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Genética de Populações Genética de Populações Prof. Dr. Ronaldo Celerino Laboratório de Imunopatologia Keizo Asami Universidade Federal de Pernambuco Variabilidade Genética Darwin – sem variação as populações naturais não podem evoluir; Primeiros estudos enfocaram características evidentes do fenótipo (pigmentos, tamanho, etc); Características que estão mais diretamente relacionadas com os cromossomos e genes; Variabilidade Genética Evolução A capacidade de uma população para se adaptar a um ambiente em mudança depende da variabilidade genética. Variabilidade Genética Variabilidade Genética A variabilidade genética mede a tendência dos diferentes alelos de um mesmo gene variarem entre si, numa população. Sobrevivência e Reprodução Características Mudança Ambiental Variabilidade Genética Variabilidade Genética Variabilidade Reprodução Sexuada Variabilidade Genética Os indivíduos formados por reprodução sexuada apresentam variabilidade genética diferindo entre si e em relação aos progenitores Variabilidade Genética Variabilidade /recombinação genética é consequência de fenômenos que ocorrem na meiose e na fecundação. Meiose Recombinação de genes no Crossing-over Meiose Colocação ao acaso de cada para de homólogos no plano equatorial no decorrer da metafase I seguida de separação aleatória na anafase I Fecundação União aleatória de uma grande variedade de gametas, geneticamente diferentes Variabilidade Genética Fenotípico Cromossomal Protéico Genômico Variação Fenotípica Características visíveis – fenótipo; Diferenças fenotípicas podem ter uma base genética; Elucidação dos fatores genéticos – condução dos organismos para laboratório e cruzá-los; Para muitos não é factível. Variação na Estrutura dos Cromossomos Variação fenotípica – reflexo – variabilidade genética. Há um modo de detectar variabilidade observando o próprio material genético? Larvas de Drosófila - Cromossomos politênicos – variação de estrutura dos cromossomos; Dobzhansky e Cols – identificaram muitos arranjos diferentes dos padrões de bandeamentos nos cromossomos politênicos de diferentes espécies de Drosófila; Cada arranjo consiste em uma ou mais inversões do padrão mais comum de bandeamento; Variação na Estrutura de Proteínas Variação na estrutura das proteínas; Eletroforese – nova era em estudos com variação genética; Técnica - separa macromoléculas com base em tamanho e carga; Aloenzimas – formas de uma enzima codificada por alelos diferentes de um gene; Diferem umas das outras por um ou mais aminoácidos; Eletroforese – permite detectar variações no nível de produtos gênicos; Variação na Estrutura de Proteínas Aplicação - qualquer tipo de organismo; Analisa a variação de proteínas de grande número de indivíduos em populações diferentes; Investigação nas dimensões espacial e temporal da variação genética; Proteínas que exibem variação eletroforética são ditas polimórficas se pelo menos duas das variantes tiverem frequências maiores do que 1% na população; Sem variação monomórficas; Humanos – 1/3 das enzimas solúveis são polimórficas; Variação na Sequência de Nucleotídeos Diferenças na sequência de bases que formam a molécula do DNA; Variação com frequência na população maior que 1% - Polimorfismos; Fonte de variabilidade; Polimorfismos do DNA: Consequências Variabilidade Genética Como podemos verificar a variabilidade genética de uma população? Variabilidade Genética Estimando as Frequências Genotípicas e Alélicas Frequência Simplesmente uma proporção ou uma porcentagem, em geral expressa como uma fração decimal O que é uma frequência? Genotípica Alélica Tipos Frequência Genotípica f (AA) = Número de indivíduos AA N f (Aa) = Número de indivíduos Aa N f (aa) = Número de indivíduos aa N f (AA) + f (Aa) + f (aa) = 1 Percentual de indivíduos de um dado genótipo; Como calcular? Somar o número de indivíduos que possuem o genótipo em questão, dividindo pelo total de indivíduos da amostra populacional (N); O somatório das frequências genotípicas será: Frequências Alélicas Percentual de um alelo em uma população. Como calcular? Pode ser calculada a partir de um número ou de uma frequência; Contamos o número de cópias de um determinado alelo presentes em uma amostra e dividimos pelo número total de alelos na amostra. Simbolicamente as frequências alélicas são representadas por “p” e “q” em lócus com dois alelos; Soma das frequências alélicas p e q sempre deve ser igual a 1. p + q = 1 Cálculo da Frequência Alélica por Contagem Direta As frequências alélicas obtidas a partir de números inteiros, são calculadas por contagem direta. Em um lócus com dois alelos (A e a), as frequências podem ser calculadas por: p = f (A) = 2 nAA + nAa 2N q = f (a) = 2 naa + nAa 2N q = 1 - p Números individuais de AA, Aa e aa Número total de indivíduos diplóides Após ter sido obtido “p”, “q” pode ser determinado assim: Cálculo da Frequência Alélica a Partir das Freq. Genotípicas Como são calculadas? Somar a frequência de homozigotos para cada alelo com a metade da frequência de heterozigotos, assim: p = f (A) = f(AA) + ½ f(Aa) q = f (A) = f(aa) + ½ f(Aa) As frequências alélicas obtidas a partir de uma frequência, são calculadas por meio das frequências genotípicas. Aplicação Duas populações humanas foram estudadas quanto aos grupos sanguíneos M (genótipo MM), MN (genótipo MN) e N (genótipo NN) do sistema MNS e foram obtidos os seguintes dados: Amostra Genótipos Total MM % MN % NN % Xavantes 41 0,52 30 0,38 8 0,10 79 Brasileiros 30 0,30 50 0.50 20 0,20 100 a)Calcule as frequências alélicas por contagem direta para cada população? b) Calcule as frequências alélicas por frequência genotípica para cada população? Lei de Hardy-Weinberg Genética de Populações Prof. Dr. Ronaldo Celerino Laboratório de Imunopatologia Keizo Asami Universidade Federal de Pernambuco Entender o processo de formação de um pool gênico de uma população. Genética de Populações Qual o efeito da reprodução e dos princípios Mendelianos nas frequências genotípicas e alélicas? Como a segregação dos alelos na formação dos gametas e a combinação dos alelos na fertilização influencia o pool gênico? Lei de Hardy-Weinberg A Resposta Relação matemática entre as frequências alélicas e genotípicas; Genótipos – Zigotos; Alelos – Gametas da geração precedente; Formulada independentemente por Godfrey H. Hardy e Wilhelm Weinberg em 1908; Avalia o efeito da reprodução nas frequências alélicas e genotípicas; Lei de Hardy-Weinberg p2 + 2pq + q2 AA Aa aa p + q = 1 A a Suposições e Previsões da Lei de H-W Em um lócus autossômico com dois alelos, a Lei de H-W pode ser aplicada: Suposições Se a população é grande,com reprodução aleatória, e não afetada por mutação, migração ou seleção natural, então: Previsão 1 As frequências alélicas de uma população não mudam. Previsão 2 Frequências genotípicas se estabilizam após uma geração nas proporções p2 (AA), 2pq (Aa) e q2 (aa), em que “p’’ é a frequência do alelo A e ‘’q’’ do alelo a. Lei de Hardy-Weinberg Reprodução sozinha não altera as frequências alélicas e genotípicas Frequências alélicas determinam as frequências genotípicas Suposições cumpridas Considerações Importantes Enquadramento a lei H-W Uma geração de cruzamento aleatório População em Equilíbrio de HW Genótipos esperados Suposições da Lei de Hardy-Weinberg População seja grande Teoria: Infinitamente grande Prática: Grande o bastante para que os desvios aleatórios das proporções esperadas não causem mudanças significativas nas frequências alélicas. Cada genótipo se reproduza em proporção a sua frequência. Indivíduos na população se reproduzam aleatoriamente F(AA) = 0,6 F (Aa) = 0,3 F (aa) = 0,1 Reprodução Aleatória AA x AA = 0,6 x 0,6 = 0,36 aa x aa = 0,1 x 0,1 = 0,01 Ex: Em uma população os genótipos estão distribuídos nas seguintes frequências: Suposições da Lei de Hardy-Weinberg Mutação ocorre em todas as populações – baixa taxa – poucos efeitos; Seleção natural e migração – fatores significativos em populações reais, mas não são propósitos da Lei de HW. Frequências alélicas da população não são afetadas por seleção natural, migração e mutação. Suposições da Lei de Hardy-Weinberg Nenhuma população real se reproduz aleatoriamente para todas as características; Uma população pode estar em equilíbrio de H-W para um lócus mas não para outros; Todas as suposições se aplicam a um só lócus. Suposições da Lei de Hardy-Weinberg Evolução consiste alterar frequências alélicas de uma população; Lei nos diz que a reprodução só não trará evolução. Implicações da Lei de Hardy- Weinberg A população não pode evoluir se ela atende as suposições da Lei de H-W. Para lócus com 2 alelos, a frequência de heterozigotos é grande quando as frequências alélicas estão entre 0.33 e 0.66 e está no máximo quando a frequência alélica para cada 0.5; A frequência de heterozigotos também nunca excede 0.5 Implicações da Lei de Hardy- Weinberg Quando a população está em equilíbrio, as frequências genotípicas são determinadas pelas frequências alélicas Uma única geração de cruzamento aleatório produz o equilíbrio das frequências p2, 2pq e q2. Implicações da Lei de Hardy- Weinberg Genótipos - em equilíbrio - não significa que a população está livre da seleção natural, mutação e migração, significa que essas forças não atuaram desde a último cruzamento aleatório. Lei de Hardy-Weinberg A lei de Hardy-Weinberg requer: O organismo é diplóide; Reprodução é sexuada; Gerações são discretas; O gene em questão possui dois alelos; As frequências alélicas são idênticas em machos e fêmeas; Cruzamento é aleatório; O tamanho da população é muito grande (em teoria, infinito); A migração é desprezível; A mutação pode ser ignorada; A seleção natural não afeta os alelos em consideração; Calculamos frequências alélicas e genotípicas; Calculamos as frequências genotípicas esperadas; Comparamos as frequências observadas e esperadas usando o teste do Qui-quadrado; Calculamos o grau de liberdade; Verificação do equilíbrio. Aplicando a Lei de Hardy- Weinberg Aplicação Genótipos Números Observados R2R2 135 R2R3 44 R3R3 11 Aplicação Jeffrey Mitton e seus colegas encontram três genótipos (R2R2, R2R3 e R3R3) em um lócus codificante por uma enzima peroxidase em árvores de pinheiro crescidas no Colorado. Os números observados destes genótipos no Lago Glacial do Colorado, foram: Será que o lócus de peroxidase nesta população está em equilíbrio de Hardy-Weinberg? Aplicação 1º Passo Calcular das frequências alélicas e genotípicas f (AA) = Número de indivíduos AA N f (Aa) = Número de indivíduos Aa N f (aa) = Número de indivíduos aa N p = f (A) = 2 nAA + nAa 2N q = f (a) = 2 naa + nAa 2N Alélicas Genotípicas Aplicação 2º Passo Calcular o número de genótipos esperados! Genótipos Esperados: AA = p2 x n Aa = 2pq x n aa = q2 x n Aplicação 3º Passo Comparação das frequências observadas e esperadas através do teste do qui-quadrado ! χ2 = Σ (observado – esperado)2/ esperado Aplicação 4º Passo Calcular o grau de liberdade do Teste e estabelecer o nível de significância! Grau de Liberdade (gL) = Número de classes genotípicas – número de alelos Nível de significância = 0.05 Aplicação 5º Passo Verificar se a população se encontra em equilíbrio! X2 calculado > X 2 teórico População não está em equilíbrio de HW X2 calculado < ou = X 2 teórico População está em equilíbrio de HW Aplicação Aplicação Aplicação Aplicação Foram observados os seguintes genótipos em uma população: HH=40, Hh=45 e hh=50. Com base nesses dados, pede-se: a)Calcule as frequências alélicas e genotípicas observadas para essa população. b)Calcule o número de genótipos esperados. c)Usando o teste do qui-quadrado, determinar se a população está em equilíbrio de Hardy- Weinberg. Genética de Populações Prof. Ronaldo Celerino ronaldocelerino@yahoo.com.br
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