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ESTRUTURA DO DNA E REPLICAÇÃO O DNA (Ácido Desoxirribonucléico) é composto por milhões de nucleotídeos ligados uns aos outros. Separadamente, nucleotídeos são bastante simples, consistindo de três partes diferentes: • Base nitrogenada (Adenina, Timina, Guanina ou Citosina) • Desoxirribose (um açúcar por cinco carbonos) • Um grupamento fosfato BASE NITROGENADA No DNA existem quatro tipos de bases nitrogenadas: » Adenina (A) » Guanina (G) » Citosina (C) » Timina (T) Adenina e guanina são classificadas como PÚRICAS, pois elas são moléculas compostas por dois anéis. Citosina e timina são classificadas como PIRIMÍDICAS, pois elas são moléculas formadas por um único anel. responsáveis pela manutenção da estrutura de dupla hélice do DNA. pontes de hidrogênio REPLICAÇÃO DO DNA A T C G TEORIAS: conservativa/ semi conservativa/ dispersiva • Replicação semi conservativa: as duas fitas de DNA se desconectam e cada uma serve de modelo para a síntese de uma fita complementar nova. O resultado são duas moléculas de DNA com uma fita original e uma fita nova. • Replicação conservativa: a replicação do DNA resulta em uma molécula formada por duas fitas originais de DNA (idênticas à molécula original de DNA) e outra molécula formada por duas novas fitas (com exatamente a mesma sequência da molécula original). • Replicação dispersiva: a replicação do DNA resulta em duas moléculas de DNA que são misturas, ou “híbridas,” de DNA parental e da molécula filha. Nesse modelo, cada fita individual é uma colcha de retalhos do DNA novo e do original. (Base azotada) = E - ↓ O experimento Meselson-Stahl centrifugação por gradiente de densidade Leve Pesado demonstrou que o DNA replicou-se semiconservativamente, significando que cada fita em uma molécula de DNA serve como um modelo para a síntese de uma fita nova, complementar. Replicação do DNA PRIMEIRA ETAPA A dupla fita é desenrolada pela helicase • helicase desenrola o DNA formando uma forquilha de replicação com gasto de ATP • ENZIMAS TOPOISOMERASES (girase) aliviam a tensão devido ao stress causado pela separação das fitas • SSBs impedem a torção da fita simples, mantendo as fitas separadas rompe as ligações de hidrogênio EUCARIONTES: síntese ao longo da fase S -fases preparatórias (G1 e G2, para que o DNA seja corretamente duplicado e segregado) -fase de síntese (S) -separação das fitas na mitose M PROCARIONTES: -período de replicação -período de segregação do nucleoide -divisão ELONGAÇÃO: A responsável é a DNA polimerase - PROBLEMA 1 • a DNA polimerase nao consegue iniciar o polímero • PRIMASE: RNA polimerase inicia a fita Primer de RNA pequeno ( 4-15 nucleotídeos) A primase forma primers de RNA: na fita continua (uma vez) e na fita descontínua ( múltiplas vezes, a cada 100-200 bases) PROBLEMA 2 ( sentido da fita) • as duas fitas do DNA sao sintetizadas ao mesmo tempo • as fitas sao antiparalelas: uma fita mae é 5’-3’ e a outra é 3’-5’ • a fita só cresce na direção 5’-3’ porque? Enzima primase fabrica o primer Resolução: fragmentos de okasaki -fragmentos de okasaki ocorrem na fita descontínua -a DNA polimerase III é responsável pela síntese de maior parte do DNA -a DNA polimerase I remove o primer de RNA e preenche as lacunas -a DNA ligase une os pedaços de DNA -a DNA III polimerase só pode adicionar novos nucleotídeos em uma extremidade 3’ -OH livre, uma das fitas novas crescerá acompanhando a forquilha de replicação e a outra será produzida em direção oposta ao deslocamento da forquilha Fita líder Fita retardada 2 2 Proteínas presentes na forquilha Obs: não precisa de enzima para ligar as ligações de hidrogênio (se ligam naturalmente) apenas para formar a nova fita Sequência de acontecimentos: A partir de uma trifosfatase, quebra dois fosfatos e liga ao 3’do anterior Obs: pareamento incorreto causa remoção do nucleotídeo Obs: DNA POLIEMRASE II tem função de revisão e correção Impede que elas voltem a se ligar topoisomerase 1 L abre o DNA impede que elas voltem a se ligar fabrica a nova fita Preenche lacuna e corta os primers Liga os fragmentos Sintetiza os primers de rna A DNA ligase sela as quebras +ATP e 7 Dogma central da biologia molecular DNA RNA PROTEÍNA Transcrição Tradução O dogma explica como ocorre o fluxões informações do código genético, esse modelo mostra que uma sequencia de um ácido nucleico pode formar uma proteína TRANSCRIÇÃO: a sequencia de DNA de um gene é copiada para fazer uma molécula de RNA, essa etapa reescreve/transcreve a sequencia do DNA em outra sequencia de RNA TRADUÇÃO: a sequencia de RNAm é decodificada para determinar a sequencia de aminoácidos de um polipeptídeo Transcrição reversa DNA RNA PROTEÍNA Transcrição Tradução Replicação Replicação Dogma central foi quebrado: usa uracila ao invés de timina ocorre no ribossomo Regulação da ação genica Células procarióticas operon: organização de genes de uma mesma via metabólica ( nao ocorre em eucariontes, porque o ribossomo tá no citoplasma) TRANSCRIÇÃO e TRADUÇÃO SIMULTÂNEA Regulação gênica é como a célula controla quais genes, entre os inúmeros genes presentes em seu genoma, são "ativados" (expressos). Graças à regulação gênica, cada tipo de célula em seu corpo possui um conjunto diferente de genes ativados - apesar do fato de que quase todas as células do nosso corpo possuem exatamente o mesmo DNA. - ↳ 7 Tr - S 7 V y Em bactérias, genes sao encontrados em agrupamentos no cromossomo, do qual podem ser transcritos por um promotor ( sitio de ligação de RNA polimerase) como uma unidade. Esse conjunto de genes sob controle de um único promotor é conhecido como operon fabrica RNA (não precisa de todas as outras enzimas presentes na síntese de DNA, apenas ela consegue fabricar) Em geral, um operon contem genes que atuam em um mesmo processo EX: operon lac -> contém genes que codificam proteínas envolvidas na absorção e no metabolismo de um açúcar em particular, a lactose. Os operons permitem que a célula expresse, com eficiência, conjuntos de genes cujos produtos são requeridos simultaneamente. OPERON: gene promotor + gene operador + agrupamento de genes Gene operador: Algumas proteínas reguladoras são repressoras que se ligam a segmentos do DNA chamados operadores. Quando ligado a seu operador, o repressor reduz a transcrição (por exemplo, impedindo a RNA polimerase de avançar sobre o DNA) Operador: onde o repressor se liga Proteína :- Células eucarióticas Grau de compactação do cromossomo Metilação de algumas bases Fatores de ativação/transcrição modificação química de uma expressão genica Acessibilidade da cromatina: Uma cromatina mais aberta ou "relaxada" faz com que o gene esteja mais disponível para a transcrição. Transcrição. A transcrição é um ponto-chave de regulação para muitos genes. Conjuntos de proteínas de fator de transcrição se ligam a sequências de DNA específicas dentro ou perto de um gene, promovendo ou reprimindo sua transcrição para um RNA. TRANSCRIÇÃO Síntese de RNA mensageiro (mRNA) a partir do molde de DNA RNA polimerase I- rRNA RNA polimerase II- mRNA RNA polimerase III- tRNA/rRNA Evidência de Beadle e Tatum para a hipótese mostrou que genes individuais estavam realmente ligados a enzimas específicas. cultivaram cada mutante em meio de cultura mínimo suplementado ou com o conjunto completo de aminoácidos ou com o conjunto completo de vitaminas -Se um mutante cresce no meio mínimo com aminoácidos (mas sem vitaminas), ele deve ser incapaz de produzir um ou mais aminoácidos. -Se um mutante cresce no meio de cultura com vitaminas mas não cresce no meio com aminoácidos, ele deve ser incapaz de produzir uma ou mais vitaminas. - - ↳ Genes codificam Proteínas A hipótese foi modificada paraum gene-um polipeptídeo porque: • Nem todas proteínas são enzimas (ex.Insulina, queratina,colágeno, etc) • Muitas proteínas são compostas de subunidades chamadas cadeias polipeptídicas (ex.Hemoglobina) • Embora no genoma humano um gene possa ser responsável pela síntese de mais de um peptídeo! ideia central - de que um gene normalmente especifica uma proteína numa relação um para um As sequências que são retiradas do transcrito primário foram chamadas de introns e aquelas que permaneceram como parte do RNA funcional, exons. Splicing etapas: • 1- Remoção dos itrons e unir os exons • 2- Adição do cap 5’ na ponta Esse processamento só acontece em RNAm RNAt e RNAr nao sao processados FUNÇÃO SPLICING: Selecionar regiões do RNA que querem que sejam traduzidas SPLICING O DNA que nao tem função, apenas um espaçador ajuda a proteger o DNA que tem função • 3- Adição da cauda poli-A na ponta 3’ para proteger RNAm -- Tradução Síntese de proteína a partir do RNAm Em um RNAm, as instruções para a construção de um polipeptídeo são nucleotídeos de RNA (A, Us, Cs e Gs) lidos em grupos de três. Esses grupos de três são chamados de códons. Splicing alternativomais de um RNAm pode ser formado a partir do mesmo gene. Através do splicing alternativo, nós (e outros eucariontes) podemos sorrateiramente codificar mais proteínas diferentes do que temos de genes em nosso DNA. No splicing alternativo, um pré-RNAm pode sofrer splicing em qualquer uma de duas maneiras. O mesmo pré-RNAm pode sofrer splicing de três maneiras diferentes, dependendo de quais éxons sejam mantidos. Isso resulta em três RNAm maduros, cada qual é traduzido em uma proteína de estrutura diferente. Existem 61 códons para aminoácidos, e cada um deles é "lido" para especificar um determinado aminoácido entre os 20 encontrados comumente nas proteínas. Metionina código de iniciação Quando for fazer a tradução: primeiro acha o código de iniciação depois divide em 3 em 3 A presença de itrons permite que os exons de um gene sejam reunidos em combinações diferentes, resultando na síntese de proteínas diferentes a partir de um mesmo gene Existem mais três códons que não especificam aminoácidos. Esses códons de parada, UAA, UAG e UGA, dizem à célula quando um polipeptídeo está completo. Em conjunto, essas relações entre códons e aminoácidos são chamadas de código genético, porque permitem que as células "decodifiquem" o RNAm em uma cadeia de aminoácidos. RNA transportador (RNAt) RNA transportadores ou RNAt são "pontes" moleculares que conectam os códons do RNAm aos aminoácidos que eles codificam. Em uma das extremidades de cada RNAt há uma sequência de três nucleotídeos denominada anticódon que pode se ligar a códons específicos do RNAm. A outra extremidade do RNAt transporta o aminoácido especificado pelos códons. anticódon do tRNA é o ponto de reconhecimento para o códon no mRNA e este reconhecimento ocorre pelo pareamento de base Sítio O códon e o anticódon precisam se complementar Códon: 5’3’ Anticódon: 3’5’ • O código genético é não ambíguo, ou seja, cada códon codifica para um aminoácido • O código genético é (quase) universal (igual em todos os organismos). Em mitocôndrias há variações. Sorriso :) - LV 4
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