Simulado Bioinformática

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Disc.: BIOINFORMÁTICA   
	Aluno(a): KELLY REIS
	202107200031
	Acertos: 9,0 de 10,0
	16/10/2022
		1a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	A informação da sequência completa de aminoácidos de uma proteína purificada de um organismo eucarioto seria suficiente para se deduzir a sequência exata de bases dos códons presentes RNAm que foi traduzido durante a síntese dessa proteína?
		
	 
	Não, pois o código genético é degenerado.
	
	Não, pois o mRNA dos organismos eucariotos passa por modificações pós transcricionais com a retirada dos éxons.
	
	Sim, pois o RNA traduzido já havia passado pelo processo de splicing e estava maduro quando foi traduzido.
	
	Sim, pois o código genético além de universal e pode sofrer oscilações.
	
	Sim, já que o código genético é universal e os códons já foram todos decifrados.
	Respondido em 16/10/2022 16:02:04
	
	Explicação:
Não, pois durante a tradução a cada 1 códon (3 bases de nucleotídeos) temos a inserção de um aminoácido à cadeia de polipeptídio que está sendo sintetizada. No entanto, o código genético é degenerado, ou seja, um aminoácido é representado por diferentes códons. Assim, ficaria difícil a partir de uma proteína descobrir os códons existentes no RNAm. O código genético é dito universal, pois os códons têm o mesmo significado em quase todos os organismos. Oscilações é a tolerância para sofrer alterações na terceira base nitrogenada sem alterar o códon garantindo assim que ele seja degenerado. O splicing com a retirada dos íntrons acontece na transcrição e não na tradução, não estando assim relacionada com o enunciado da questão.
	
		2a
          Questão
	Acerto: 0,0  / 1,0
	
	Nos organismos __________ a expressão de um determinado gene é dependente do quão enovelado o DNA está, as ___________ regulam essa compactação. A reação de _________ ocorre o maior enovelamento, já a reação de ____________ faz com que o DNA fique mais relaxado, possibilitando sua expressão. 
		
	
	 procariotos / polimerase /acetilação / metilação
	 
	 eucariotos / histona / metilação / acetilação
	
	procariotos / histona / metilação /acetilação
	 
	eucariotos / polimerases / acetilação / metilação
	
	procariotos / polimerase / metilação / acetilação
	Respondido em 16/10/2022 16:03:30
	
	Explicação:
Nos organismos eucariotos a expressão de um determinado gene é dependente do quão enovelado o DNA está, as histonas regulam essa compactação. A reação de metilação ocorre o maior enovelamento, já a reação de acetilação faz com que o DNA fique mais relaxado, possibilitando sua expressão. Os organismos procariotos apresentam outro tipo de regulação, como a presença do operon lac. As polimerases são enzimas responsáveis enzima que catalisa a reação de polimerização de ácidos nucleicos a partir dos seus monômeros.
	
		3a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	A determinação da estrutura do Ácido Desoxirribonucléico foi um marco importante para a Biologia, esclarecendo como a informação hereditária é codificada em sequências de nucleotídeos de DNA nas células. A respeito desse tema, analise as alternativas a seguir:
I. Os genes humanos são de grande tamanho e são constituídos de segmentos relativamente curtos de DNA, que codificam proteínas (íntrons), intercalados com longos segmentos de DNA não codificantes (éxons).
II. As sequências de íntrons são transcritas em RNAm enquanto as sequências de éxons são removidas por meio de um processo conhecido como splicing.
III. O dogma central da biologia nos mostra o fluxo de informações que vai do DNA até a formação de uma unidade proteica, na ordem DNA > transcrição > RNAm > tradução > proteína
IV. Eucromatina é o nome dado ao padrão de cromatina desenovelado do DNA.
É correto o que se afirma em:
		
	
	II e III.
	
	I e III.
	 
	III e IV.
	
	II e IV.
	
	I e II.
	Respondido em 16/10/2022 16:05:40
	
	Explicação:
As sequências de éxons são transcritas em RNAm enquanto as sequências de íntrons são removidas por meio de um processo conhecido como splicing de RNA. Os genes humanos são de grande tamanho e são constituídos de segmentos relativamente curtos de DNA. Durante a regulação de quais genes irão ser transcritos, temos a formação de regiões mais condensadas, que não são transcritos a heterocromatina e regiões com padrão de cromatina desenovelado que o DNA assume quando está aberto para a chegada da maquinaria de expressão ou replicação. O padrão desnovelado recebe o nome de eucromatina.
	
		4a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Em uma análise utilizando a PCR, Lucas encontrou como resultado a amplificação de várias regiões diferentes do DNA das amostras analisadas. O que ele esperava era encontrar apenas uma região amplificada, somente nas amostras positivas. Para solucionar o problema, seu chefe sugeriu, então, que ele desenhasse um novo par de primers e prestasse atenção no comprimento em nucleotídeos, para melhorar a especificidade. Você diria para Lucas desenhar um novo par de primers com um comprimento maior ou menor que o par de primers que ele havia usado primeiro?
		
	
	Igual, pois o comprimento não interfere na especificidade dos primers.
	
	Menor, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma.
	
	Maior, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma.
	 
	Maior, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo.
	
	Menor, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo.
	Respondido em 16/10/2022 16:07:00
	
	Explicação:
A especificidade de um primer garante que a região copiada seja realmente a que você deseja, e não outra qualquer. No caso exposto, houve amplificação de várias sequências não desejadas e, para melhorar a especificidade, faz-se necessário aumentar o número de nucleotídeos, pois quanto maior o comprimento de um primer, mais específico ele é. Sequências pequenas de primers podem ocorrer aleatoriamente ao longo do DNA, e não somente na região de interesse. Quando você usa mais nucleotídeos, você específica melhor o alvo e permite que ele seja amplificado apenas na região desejada.
	
		5a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	O PubMed é um dos bancos de dados disponíveis no portal do NCBI. A partir dele, podemos buscar por artigos científicos da área biomédica publicados por cientistas em todo o mundo. Caso você queira direcionar a sua busca para obter artigos mais adequados ao seu interesse, o que poderia ser feito?
		
	
	Pagar uma assinatura mensal ao PubMed para que ele direcione automaticamente suas buscas de acordo com os critérios que você deseja.
	
	Cadastrar seus dados profissionais e receber uma autorização para acessar a parte restrita do PubMed que permite buscas avançadas.
	 
	Utilizar os filtros de busca, que incluem ano e tipo de artigo, por exemplo, ou, ainda, optar pela busca avançada.
	
	Não existe a possibilidade de direcionar a busca, é necessário avaliar todos os títulos que aparecem como resultado para escolher aqueles mais adequados.
	
	Acessar o PubMed por meio de rede de Internet de instituição pública, como universidades ou bibliotecas. Só assim é possível direcionar a busca por artigos.
	Respondido em 16/10/2022 16:08:00
	
	Explicação:
Qualquer usuário pode acessar ao PubMed, via NCBI, e fazer buscas direcionadas usando filtro ou o modo avançado. Pode acontecer de alguns dos artigos que aparecem como resultados não estejam disponíveis para leitura de todo o conteúdo, mas isso depende da revista em que o artigo foi publicado, e não do PubMed.
	
		6a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Julgue as afirmativas a seguir sobre a ferramenta BLAST, usada para alinhamento de sequências e disponível no portal do NCBI.
I. Muito usada para sequências com apenas alguns trechos/locais conservados.
II. Importante utilizá-la quando duas sequências têm tamanhos próximos, pois toda extensão da sequência será comparada.
III. O alinhamento é feito par a par, comparandoapenas duas sequências por vez.
IV. Usada para busca em banco de dados de sequências.
É correto o que se afirma em:
		
	 
	I, III e IV.
	
	II e III.
	
	II e IV.
	
	I e II.
	
	II, III e IV.
	Respondido em 16/10/2022 16:09:59
	
	Explicação:
O BLAST é uma ferramenta utilizada para o alinhamento de sequências simples (duas sequências) e local (comparadas regiões de maior similaridade). É indicado para sequências mais divergentes e com tamanhos distintos. O BLAST é aplicado em vários bancos de dados de sequência de nucleotídeos ou aminoácidos como uma ferramenta de busca.
	
		7a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	O aluno Pedro está começando agora uma nova iniciação científica. Sua orientadora lhe disse que ele irá trabalhar com a enzima mieloperoxidase (MOP), mas ele ainda não compreende a importância do seu projeto. Ele precisa acessar um banco de dados biológico que reúna uma grande variedade de informações sobre essa proteína, como vias metabólicas e doenças associadas a ela. Qual banco de dados você recomendaria a ele?
		
	
	GenBank.
	
	PubMed.
	
	PDB.
	
	Swiss-Prot.
	 
	KEGG.
	Respondido em 16/10/2022 16:12:19
	
	Explicação:
O KEGG é banco de dados biológico que envolve diferentes tipos de dados biológicos, possibilitando a compreensão da funcionalidade e utilidade de moléculas biológicas em nível elevado de complexidade. Os demais bancos focam em um determinado tipo de dados, como anotação de proteínas (Swiss-Prot), literatura científica (PubMed), estrutura de proteínas (PDB) ou sequências de nucleotídeos (GenBank).
	
		8a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	A sequência de Shine-Delgarno e as sequências das ¿pontas¿ dos íntrons são exemplos de sinais na sequência de DNA. Esses sinais são sequências características conservadas, que marcam as regiões necessárias para que a transcrição e tradução ocorram. Qual processo de bioinformática inclui a identificação desses sinais?
		
	
	Sequenciamento do genoma.
	 
	Predição gênica.
	
	Construção de árvore filogenética.
	
	Montagem do genoma.
	
	Extração do DNA.
	Respondido em 16/10/2022 16:12:36
	
	Explicação:
Durante a etapa de predição gênica, uma das formas de identificar a região de um gene ao longo da sequência de DNA é a busca por sinais que indiquem que aquela sequencias será transcrita e traduzida. Alguns desses sinais são diferentes entre procariotos e eucariotos, uma das razões de diferentes programas serem usados para predição gênica desses grupos de organismos. Montagem de genomas é o processo de unir pequenos fragmentos sequenciados na intensão de obter sequências maiores. Extração do DNA é o método que visa extrair o DNA da célula para futura análise, como, por exemplo, o PCR e, posteriormente, o sequenciamento de uma determinada região desse material genético, o que permite se chegar à sequência de nucleotídeos que estamos buscando. Árvores filogenéticas representam hipóteses sobre as relações evolutivas em um grupo de organismos. Uma árvore filogenética pode ser construída usando-se características morfológicas (formato do corpo), bioquímicas, comportamentais ou moleculares de espécies ou outros grupos.
	
		9a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	Para compreender o que diz uma árvore filogenética diversas terminologias e conceitos são empregados. A seguir são listados diferentes conceitos sobre a filogenia. Assinale a alternativa que retrata de forma correta um conceito das árvores filogenéticas:
		
	
	Topologia significa o táxon terminal, aqueles nomes que estão inseridos no topo da árvore filogenética.
	
	O ponto no qual o gráfico se inicia é denominado clado inferior, onde está a raiz da árvore.
	
	Quando queremos apontar um táxon duplicado dentro da árvore filogenética dizemos que existe um grupo irmão.
	 
	Podemos rodar os ramos em seu próprio eixo sem alterar as relações de parentesco, mas se cortamos e colarmos um ramo em outra parte dizemos que a topologia mudou.
	
	Terminal, num cladograma, significa um ramo com dois nós (duas divergências) nas extremidades.
	Respondido em 16/10/2022 16:16:14
	
	Explicação:
Gabarito: Podemos rodar os ramos em seu próprio eixo sem alterar as relações de parentesco, mas se cortamos e colarmos um ramo em outra parte dizemos que a topologia mudou.
Justificativa: Terminal são os táxons que foram amostrados na árvore filogenética, também podendo ser nomes de genes ou características de um conjunto de táxons. Não existe a terminologia clado inferior. Clado é um conjunto de descendentes e todos os seus ancestrais. Raiz da árvore é o ponto mais antigo no tempo, onde a árvore inicia. Topologia é o conjunto de relações entre clados e ramos numa árvore filogenética. Um cladograma só possui uma topologia que pode ser configurada de diversas maneiras, ou seja, ao rodar a árvore em seu próprio eixo não muda as relações de parentescos. No entanto, ao cortar e colarmos um ramo em outra parte da árvore, a topologia muda.
	
		10a
          Questão
	Acerto: 1,0  / 1,0
	
	A árvore filogenética é uma hipótese sobre relações evolutivas, mas para construir precisamos usar características que sejam indicadores confiáveis de ancestralidade comum. Nesse contexto utilizamos para construção das árvores as características homólogas. A seguir estão listadas algumas propriedades das características ditas homólogas. Analise a alternativa que NÃO se refere a essa característica:
		
	
	Desenvolvimento similar
	
	Ponto de origem em local similar
	 
	Linhagens diferentes com traços similares
	
	Funções similares
	
	Estrutura e composição similar
	Respondido em 16/10/2022 16:16:34
	
	Explicação:
Gabarito: Linhagens diferentes com traços similares
Justificativa: A homologia é o estudo das semelhanças entre a estrutura de diferentes organismos que apresentam. Dois caracteres são ditos homólogos quando apresentam a posição (ponto) de origem, estrutura, composição, desenvolvimento e função similares. A homologia é observada em caracteres, e não em linhagens, por isso que diferentes linhagens com traços similares não podem ser classificadas como homólogas.