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Estrutura e função dos ácidos nucléicos Profa. Msc. Vanessa Moreira ÁCIDOS NUCLÉICOS -São constituídas por um grande número de NUCLEOTÍDEOS, que são unidades formadas por três tipos de substâncias químicas: -Uma base nitrogenada: composto cíclico que contém nitrogênio. -Uma pentose: açúcar que contém cinco carbonos. - Um grupo fosfato - Podem ser de dois tipos: DNA e RNA. ÁCIDOS NUCLÉICOS OBS.: A molécula sem o grupo fosfato é chamada nucleosídeo. ÁCIDOS NUCLÉICOS • Pentose - Áçucar contendo 5 átomos de carbonos. - DNA: desoxirribose -RNA: ribose ÁCIDOS NUCLÉICOS ÁCIDOS NUCLÉICOS • Bases nitrogenadas -Compostas por uma cadeia fechada de carbonos que contêm nitrogênio. -Podem ser de cinco tipos: adenina, citosina, timina, guanina e uracila. -São classificadas em: púricas e pirimidinas. ÁCIDOS NUCLÉICOS • Bases nitrogenadas -Púrica ou purina: possui um duplo anel de átomos de carbono e nitrogênio. ÁCIDOS NUCLÉICOS • Bases nitrogenadas -Pirimidina ou pirimídica: possui apenas um anel de átomos de carbono e nitrogênio. ÁCIDOS NUCLÉICOS • Bases nitrogenadas - Estão unidas por pontes de hidrogênio. -Pareamento das bases nitrogenadas sempre obedecem o mesmo padrão. A - T C - G ÁCIDOS NUCLÉICOS ÁCIDOS NUCLÉICOS • Bases nitrogenadas e a relação de Chargaff -Erwin Chargaff (1950) observou que: 1. A quantidade total de (T+C) é sempre igual a quantidade de (G+C). 2. Em qualquer DNA celular, a quantidade de resíduos A=T e G=C. ÁCIDOS NUCLÉICOS Organismo e tecido T:A C:G Espermatozóide 1,00:0,92 1,00:0,92 Tecido hepático 1,00:1,00 1,00:1,20 Levedura 1,00:1,00 1,00:1,14 Baço de boi 1,00:1,06 1,00:1,28 Erwin Chargaff “ É portanto digno de nota, mas ainda não podemos dizer se isso é apenas acidental, que em todos os ácidos nucléicos examinados até agora as proporções de adenina e timina e de guanina e citosina não estavam muito afastadas de 1” DNA RNA Adenina Guanina Citosina Timina Uracila ÁCIDOS NUCLÉICOS • DNA - Molécula constituída de duas cadeias de nucleotídeos que se enrolam originando uma dupla hélice. - Na dupla hélice as duas fitas de DNA são complementares (A = T e G = C) e apresentam polaridades opostas: antiparalelas. polaridade 5’ 3’ em uma fita e 3’ 5’ na outra. ÁCIDOS NUCLÉICOS ÁCIDOS NUCLÉICOS ÁCIDOS NUCLÉICOS A dupla hélice apresenta dois tipos de sulcos aos quais se ligam as proteínas da cromatina. Sulco menor Sulco maior ÁCIDOS NUCLÉICOS • RNA - Molécula constituída por um única cadeia de nucleotídeos. - Estão presentes as bases nitrogenadas A, C, G e U. -Podem ser de três tipos principais: RNAm, RNAt, RNAr. ÁCIDOS NUCLÉICOS • RNA -RNAm: carrega uma mensagem específica do DNA até o citoplasma. Ex: computador (DNA) pen drive (RNAm). -RNAr: liga-se a proteínas para compor os ribossomos (síntese protéica). -RNAt: transporta os aminoácidos no citoplasma que se juntarão para formar uma nova cadeia de polipeptídeos. RNA CÓDIGO GENÉTICO -Foi decifrado completamente em 1966. -Corresponde a relação entre a seqüência de bases no DNA e a seqüência de aminoácidos na proteína. - Características: 1. Todos os aminoácidos são codificados por uma combinação de três bases do DNA: códon. 2. Um mesmo aminoácido pode ser definido por mais de um códon e por isso, é dito degenerado. CÓDIGO GENÉTICO - Características: 3. Cada códon corresponde a somente um aminoácido. 4. O código genético é o mesmo nos mais diversos organismos. 5. Pareamento códon (RNAm) : anticódon(RNAt). 6. Há um códon iniciador: AUG –metionina e três códons de parada: UAA, UAG e UGA. CÓDIGO GENÉTICO Como descobriram que o DNA era o material genético da célula? Experimento de Hershey e Chase - Em 1952: identificação do DNA como material hereditário. - A experiência foi realizada com bactérias e bacteriófago T2. Situação A - DNA dos fagos marcado com o isótopo radioativo (32P). Situação B - Os capsídeos dos fagos foram marcados com o isótopo radioativo (35S)- cisteína e metionina. Experimento de Hershey e Chase Experimento de Hershey e Chase Experimento de Hershey e Chase Experimento de c e Chase http://www.educacaopublica.rj.gov.br/oficinas/biologia/experimentos1/o_ex perimento_de_hershey_e_chase.php -Estudos bioquímicos (Regras de Chargaff) e técnicas físicas: análise por difração de raios X. Maurice Wilkins e Rosalind Franklin DNA tinha uma estrutura helicoidal - Descoberta da estrutura do DNA - 1953: Descrição da estrutura física do DNA. - -DNA: 2 formas diferentes: A e B. - Tipo A: fibras de DNA desidratadas. - Tipo B: fibras molhadas de DNA. padrão compatível com uma hélice. - A água poderia ser atraída pelo grupo fosfato presente no DNA. Descoberta da estrutura do DNA - 1953: Descrição da estrutura física do DNA. - -Sugeriu que os fosfatos localizavam-se no exterior da hélice e as bases nitrogenadas estavam voltadas para o interior. Descoberta da estrutura do DNA Descoberta da estrutura do DNA Molécula de DNA - 1953: Watson e Crick - propuseram o modelo da molécula de DNA. Molécula de DNA - 1953: Watson e Crick - A molécula de DNA é constituída por duas cadeias polinucleotídicas dispostas em hélice ao redor de um eixo imaginário, girando para a direita. Molécula de DNA - 1953: Watson e Crick - Dogma central da Biologia Replicação do DNA Replicação do DNA • Processo que precede a divisão celular e através do qual são geradas cópias idênticas das moléculas de DNA presentes na célula- mãe, a seguir herdadas pelas duas células filhas. TIPOS DE REPLICAÇÃO TIPOS DE REPLICAÇÃO EXPERIMENTO DE MESELSON-STAHL ubsequentes. Se as duas cadeias polinucleotídicas de uma molécula de DNA fossem marcadas, seria possível fazer uma previsão sobre o destino dessas cadeias no decorrer das gerações celulares subsequentes. EXPERIMENTO DE MESELSON-STAHL ubsequentes. Segundo a previsão: a) após uma replicação, ambas as moléculas filhas estariam marcadas e cada uma delas conteria metade da marcação da molécula mãe original. b) após duas replicações, metade das moléculas estaria marcada e, a outra metade não. EXPERIMENTO DE MESELSON-STAHL 1ª primeira experiência: Cultivaram Escherichia coli em meios de cultura diferentes:Verificaram que as bactérias cultivadas em 15N incorporam esse nitrogênio nos seus nucleotídeos formando um DNA com maior densidade, que se deposita mais próximo do fundo do tubo. EXPERIMENTO DE MESELSON-STAHL ubsequentes. 2ª primeira experiência: Cultivaram Escherichia coli em meio de cultura com 15N. Após várias gerações de bactérias terem se desenvolvido no meio com nitrogênio pesado, foram transferidas para um meio de cultura com nitrogênio normal (14N). as bactérias com nitrogênio pesado utilizaram o nitrogênio normal para produzirem novas cadeias de DNA. EXPERIMENTO DE MESELSON-STAHL G1: 20 mim G2: 40 mim 14N: vermelho/ leve 15N: azul/pesado 100%: 15N 100%: 15N/14N 50%: 14N 50% : 15N/14N EXPERIMENTO DE MESELSON-STAHL EXPERIMENTO DE MESELSON-STAHL Os resultados da experiência de Meselson e Stahl apoiaram o modelo de replicação semiconservativa, que se processa segundo a regra da complementaridade das bases. Regras da Replicação 1. A replicação é um processo semi-conservativo . Regras da Replicação 2. A replicação tem início em uma origem e depois procede bidirecionalmente. Regras da Replicação 3. A síntese de DNA é feita na direção 5´ 3´ e é semidescontínua. Enzimas envolvidas na Replicação 1. Nucleases 2. DNA polimerases 3. Helicases 4. Topoisomerases 5. SSB 6. Primases 7. DNA ligase Enzimas envolvidas na Replicação 1. Nucleases - São enzimas que tem a capacidade de clivar ácidos nucléicos, sendo, portanto, responsáveis pela degradação do DNA. - Duas classes: exonucleases e endonucleases. Degradam ácidos nucléicos a partir da extremidade da molécula. Degradam a partir de qualquer local da molécula de DNA. Enzimas envolvidas na Replicação 2. DNA polimerases - São as principais enzimas envolvidas na replicação, uma vez que adicionam nucleotídeos e participam do sistema de reparo. - Não são capazes de iniciar síntese sozinhas. Precisam de 3’ OH livre fornecido pelo iniciador (primer). Enzimas envolvidas na Replicação 2. DNA polimerases - Acrescentam nucleotídeos à fita recém sintetizada obedecendo o pareamento de bases com a fita molde. DNA Polimerase em E. coli (procariotos) Tipo Função DNA Polimerase I Catalisa o crescimento da cadeia no sentido 5´3´ Atividade de exonuclease 3´5´ e 5´3´ Preenche pedaços pequenos de DNA durante a replicação e processo de reparo DNA Polimerase II Polimerase alternativa de reparo, mas também pode replicar DNA quando o filamento molde é danificado DNA Polimerase III Catalisa o crescimento da cadeia no sentido 5´3´. É a polimerase primária durante a replicação normal do DNA DNA polimerase em eucariotos DNA Polimerase em eucariotos Função DNA Polimerase α (alpha) Replicação do cromossomo nuclear (fita lagging) DNA Polimerase β (beta) Reparo de DNA no preenchimento de espaços do cromossomo nuclear. Análoga a Polimerase I DNA Polimerase γ (gama) Replicação de DNA mitocondrial DNA Polimerase δ (sigma) Replicação do filamento leader a da lagging do cromossomo nuclear DNA Polimerase ε (epsilon) Reparo do DNA do cromossomo nuclear DNA Polimerase ζ (zeta) Aparentemente reparo de DNA Enzimas envolvidas na Replicação 3. Helicases - Fazem a separação das duas fitas parentais para que a replicação possa ter início. 4. Topoisomerase -Aliviam a tensão após a separação pela helicase. Enzimas envolvidas na Replicação 5. SSb (single strand binding) - São também chamadas de proteínas de ligação do DNA de fita simples e mantém as duas fitas separadas estabilizadas. 6. Primase - Sintetizam a pequena porção de RNA que servirá como primer para início da replicação. Enzimas envolvidas na Replicação Enzimas envolvidas na Replicação 5. DNA ligase. - Responsável por unir os fragmentos de Okasaki gerados na fita descontínua. Enzimas envolvidas na Replicação Etapas da Replicação 1- Origem de Replicação 2- Extensão 3- Finalização Origens de replicação Locais com um contexto de sequência específico. Ligam proteínas específicas. Quando acionadas, essas proteínas permitem o início da replicação. Replicon: 1. Ativados apenas uma única vez em cada ciclo celular. 2. O genoma de uma célula procariótica contêm um único replicon. 3. Cada cromossomo eucariótico possui vários replicons e todos são ativados uma única vez no ciclo celular . Origem de Replicação Procariotos Há uma única origem por cromossomo e controla a replicação de todo o cromossomo. Origem de Replicação Procariotos Origem de Replicação em Eucariotos Os cromossomos lineares grandes possuem muitas origens. Requerimentos para a extensão do DNA 1. dNTPs 2. Iniciador (extremidade 3´OH livre) 3. Molde (pareamento Watson-Crick) 4. Mg2+ EXTENSÃO - Envolve duas operações distintas, mas relacionadas: 1. Síntese da fita contínua (leading): sentido 5’ 3’. 2. Síntese da fita descontínua (lagging): sentido 3’ 5’. cresce pela síntese de fragmentos curtos. fragmentos de Okasaki - Proteínas de iniciação identificam a origem da replicação e participam da ligação da DNA helicase ao DNA. - A proteína de iniciação acoplada à DNA helicase abre o DNA na junção “Y”. As pontes de H se rompem e a molécula se abre como um zíper e se desespiraliza e a ela unem-se a primase. - As fitas se mantêm separadas durante a replicação graças à ação de uma proteína a Single-strand binding proteins – SSB. A replicação da fita contínua A replicação da fita contínua A replicação da fita contínua - A primase (que é uma RNA-polimerase) constrói o primer de RNA em uma região não coberta pelas SSB. - A topoisomerase alivia a tensão da espiralização provocada pela abertura do DNA . - A DNA polimerase (III) sintetiza as novas cadeias. Elas capturam os nucleotídeos prontos com um trifosfato, os levam ao molde, retiram dois fosfatos e os ligam ao C 3’ do nucleotídeo anterior. A replicação da fita descontínua - Os Fragmentos de Okazaki (complementam o filamento lagging). -É formado um primer de RNA pela enzima Primase. - Os primers são continuados pela DNA polimerase III até o primer do próximo fragmento de Okasaki. -DNA polimerase I retira o primer de RNA e completa o pedaço com nucleotídeos corretos. - Os fragmentos são ligados pelas DNA ligases. EXTENSÃO EXTENSÃO EXTENSÃO A síntese de cada fragmento de Okazaki termina quando a polimerase do DNA atinge o primer de RNA ligado à extremidade 5´ do fragmento sintetizado anteriormente. EXTENSÃO TERMINAÇÃO -Procariotos: DNA circular, quando as duas forquilhas de replicação se encontram ela termina. -Eucariotos: síntese das partes terminais dos cromossomos, chamadas telômeros. Várias cópias de uma seqüência consenso, as quais são adicionadas por uma enzima específica (telomerase) na fitatardia, quando a replicação estiver próxima ao final. Na fita líder, a terminação ocorre naturalmente quando ao final do molde parental.
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