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Rnt1p: Uma alternativa ao RNAi para a degradação do RNA
direcionado
A família de proteínas de ligação de RNA de encadernação dupla controla a edição, a estabilidade e a
função do RNA em todos os eucariotos.
Como um sinal para silenciamento de expressão específico de genes em muitos organismos, o RNA de
cadeia dupla (dsRNA) é especificamente reconhecido pelas proteínas de ligação ao dsRNA (dsRBPs).
Não surpreendentemente, a família dsRBP controla a estabilidade, edição e função do RNA em todos os
eucariotos. A característica central desta família é o reconhecimento de um RNA duplex genérico
usando o domínio de ligação a dsRNA altamente conservado (dsRBD) que reconhece as características
da hélice de RNA. Variações sobre este tema que conferem especificidades de espécies e
funcionalidades têm sido relatadas, mas a maioria dos dsRBPs mantém sua capacidade de ligar o
dsRNA genérico.
Entre os dsRBPs, o ribonuclease procariótico III (RNase III) e o eucariótico Rnt1p, Drosha e Dicer
representam quatro classes distintas da família RNase III. Como todos os dsRBPs e a maioria dos
RNase III, Rnt1p de Saccharomyces cerevisiae tem um dsRBD, mas ao contrário da maioria dos seus
parentes, ele se liga mal a hélices de RNA genérico. Em vez disso, Rnt1p, a única RNase III conhecida
expressa em S. cerevisiae que não possui a maquinaria de interferência de RNA (RNAi), reconhece uma
classe específica de RNAs de ciclo de troncos. Para reconhecer os substratos específicos, o dsRBD do
Rnt1p é especializado, apresentando uma topologia incomum de abbbaaaa (em contraste com a dobra
canônica de abbba dsRBD) e um motivo de ligação ao RNA específico da sequência no terminal C do
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dsRBD. A genética, a função, a estrutura e o mecanismo de Rnt1p são descritos por Sherif Abou Elela e
Xinhua Ji em RNA WIRE.
Desde a descoberta de Rnt1p em 1996, progressos significativos foram feitos em estudos de sua
genética, função, estrutura e mecanismo de ação, explicando as razões e mecanismos para o aumento
da especificidade desta enzima e seu impacto no mecanismo de degradação do RNA. Como a primeira
estrutura tridimensional de RNase III eucariótica em complexo com dsRNA de forma catalítica
significativa, a estrutura cristalina de alta resolução do complexo pós-clivagem Rnt1p revela um
mecanismo duplo-governante para seleção e clivagem de substrato. A estrutura mostra que Rnt1p
reconhece um nucleotídeo de guanina por um motivo G-clamp no terminal C de DsRBD, que a base de
guanina também é reconhecida pelo domínio N-terminal (NTD) da enzima, que a garra-queda G é
necessária para a seleção e clivagem do substrato, e que a DTN é necessária para a precisão do
processamento. A estrutura também descreve a arquitetura detalhada do conjunto de clivagem de RNA,
explicando como as RNase III eucarióticas seguem o mecanismo catalítico básico de dois Mg 2 + + ion
que foi revelado pela primeira vez pelas estruturas bacterianas de RNase III. Juntamente com as
estruturas dos complexos bacterianos RNase III:RNA, a estrutura do Rnt1p:RNA demonstra que a
seleção de substrato por RNase III é realizada independente da clivagem, permitindo que todos os
membros da família sigam o mesmo mecanismo catalítico básico de duas Mg 2+ ion para o
processamento de dsRNA.
Gentilmente contribuídos pelos autores.
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/wrna.1521
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/wrna.1521