Análise de Expressão Gênica

Prévia do material em texto

1- Acesse o repositório Gene Expression Omnibus (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/).
2- No espaço de busca (Keyword or GEO acession), digite o códio GSE167269 e clique no botão
“Search”.
3- Verifique as informações sobre o dataset (Title, Summary, Overall design, samples, etc.).
4- Clique no botão “Analyse with GEO2R” (Botão azul na parte inferior esquerda da página).
5- Clique no botão “Define groups”
6- Defina os grupos de interesse (Ex.: dmPGE2 e Controle)
7- Selecione as amostras pertencentes a cada grupo. Por exemplo, clique em uma amostra do grupo
tratado (mPB CD34+ dmPGE2 donor 1) e depois clique no grupo dmPGE2 na área “define groups”.
Depois, selecione as amostras controle (mPB CD34+ Vehicle donor 1) e depois clique no grupo
controle na área “define groups”. Depois selecione a segunda amostra controle a assim por diante.
As amostras do grupo controle serão os seguintes: GSM100609, GSM100610 e GSM1006011. As
amostras do grupo tratado serão as seguintes: GSM100615, GSM100616 e GSM1006017.
8- Uma vez selecionadas as amostras, clique no botão “Analyze” (Botão azul na parte inferior
esquerda da página).
9- Observe os resultados.
10- Clique em “Download full table” para baixar os resultados.
11- Selecione os genes diferencialmente expressos, com adj.P.Val