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Material de Estudo - Sistemática Molecular - Material 39 Tema: Filogenia Molecular e Evolução de Sequências 1. Qual das seguintes regiões do genoma é frequentemente usada em estudos de filogenia molecular para reconstruir relações evolutivas entre espécies relacionadas distantemente? a) DNA mitocondrial. b) Genes ribossomais (rRNA). c) Genes de transferência (tRNA). d) Genes nucleares de cópia única. e) Regiões intergênicas não codificantes. Resposta: b) Justificativa: Os genes ribossomais (rRNA) são altamente conservados ao longo da evolução, permitindo a comparação de sequências entre espécies relacionadas distantemente. 2. Qual dos seguintes métodos de reconstrução filogenética utiliza a parcimônia como critério de otimização, buscando a árvore com o menor número de mudanças de estado de caracteres? a) Método da máxima verossimilhança. b) Método de distância genética. c) Método da parcimônia. d) Método de inferência bayesiana. e) Método de bootstrap. Resposta: c) Justificativa: O método da parcimônia busca a árvore filogenética que requer o menor número de mudanças de caracteres para explicar os dados observados. 3. Qual dos seguintes modelos de evolução de sequências é usado para estimar a probabilidade de substituições de nucleotídeos em DNA, considerando diferentes taxas de transição e transversão? a) Modelo Jukes-Cantor. b) Modelo Kimura 2-parâmetros. c) Modelo Felsenstein 81. d) Modelo Hasegawa-Kishino-Yano (HKY85). e) Modelo General Time Reversible (GTR). Resposta: e) Justificativa: O modelo GTR é o modelo mais geral de evolução de nucleotídeos, permitindo diferentes taxas de substituição entre todos os pares de nucleotídeos. 4. Qual das seguintes técnicas estatísticas é usada para avaliar a confiança dos ramos de uma árvore filogenética, gerando um valor de suporte para cada ramo? a) Análise de componentes principais (PCA). b) Análise de agrupamento (clustering). c) Análise de regressão. d) Análise de bootstrap. e) Análise de variância (ANOVA). Resposta: d) Justificativa: A análise de bootstrap é uma técnica de reamostragem que gera múltiplas árvores filogenéticas a partir de conjuntos de dados replicados, permitindo a avaliação da confiança dos ramos da árvore original. 5. Qual dos seguintes conceitos descreve a ocorrência de substituições de nucleotídeos em um gene ao longo do tempo, permitindo a estimativa do tempo de divergência entre espécies? a) Homoplasia. b) Coalescência. c) Relógio molecular. d) Polimorfismo. e) Evolução convergente. Resposta: c) Justificativa: O relógio molecular pressupõe que as substituições de nucleotídeos ocorrem a uma taxa constante ao longo do tempo, permitindo a estimativa do tempo de divergência entre espécies. 6. Qual das seguintes regiões do genoma é frequentemente usada em estudos de filogenia molecular para reconstruir relações evolutivas entre populações ou espécies relacionadas recentemente? a) DNA mitocondrial. b) Genes ribossomais (rRNA). c) Genes de transferência (tRNA). d) Genes nucleares de cópia única. e) Regiões intergênicas não codificantes. Resposta: a) Justificativa: O DNA mitocondrial evolui rapidamente e é transmitido maternalmente, sendo útil para estudos de filogeografia e reconstrução de relações entre populações ou espécies relacionadas recentemente.