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Propriedades gerais dos vírus Há quanto tempo os vírus existem entre nós ? Referências históricas Conceito de microrganismos • Leeuwenhoek (1632‐1723) • Pasteur (1822‐1895) • Koch (1843-1910) 1668 A van Leeuwenhoek invention of a simple microscope, observation of bacteria Anton van Leeuwenhoek (1632-1723) 1668 A van Leeuwenhoek invention of a simple microscope, observation of bacteria Anton van Leeuwenhoek (1632-1723) Histórico (Dimitri Iwanowski (1892) mostrou que extratos de plantas doentes de tabaco podiam transmitir a doença para outras plantas após passagem em filtros de cerâmica fina capazes de reter as menores bactérias). Planta sadia Planta doente Agentes filtráveis • 1892 – Iwanovsky • 1898 – Beijerinck: contagium vivum fluidum ©Principles of Virology, ASM Press Histórico (O Faraó Ramses V morreu de varíola em 1196 AC e a varíola era endêmica na China antes das 1000 AC). Múmia com sinais de varíola Caso de varíola mais recente Man Bitten by Mad Dog. Illustration from an Arabic translation of the Materia Medica, Baghdad, Iraq, 1224. This illustration served as the frontispiece of George Baer’s book, The Natural History of Rabies, 1975. He found this piece in the Freer Gallery of Art, Smithsonian Institution, Washington, DC. • Reconhecendo que os sobreviventes da varíola foram protegidos de subseqüente infecções, os chineses inalaram as crostas secas de lesões de varíola como rapé ou inocularam o pus de uma lesão em um arranhão no antebraço - “variolação”. • Edward Jenner quase foi morto pela “variolação” aos 7 anos! Em 14 de Maio de 1796, ele usou o vírus da varíola bovina para vacinar com sucesso uma criança de 8 anos. Os vírus estão por todo o lugar ✓ Infectam todas as formas de vida. ✓ Nós comemos e respiramos bilhões de vírus todos os dias. ✓ Carregamos material genético viral em nosso genoma. Mais de 1030 bacteriófagos nas águas do mundo ✓ Um bacteriófago pesa cerca de 1 fentograma (10-15 gramas). 1030 x 10-15 = só a biomassa dos bacteriófagos do planeta excedem a biomassa de elefantes em 1000 vezes Os números dos vírus no mundo Myovirus, collected from the Mediterranean Sea, a type of virus that infect marine cyanobacteria Bacterium, collected from the Southern Ocean, infected with viruses (dark dots) that are replicating within it. Nearly half of the oxygen produced on the Earth comes from tiny organisms living in the ocean but these little critters do much more. As an added bonus to our oxygenated atmosphere, these plankton form the base of the ocean food web and store carbon from the ocean/atmosphere interface in their tissues. When these organisms die they sink to the ocean floor where the carbon is deposited in the sediment. This process is called the ocean’s biological carbon pump. Hoje no mundo existem mais vírus em 1 litro de água do mar costeira do que pessoas no mundo Há cerca de 1016 genomas de HIV no mundo hoje Table 1. Age-adjusted median proportions of diarrheal episodes requiring hospitalizations associated with each enteropathogen in children 0–59 m of age in the world. Lanata CF, Fischer-Walker CL, Olascoaga AC, Torres CX, et al. (2013) Global Causes of Diarrheal Disease Mortality in Children <5 Years of Age: A Systematic Review. PLoS ONE 8(9): e72788. doi:10.1371/journal.pone.0072788 http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0072788 http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0072788 Quão infectados nós estamos? ➢HSV-1, HSV-2, VZV, HCMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8 ➢Para a toda vida ! ➢Coexistência – benéficos? The human virome in non-pathogenic conditions: distribution of the viral families found in the major human systems Intervirology 2013;56:395–412 Sequências de genomas encontrados no corpo humano (sangue) Science News 11 January 2014 ©Principles of Virology, ASM Press O genoma humano 3,2 bilhões de bases A maioria dos vírus que nós infecta tem um pequeno ou mesmo nenhum impacto em nossas vidas ✓ imunossuprimidos ©Principles of Virology, ASM Press ©Principles of Virology, ASM Press ... em um estudo, descobriu-se que o repolho comprado em 5 supermercados diferentes em Washington D.C. estavam contaminados com baculovírus, sendo que que cada porção (cerca de 100 cm2 de folha) continha até 108 partículas de um vírus patogênico para uma lagarta do repolho A maioria dos vírus apenas passa por nós Ingerimos muitos vírus não-animais no consumo de alimentos • A análise metagenômica de vírus de RNA em fezes humanas revela que a maioria das sequências virais são semelhantes aos vírus das plantas. • De 36.769 sequências obtidas, 25.040 (91%) se assemelhavam a vírus de plantas. Varíola Catapora Quem ou o que são os vírus? Definições ❖ parasita intracelular obrigatório ❖ empacotamento do genoma em uma partícula para transmitir entre hospedeiros ❖ genoma viral contêm a informação necessária para iniciar e completar o ciclo infeccioso dentro de uma célula Quem são os vírus? Um parasita, intracelular obrigatório contendo um material genético (DNA ou RNA) envolto por uma camada protéica e/ou membrana (envelope) ©Principles of Virology, ASM Press Os vírus são vivos? vírus e virion • Um organismo com 2 fases virion célula infectada ©Principles of Virology, ASM Press Origem dos vírus em um mundo de RNA • Hipótese pré-celular A) desenvolvimento dos vírus em primeiro lugar ou junto com células com genoma de RNA. B) evolução dos vírus RNA em DNA seguido de infecção de células com genoma de RNA. C) infecção de células dando origem aos 3 domínios (Bactérias, Archea e Eukaria) Origem dos vírus em um mundo com células em primeiro lugar • Hipótese pós-celular – os vírus surgiram de porções das células que manifestaram habilidades de ir de uma célula a outra. – elementos transponíveis (transposons) Já que os vírus são parasitas intracelulares obrigatórios, tudo envolve a relação parasita-hospedeiro ©Principles of Virology, ASM Press Os vírus benéficos ©Principles of Virology, ASM Press ©Principles of Virology, ASM Press Qual seria a consequência de se ter um tamanho pequeno? Comparação do genoma dos Mimivirus em relação a outros vírus já sequenciados Koonin, E. (2005) Gulliver among Lilliputians. Curr. Biol.15: 167-9 Pandoravirus • Infectam amebas • Maior de algumas bactérias • http://www.nature.com/news/giant-viruses- open-pandora-s-box-1.13410 http://www.nature.com/news/giant-viruses-open-pandora-s-box-1.13410 Pithovirus sibericum • Infectam amebas • Maior de algumas bactérias • Vírus gigante recuperado de gelo com 30.000 anos de idade – http://www.nature.com/news/giant-virus-resurrected- from-30-000-year-old-ice-1.14801 http://www.nature.com/news/giant-virus-resurrected-from-30-000-year-old-ice-1.14801 Pesquisador da UFMG descobre o maior vírus já identificado no planeta O tupanvírus foi descoberto no Pantanal brasileiro e é o maior vírus já identificado no planeta, com 2,3 micrômetros de tamanho (foto: Jônatas Santos Abrahão/Divulgação) Tailed giant Tupanvirus possesses the most complete translational apparatus of the known virosphere https://www.nature.com/articles/s41467-018-03168-1 https://www.nature.com/articles/s41467-018-03168-1 Genomas http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Genome • Subunidade – Cadeia polipetídica que forma a estrutura • Unidade estrutural (protômero) – Unidade usada para construção de capsídeos e nucleocapsídeos • Capsídeo – Capsa em latim é caixa – Capa protéica envolvendo o genoma • Nucleocapsídeo – Capsídeo + ácido nucléico • Envelope ) membrana viral – Bicamada lipídica derivada do hospedeiro • Virion – Partícula viral infecciosa Definições ©Principles of Virology, ASM Press Função das proteínas virais • Proteção do genoma – Montagem de uma capa protéica protetora estável – Reconhecimento específico e empacotamentodo genoma – Interação com a membrana celular do hospedeiro para formar o envelope ©Principles of Virology, ASM Press Função das proteínas virais • Entrega do genoma – Ligação com os receptores celulares – Descapsidação do genoma – Fusão com as membranas celulares – Trasnporte do genoma ao sítio apropriado ©Principles of Virology, ASM Press Os vírus são metaestáveis ➢ Devem proteger o genoma (estabilidade) ➢ Devem ser capazes de se “abrirem” na infecção (instabilidade) ➢ Os vírus mantém um nível mínimo de energia, usada na descapsidação se sinais corretos forem dados para desencadear o processo Bakugan ©Principles of Virology, ASM Press Como obter a meta-estabilidade? • Estrutura estável – criada pelo arranjo simétrico de várias proteínas idênticas, que permitem um contato próximo do ótimo. • Estrutura instável – estrutura não é permanentemente ligada. – pode ser afrouxada ou desestabilizada por completo durante o processo de infecção, expondo ou liberando o genoma. ©Principles of Virology, ASM Press Formas de genomas encontrados nos vírus Linear Circular Segmentado Fita simples (+) Fita simples (-) Fita simples (ambisense) Fita dupla Fita dupla ligado nas extremidades Covalentemente ligado a proteína DNA com um RNA Covantemente ligado ©Principles of Virology, ASM Press Parvovirus Rotavirus Influenza Poliovirus Retrovirus Adenovirus Herpes simplex Hepatite B 7 tipos de genomas virais VII • Maior genoma= maior complexidade • Proteínas estruturais – proteção do genoma – ligação à célula – fusão do envelope • Proteínas não estruturais – enzimas – fatores de transcrição – iniciadores à replicação de ácido nucléico – interferência com sistema imune Estrutura e composição Que tipo de informação existe no genoma viral? • Produtos de genes e sinais regulatórios para: – replicação do genoma viral – montagem e empacotamento do genoma – regulação do ciclo de replicação – modulação do sistema imune – transmissão a outros hospedeiros Virion: estrutura e função • Estrutura (o virion) – Criado pelo arranjo simétrico de várias proteínas idênticas, proporcionando máximo contato e ligação não covalente • Função (entrega do genoma) – Estrutura NÃO é ligada de forma permanente – pode ser desmontada ou afrouxada na fase de infecção, para liberar ou expor o genoma ©Principles of Virology, ASM Press ENVELOPE (a) Semliki Forest virus (b) Influenza virus ENVELOPE Capsídeos podem estar envoltos por uma camada com origem na membrana do hospedeiro: vírus envelopados • Envelope: bicamada lipídica derivada da célula hospedeira - O genoma viral não tem uma maquinaria de síntese lipídica • Envelope adquirido do brotamento do nucleocapsídeo através da membrana celular - Qualquer membrana celular, sendo vírus-específica • Nucleocapsídeos dentro do envelope podem ter simetria helicoidal ou icosaédrica ©Principles of Virology, ASM Press Glicoproteínas do envelope viral • Glicoproteínas de membrana • Domínio externo: adsorção, sítios antigênicos, fusão • Domínio interno: montagem • Espículas ©Principles of Virology, ASM Press ©Principles of Virology, ASM Press Simplicidade na simetria dos vírus • Regras para a auto montagem – Regra 1: cada sub-unidade tem contatos idênticos com seu próximo. • interações repetitivas de superfícies quimicamente complementares nas interfaces das subunidades , naturalmente levam ao arranjo simétrico. – Regra 2: as ligações são geralmente não covalentes. • reversíveis. • livre de erros. ©Principles of Virology, ASM Press • Icosaédrica • Helicoidal •Complexa Simetria icosaédrica Simetria icosaédrica Simetria icosaédrica Simetria icosaédrica Simetria icosaédrica Adenovirus SIMETRIA ICOSAÉDRICA Baron:Medical Microbiology, online at http://129.109.136.65/microbook/ch041.htm ©Principles of Virology, ASM Press SIMETRIA HELICOIDAL adaptado de: Klug and Caspar Adv. Virus Res. 7:225 Simetria helicoidal Simetria helicoidal Simetria Helicoidal ©Principles of Virology, ASM Press ©Principles of Virology, ASM Press https://www.youtube.com/watch?v=X-8MP7g8XOE https://www.youtube.com/watch?v=xljBmMkiaUc https://www.youtube.com/watch?v=nDJlWabbkNs Simetria complexa Bacteriófagos Simetria complexa HELICOIDAL HELICOIDAL ENVELOPADOS COMPLEXA ICOSAÉDRICO nucleocapsÍdeonucleocapsÍdeo icosaédrico nucleocapsÍdeo nucleocapsÍdeo helicoidal Bicamada lipídica Bicamada lipídica espículas glicoprotéicas = peplômeros ICOSAÉDRICO COM ENVELOPE Simetrias dos capsídeos UTILIDADES DO CONHECIMENTO DA ESTRUTURA DOS VÍRUS Classificação dos vírus • Natureza e sequência do ácido nucléico no virion • Simetria do capsídeo • Presença ou ausência de envelope • Dimensão do virion e capsídeo ©Principles of Virology, ASM Press 1735 C Linnaeus development of the hierarchical classification (Classes, Orders, Genera, Species) of all organisms and the binomial nomenclature system Carolus Linnaeus (1707-1778) Classificação dos vírus http://ictvonline.org/ • Sistema hierárquico clássico – Reino – Filo – Classe – Ordem (-virales) – Família (-viridae) – Gênero (-virus) http://www.ictvonline.org/ http://www.ictvonline.org/virusTaxonomy.asp?msl_id=27 VíRUS DE DNA VÍRUS DE RNA Classificação CLASSIFICAÇÃO QUANTO AO MODO DE REPLICAÇÃO
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