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<p>Roteiro de verificação de genoma e análise de genes da Glycine max.</p><p>Aluna: Ana Cristina Contini Augustinho</p><p>Na página da web https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ selecione em “all databases” a opção “genome” e na barra de busca digite a espécie Glycine max apresentando as seguintes informações:</p><p>· Nome popular desta espécie: Soja</p><p>· ID do genoma:5</p><p>· Quantidade cromossomos que o genoma apresenta: 20</p><p>· Tamanho em Mb que o genoma possui: 994.135</p><p>· A quantidade de proteínas que o genoma possui: 58338</p><p>Na tabela “reference genome” escolha o cromossomo 10, clique com o botão direito do mouse e selecione a opção “abrir link em uma outra guia” e apresente as seguintes informações:</p><p>· A ID desta sequência: NC_038246</p><p>· Tamanho da sequência: 51638687 bp</p><p>· A definição: Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 10, Glycine_max_v4.0, whole genome shotgun sequence.</p><p>· O tipo de tecido essa sequência se manifesta: Calo</p><p>Ao lado direito da página em “related infomation” selecione a opçãp “gene” e apresente as seguintes informações:</p><p>· A ID do gene: 121173003</p><p>· A data de update: 21/04/2021</p><p>· A descrição de gene: small nucleolar RNA R71</p><p>· A presença de exons: exon único</p><p>· Cole a sequência FASTA deste gene: >NC_038246.2:c21355114-21355008 Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 10, Glycine_max_v4.0, whole genome shotgun sequence</p><p>ATCTGATGGTGGGGGCAACTGGCACATAGTTTCTTAAATCTCTCCCAGTACTCATACAGGCTCTCTCCAC</p><p>TGAGTTGTCTAATACCTGAGATATCCTTCCTGATGGC</p><p>Com a sequencia FASTA colada clique ao lado direito da pagina em BLAST, selecione o quadro “nucleotide BLAST” e na caixa “ Enter Quary sequence” cole a sequencia FASTA, no menu “databases” selecione “Nucleotide collection” e na caixa “organismo” clique em exclude assim a abrangência não será para todos os organismos e clique em BLAST.</p><p>· Informe o E-value desta sequência:1e-46</p><p>· Informe a identidade desta sequência: 100%</p><p>· Informe o tamanho da sequência: 107</p>

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