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Taxonomia Bacteriana Prof. Bruno Rocha É a ciência da classificação. Fornece uma base ordenada para a denominação dos organismos e os coloca em uma categoria. TAXONOMIA BACTERIANA RAZÕES PARA A CLASSIFICAÇÃO DOS MICRORGANISMOS Estabelecer critérios para a identificar organismos Agrupar os organismos relacionados Fornecer informações importantes sobre como os organismos evoluíram É a área da Microbiologia que estuda: Classificação; Nomenclatura; Identificação bacteriana. Taxonomia Convencional: (Quimiotaxonomia e Taxonomia Numérica) Taxonomia Molecular: (análises de perfis genéticos como Hibridização DNA-DNA, RNA 16S) TAXONOMIA BACTERIANA Carlos Lineu – Pai da Taxonomia O sistema chama-se taxonomia lineana. • São vários os níveis de classificação taxonômica e esses níveis são hierárquicos. • Cada classificação chama-se um taxon (plural taxa). Carlos Lineu – Pai da Taxonomia • Desenvolveu a nomenclatura binominal • Primeira letra em Gênero deve ser maiúsculo • Ambas escritas em itálico quando impressas mas sublinhadas quando manuscritas. • Nome identifica algumas características do micro- organismo tal como a sua forma, onde é encontrado, que nutrientes usa, quem descobriu ou que doença causa. Gênero e espécie Nome Significado Escherichia coli Homenagem a Theodor Escherich (1888); encontrada no cólon Haemophilus ducreyi Hemo:=sangue, phil= amor; homenagem a Augusto Ducrey (1889), causa o cancro mole ou cancróide (DST) Neisseria gonorrhoeae Homenagem a Albert Neisser (1879); causa a gonorréia Staphylococcus aureus Staphylo=cacho; koccus=grão; aureus= áureo • Nome binomial é usado: Staphylococcus epidermidis Escherichia coli Pseudomonas aeruginosa • Quando não se sabe ou não se quer especificar a espécie: Staphylococcu ssp.(uma espécie) Staphylococcus spp.(todas as espécies) • Abreviações: Staphylococcus aureus S. aureus X Staph. Aureus X Staphylococcus a. A classificação é a organização das bactérias em grupos tendo por base as semelhanças existentes entre os diferentes grupos. CLASSIFICAÇÃO Na classificação bacteriológica a “Espécie” é o grupo fundamental: As espécies estão reunidas em gêneros; Os gêneros em famílias; As famílias em ordens; As ordens em classes; As classes em filos; Os filos em domínios. Escherichia coli • Domínio – Eukariyota • Filo – Proteobacteria • Classe – γ-Proteobacteria • Ordem – XII • Família – Enterobacteriaceae • Gênero – Escherichia • Espécie - coli 1) Genotípicas: • Tem o objetivo de determinar o grau de parentesco entre as moléculas de DNA das amostras em classificação. • São estudos da proporção “citosina-guanina” na molécula de DNA e o grau de homologia através do teste de hibridização. CARACTERÍSTICAS USADAS NA CLASSIFICAÇÃO 2) Fenotípicas: Inclui características: • Morfológicas, • Coloração; • Estruturais; • Nutritivas; • Metabólicas; • Sensibilidade a antibióticos. • É a organização de vários grupos em gêneros, espécies etc.. denominados Taxon ou Taxa. • É regida pelo código internacional de nomenclatura bacteriana Manual de Bergey (Livro referencia para classificação e identificação bacteriana de interesse médico, industrial ou ecológico) • Os taxon são construídos da mesma maneira, o que permite a comunicação entre microbiologistas e outros profissionais. • O nome do gênero e das espécies é sempre escrito em itálico e na falta deste tipo de letra, o nome é sublinhado. NOMENCLATURA Escherichia coli Staphylococcus aureus • A identificação se dá através do isolamento e uso prático de um esquema de classificação. • Verificar o tipo de espécie ou outra categoria presente na amostra a ser analisada. • O processo de identificação primeiro assume que a bactéria de interesse já tenha sido descrita. IDENTIFICAÇÃO Cepa – é o subgrupo de uma espécie que a distingue de outros subgrupos da mesma espécie; identificada por nome, número ou letra após a espécie. Ex: E. coli K1, E. coli O157:H7. ATCC – American Type Culture Colletion – Centro de pesquisa que possui coleção de micro-organismos com suas características preservadas. De modo geral, são usados dois sistemas de identificação: Chaves Tabelas Identificação de espécies. No laboratório de microbiologia de rotina as técnicas mais usadas para a identificação de bactérias é fenotípica através de provas bioquímicas. Métodos moleculares: sequenciamento do DNA e detecção/caracterização do rRNA
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