Bioinformática Estácio

Prévia do material em texto

1a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	A informação da sequência completa de aminoácidos de uma proteína purificada de um organismo eucarioto seria suficiente para se deduzir a sequência exata de bases dos códons presentes RNAm que foi traduzido durante a síntese dessa proteína?
		
	
	Sim, já que o código genético é universal e os códons já foram todos decifrados.
	
	Não, pois o mRNA dos organismos eucariotos passa por modificações pós transcricionais com a retirada dos éxons.
	 
	Não, pois o código genético é degenerado.
	
	Sim, pois o código genético além de universal e pode sofrer oscilações.
	
	Sim, pois o RNA traduzido já havia passado pelo processo de splicing e estava maduro quando foi traduzido.
	Respondido em 10/11/2022 09:47:17
	
	Explicação:
Não, pois durante a tradução a cada 1 códon (3 bases de nucleotídeos) temos a inserção de um aminoácido à cadeia de polipeptídio que está sendo sintetizada. No entanto, o código genético é degenerado, ou seja, um aminoácido é representado por diferentes códons. Assim, ficaria difícil a partir de uma proteína descobrir os códons existentes no RNAm. O código genético é dito universal, pois os códons têm o mesmo significado em quase todos os organismos. Oscilações é a tolerância para sofrer alterações na terceira base nitrogenada sem alterar o códon garantindo assim que ele seja degenerado. O splicing com a retirada dos íntrons acontece na transcrição e não na tradução, não estando assim relacionada com o enunciado da questão.
	
		2a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	As proteínas são biomoléculas construídas a partir de ligações peptídicas formadas no ribossomo, com a sua sequência dada pela ordem dos códons de RNAm, que foram transcritos do DNA. A forma que as proteínas se consolidam depende dos resíduos de aminoácidos que as compõem. Dentre os aminoácidos existem quatro classes: com carga (positivo ou negativo), polares (sem carga), apolares e os casos especiais (que se comportam de forma única). Sobre esse assunto analise as afirmativas a seguir:
I. Os aminoácidos são classificados em dois grandes grupos, são eles polares ou apolares.
II. O conjunto total das interações entre os resíduos forma a conformação final da proteína (basicamente a forma tridimensional que ela assume) e esta é fundamental para sua função.
III. A interação entre os aminoácidos ligações de hidrogênio formando α-hélices ou dobrando sua estrutura.
 É correto o que se afirma em:
		
	
	I, apenas.
	
	I e III, apenas.
	
	I e II, apenas.
	
	II, apenas.
	 
	II e III, apenas.
	Respondido em 10/11/2022 09:48:46
	
	Explicação:
Existem quatro classes que os aminoácidos podem se incluir são eles: com carga polares (positivo ou negativo), polares sem carga, apolares e os casos especiais (que se comportam de forma única). Dependendo da carga dos aminoácidos que compõem uma sequência de peptídeos pode ocorrer uma interação do tipo ligação de hidrogênio e assim formar uma α-hélice ou dobrar a sua estrutura, ou uma repulsão. Essas interações podem irão fornecer a estrutura de cada proteína. Cada conformação tridimensional é de extrema importância para o funcionamento da proteína, pois irá possibilitar interação com enzimas, cofatores, funcionar como um canal para a passagem seletiva de alguma substância, entre outras funções.
	
		3a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	A determinação da estrutura do Ácido Desoxirribonucléico foi um marco importante para a Biologia, esclarecendo como a informação hereditária é codificada em sequências de nucleotídeos de DNA nas células. A respeito desse tema, analise as alternativas a seguir:
I. Os genes humanos são de grande tamanho e são constituídos de segmentos relativamente curtos de DNA, que codificam proteínas (íntrons), intercalados com longos segmentos de DNA não codificantes (éxons).
II. As sequências de íntrons são transcritas em RNAm enquanto as sequências de éxons são removidas por meio de um processo conhecido como splicing.
III. O dogma central da biologia nos mostra o fluxo de informações que vai do DNA até a formação de uma unidade proteica, na ordem DNA > transcrição > RNAm > tradução > proteína
IV. Eucromatina é o nome dado ao padrão de cromatina desenovelado do DNA.
É correto o que se afirma em:
		
	
	II e IV.
	
	II e III.
	
	I e III.
	 
	III e IV.
	
	I e II.
	Respondido em 10/11/2022 09:49:29
	
	Explicação:
As sequências de éxons são transcritas em RNAm enquanto as sequências de íntrons são removidas por meio de um processo conhecido como splicing de RNA. Os genes humanos são de grande tamanho e são constituídos de segmentos relativamente curtos de DNA. Durante a regulação de quais genes irão ser transcritos, temos a formação de regiões mais condensadas, que não são transcritos a heterocromatina e regiões com padrão de cromatina desenovelado que o DNA assume quando está aberto para a chegada da maquinaria de expressão ou replicação. O padrão desnovelado recebe o nome de eucromatina.
	
		4a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Julgue as afirmativas a seguir sobre a ferramenta BLAST, usada para alinhamento de sequências e disponível no portal do NCBI.
I. Muito usada para sequências com apenas alguns trechos/locais conservados.
II. Importante utilizá-la quando duas sequências têm tamanhos próximos, pois toda extensão da sequência será comparada.
III. O alinhamento é feito par a par, comparando apenas duas sequências por vez.
IV. Usada para busca em banco de dados de sequências.
É correto o que se afirma em:
		
	
	II, III e IV.
	 
	I, III e IV.
	
	II e IV.
	
	II e III.
	
	I e II.
	Respondido em 10/11/2022 09:50:01
	
	Explicação:
O BLAST é uma ferramenta utilizada para o alinhamento de sequências simples (duas sequências) e local (comparadas regiões de maior similaridade). É indicado para sequências mais divergentes e com tamanhos distintos. O BLAST é aplicado em vários bancos de dados de sequência de nucleotídeos ou aminoácidos como uma ferramenta de busca.
	
		5a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Muitos programas de computador já foram e vêm sendo desenvolvidos para auxiliar no desenho de primers usados na PCR (Reação em Cadeia de Polimerase). Dentre eles, podemos citar o Primer3, que pode ser usado de forma on-line por qualquer pessoa. Qual das opções abaixo contém uma informação essencial que o usuário precisa fornecer obrigatoriamente, para que um programa consiga desenhar primers?
		
	
	Tamanho do produto amplificado.
	
	Temperatura de anelamento.
	
	Temperatura de melting.
	 
	Sequência de nucleotídeos do alvo no DNA.
	
	Conteúdo GC.
	Respondido em 10/11/2022 09:50:36
	
	Explicação:
Os primers são uma sequência de nucleotídeos que é complementar à sequência molde, que queremos amplificar. Essas sequências moldes podem ser obtidas em bancos de dados biológicos de sequências de nucleotídeos, como GenBank e RefSeq, disponíveis no portal no NCBI. Nos programas utilizados para desenhar esses oligonucleotídeos, é impossível desenhar uma sequência complementar de primers sem ter essa sequência.  As outras alternativas da questão são todos parâmetros para o desenho de primers, mas o usuário não precisa alterar as configurações do programa, só se ele achar necessário.
	
		6a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Aline é biomédica e trabalha em um laboratório para diagnóstico de doenças genéticas. Um dos genes mais pesquisados é o brca1, que quando sofre mutações específicas está associado ao risco aumentado de câncer. Para identificar as mutações, é necessário comparar a sequência obtida do paciente com uma sequência referência não mutada. Qual banco de dados, disponível no NCBI, Aline pode consultar para conseguir uma sequência referência curada para o gene brca1?
		
	
	PubMed.
	
	GenBank.
	 
	RefSeq.
	
	BLAST.
	
	KEGG.
	Respondido em 10/11/2022 09:51:15
	
	Explicação:
O RefSeq é um banco de dados de sequências de nucleotídeos de referência, curado por funcionários do NCBI, que éo banco que a biomédica deveria usar para conseguir comparar a sequência obtida do paciente com uma sequência referência não mutada de forma curada. O GenBank também é um banco de dados de sequências de nucleotídeos, mas ele não é curado. O PubMed é banco de dados de textos biomédicos. O KEGG é um banco de dados de vias metabólicas, principalmente. Já o BLAST não é um banco de dados, e sim uma ferramenta para alinhamento de sequências.
	
		7a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	(Adaptado de UFCE - 2015 - Engenheiro - Área Engenharia de Pesca)
A transcritômica ou transcriptômica é a ciência que estuda o transcritoma produzido por determinada célula, tecido ou organismo. Sobre esse tema, é correto afirmar que:
		
	
	Apesar de sua aplicação em diversos campos da biologia, a transcriptômica não pode ser pesquisada a partir de técnicas de alto desempenho e sequenciamento de nova geração (NGS).
	
	Independente de estágio de desenvolvimento, o transcriptoma é o mesmo.
	
	A transcriptômica estuda o conjunto de proteínas.
	
	O transcriptoma é o mesmo em todos tecidos e órgãos.
	 
	Podem haver vários transcriptomas em um único organismo.
	Respondido em 10/11/2022 09:51:56
	
	Explicação:
O transcriptoma estuda o conjunto de RNAs, que varia de acordo com a condição a qual a célula está exposta, portanto, se estudar diferentes tipos de células o transcriptoma será distinto. Além disso, o transcriptoma depende do estágio de desenvolvimento e em cada indivíduo pode haver vários transcriptomas. O transcriptoma pode ser estudado pelo sequenciamento de nova geração, realizando a pré-etapa de síntese do DNA complementar.
	
		8a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	A química de produtos naturais tem empregado novas metodologias com o objetivo de acelerar a descoberta e o isolamento de novos compostos que são originários das plantas e que podem ser empregados com fins terapêuticos. Entre eles, técnicas de separação associadas às espectrométricas de alto desempenho, assim analisando o extrato bruto de uma planta, ou seja, sem prévio isolamento de um composto único, uma vez que esses estudos são realizados para a obtenção das informações qualitativas e quantitativas acerca da maior quantidade possível de tipos diferentes de constituintes de cada amostra. Esse tipo de estudo emprega qual abordagem ômica?
		
	
	Transcriptômica.
	
	Genômica.
	
	Lipdômica.
	
	Proteômica.
	 
	Metabolômica.
	Respondido em 10/11/2022 10:01:08
	
	Explicação:
O enunciado aponta que as análises são voltadas para a maior quantidade possível de constituintes da amostra e para o isolamento de novos compostos que são originários das plantas e que podem ser empregados com fins terapêuticos, ou seja, produtos (metabólitos) derivados do metabolismo. Além disso, cita a espectrometria como metodologia, uma das técnicas empregadas nesse tipo de estudo ômico. As demais abordagens apontadas nas opções são focadas em um determinado tipo de molécula biológica.
	
		9a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Durante uma análise cadeia Markoviana Monte Carlo (MCMC), o que determina quando uma cadeia se move da árvore atual para uma nova árvore?
		
	
	A cadeia Markoviana aceitará uma proposta com uma probabilidade que é fixada no início da pesquisa.
	 
	A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior maior do que o estado atual.
	
	A probabilidade de aceitar uma proposta depende da razão entre as probabilidades posteriores entre o estado atual e proposto.
	
	A cadeia rejeitará uma proposta que produza uma probabilidade de log maior do que o estado atual.
	
	A cadeia Markoviana sempre aceitará uma proposta que seja consistente com a anterior.
	Respondido em 10/11/2022 09:55:30
	
	Explicação:
Gabarito: A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior maior do que o estado atual.
Justificativa: Uma geração MCMC sempre aceita o novo estado se a probabilidade, ou log, for maior que o estado atual. A geração MCMC não é calculada por uma razão, nem possui uma probabilidade fixada de início. Na cadeia Markoviana, o novo estado é sempre aceito quando possui melhor probabilidade. As vezes a cadeia Markoviana Monte Carlo pode aceitar um ponto pior do que o anterior. Isso ocorre raramente.
	
		10a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	A seguir são apresentadas diferentes árvores filogenéticas (de A ao E).
Imagem: Leandro Pederneiras
Após analisar a figura, assinale a alternativa que retrata de forma correta a interpretação dos gráficos.
		
	
	No tipo de apresentação do gráfico c a raiz é identificada através do clado com maior número de ramos emergindo.
	
	No gráfico b, ramos mais longos significam mais longo tempo decorrido em relação aos ramos curtos.
	 
	No gráfico e, podemos dizer que o ponto indicado pela seta laranja é pelo menos duas vezes mais antigo que o ponto indicado pela seta azul.
	
	Os ramos curvos das divergências do gráfico a significam a idade evolutiva retrocedendo para a raiz.
	
	Os dois pontos indicados pelas setas na figura d, apesar de separados, possuem idades ancestrais idênticas. Podemos interpretar dessa forma porque os pontos estão na mesma altura no gráfico.
	Respondido em 10/11/2022 09:56:27
	
	Explicação:
Gabarito: No gráfico e, podemos dizer que o ponto indicado pela seta laranja é pelo menos duas vezes mais antigo que o ponto indicado pela seta azul.
Justificativa: No gráfico E, podemos dizer que o ponto indicado pela seta laranja na alternativa E é pelo menos duas vezes mais antigo que o ponto indicado pela seta azul porque, ao analisar a escala de tempo, logo abaixo do gráfico, nota-se a seta azul em torno de 50 milhões de anos (Ma) e a seta laranja em torno de 100 Ma. No gráfico A, uma árvore filogenética em formato circular apresentam comprimento ramos iguais, sem escala de tempo. No gráfico B, os comprimentos mais longos dos ramos indicam um maior número de mudança evolutiva. O gráfico C é um tipo de gráfico não enraizado, ou seja, aquele que somente nos mostra as relações entre espécies e suas aproximações, mas sem a raiz o que indica na árvore um ancestral comum. O Gráfico D apenas representa a relação entre as espécies, sem escala de tempo, então não podemos avaliar se os dois ancestrais apresentam a mesma idade evolutiva.