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A contaminação cruzada que acontece na indústria farmacêutica apresenta-se como um tipo de transferência de bactérias de um objeto para outro. Para as produções de medicamentos, esse tipo de contaminação é extremamente perigosa, pois as bactérias podem contaminar os remédios que servem para ajudar na cura de outras bactérias.
Para isso é de extrema importância à limpeza do local para diminuir o risco de contaminação nos medicamentos, pois em um local limpo, o índice de contaminação é bem menor. Também se faz necessário, o uso de jalecos por cima das roupas que usamos no dia a dia, e, assim evitar a presença de microrganismos ao ambiente de fabricação dos fármacos. As embalagens devem ser imediatamente descartadas após o uso e, ainda, sempre esterilizar as esteiras e bancadas, em que os medicamentos passam são critérios simples que mantém a fábrica limpa e longe de contaminação.  
Outro ponto extremamente importante é o treinamento de todas as pessoas que têm qualquer acesso às áreas do processo de produção. Pessoas são as maiores fontes de contaminantes. Mesmo involuntariamente, nós humanos somos os grandes vetores de contaminação, seja pela nossa pele, cabelos que se soltam e até mesmo pela salivação presente, quando falamos. Quando não são estas causas naturais, são também aqueles gerados por desprendimento de fibras e micro particulados de nossas roupas, do uso de esmalte, batom e outras maquiagens. A indústria está sempre estudando e investindo um enorme volume de recursos financeiros nesta batalha diária pela redução da possibilidade de algum risco de contaminação e por isso é de grande importância que se você for obrigado a usar algum equipamento de proteção, faça sempre da forma que lhe foi instruído.