CRONOGRAMA DE EXECUÇÃO Obrigada! popó
Compartilhar