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Material de Estudo - Bioinformática #30 Tema: Análise de Sequências e Filogenética Molecular 1. Qual algoritmo é usado para encontrar alinhamentos ótimos entre duas sequências biológicas? o a) K-means. o b) BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). o c) Redes neurais. o d) Árvores de decisão. o e) Análise de componentes principais (PCA). Resposta: b) BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). Justificativa: BLAST é usado para encontrar regiões de similaridade entre sequências biológicas e comparar com bancos de dados. 2. O que a "filogenética molecular" estuda? o a) A estrutura de proteínas. o b) A evolução de organismos baseada em dados de sequência de DNA e proteínas. o c) A interação de fármacos com receptores celulares. o d) A regulação da expressão gênica. o e) A análise de genomas completos. Resposta: b) A evolução de organismos baseada em dados de sequência de DNA e proteínas. Justificativa: Filogenética molecular utiliza dados de sequências para inferir relações evolutivas entre organismos ou genes. 3. Qual método constrói árvores filogenéticas com base na minimização do número de mudanças evolutivas necessárias para explicar os dados de sequência? o a) Método da distância. o b) Máxima parcimônia. o c) Máxima verossimilhança. o d) Método de agrupamento hierárquico. o e) Árvores filogenéticas bayesianas. Resposta: b) Máxima parcimônia. Justificativa: A máxima parcimônia busca a árvore com o menor número de eventos evolutivos que podem explicar os dados de sequência. 4. O que a análise de "homologia" busca determinar entre sequências biológicas? o a) A similaridade funcional entre proteínas. o b) A relação evolutiva (ascendência comum) entre sequências. o c) A similaridade estrutural entre proteínas. o d) A identidade de sequência entre RNAs. o e) A taxa de mutação de genes. Resposta: b) A relação evolutiva (ascendência comum) entre sequências. Justificativa: Homologia indica que duas sequências compartilham um ancestral comum. 5. Qual banco de dados armazena sequências de DNA e proteínas, permitindo a busca e comparação de sequências? o a) PubMed. o b) PDB (Protein Data Bank). o c) GenBank. o d) KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes). o e) UniProt. Resposta: c) GenBank. Justificativa: GenBank é um banco de dados de sequências de DNA acessível ao público, mantido pelo NCBI. 6. O que é um "perfil HMM" (Hidden Markov Model) usado em bioinformática? o a) Uma matriz de substituição de aminoácidos. o b) Um modelo estatístico para representar a variação de sequências biológicas alinhadas. o c) Um método para predição de estruturas secundárias de proteínas. o d) Um algoritmo para alinhamento múltiplo de sequências. o e) Um mapa de restrição de DNA. Resposta: b) Um modelo estatístico para representar a variação de sequências biológicas alinhadas. Justificativa: Perfis HMMs modelam famílias de sequências relacionadas e são usados para busca e alinhamento de sequências.