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1 Ácidos Nucléicos Todas as células dos seres vivos possuem DNA e RNA, com exceção dos vírus que não são organismos celulares e possuem DNA ou RNA em sua composição, nunca os dois ao mesmo tempo. O DNA difere do RNA em vários aspectos que vão desde a composição molecular, forma estrutural, função e mecanismo de síntese. DNA e RNA: principais moléculas informativas das células. DNA: única função de material genético. RNAs: podem catalisar várias reações químicas (ribozimas) RNA - Diferentes tipos: RNAm: carrega informação do DNA aos ribossomos servindo como molde para a síntese proteica. RNAt e RNAr: envolvidos na síntese proteica. DNA RNA Proteínas Transcrição Tradução Genes: sequencia específica de nucleotídeos, que codifica informações necessárias para a síntese de proteínas Quimicamente, os ácidos nucléicos são polímeros de nucleotídeos unidos por ligações do tipo fosfo-di-éster, formando uma molécula polimérica. Nucleotídeos são as unidades básicas dos ácidos nucléicos e são formados, sempre, por uma molécula de pentose que se liga a uma molécula de base nitrogenada e uma molécula de fosfato em pontos específicos e de maneira covalente, adquirindo forma estrutural helicoidal própria e característica do tipo de molécula. 2 A união das bases nitrogenadas à pentose, somente, forma um nucleosídeo, ou seja, um nucleotídeo desprovido de fosfato. A pentose (monossacarídeo de 5 carbonos) pode ser a ribose (no RNA) ou a desoxirribose (no DNA) ambas em sua forma cíclica pentagonal de furanose 3 As bases nitrogenadas presentes nos ácidos nucléicos são de dois tipos: as bases púricas, purínicas ou simplesmente, purinas e as bases pirimídicas, pirimidinicas ou pirimidinas A ligação entre os nucleotídeos ocorre, portanto, através de ligações covalentes extremamente fortes tendo um grupamento fosfato como ligante, as ligações fosfo-di- éster. Essas ligações garantem um "esqueleto" covalente rígido para a molécula de ácido nucléico, que é clivado sob ação de enzimas hidrolíticas denominadas de nucleases (DNase e RNase). A ligação entre as moléculas de nucleotídeos que permite a polimerização e a estrutura final do DNA e do RNA ocorre entre a hidroxila do C3' de um nucleotídeo com o fosfato e a hidroxila do C5' do outro nucleotídeo, de forma que sempre o C5' do primeiro nucleotídeo terá um fosfato livre, enquanto que o último nucleotídeo adicionado terá sempre -OH livre no C3'. 4 Esta uniformidade na configuração da cadeia polimérica de nucleotídeos, tanto de DNA quanto de RNA, confere uma direção à molécula onde é convencionado que o primeiro nucleotídeo de uma determinada sequência é o que tem a extremidade 5' livre, enquanto que o último terá a extremidade 3' livre. 5 Estrutura molecular do DNA As duas cadeias são antiparalelas (opostas entre si) e estão unidas por ligações de hidrogênio. As ligações de hidrogênio são bem mais fracas do que a ligação covalente do esqueleto pentosefosfato, fazendo delas o alvo do processo de divisão celular, pois a molécula de DNA pode ser quebrada em dois moldes (uma paralela a outra) e depois ser reconstruída em duas novas moléculas idênticas. A construção de uma cadeia polimérica de DNA requer que as duas cadeias alinhem-se de forma que as bases nitrogenadas adenina só podem ligar-se à timina, através de duas ligações de hidrogênio, enquanto que citosina liga-se somente com guanina através de três ligações de hidrogênio. Ligação de Hidrogênio 6 Estrutura primária do DNA A união dos nucleosídeos através de grupos fosfato monta o esqueleto da molécula de DNA, que conecta o grupo 5’-hidroxila de uma unidade ao grupo 3’-hidroxila da unidade seguinte. 7 Estrutura secundária do DNA A forma estrutural final da molécula de DNA é representada por uma dupla hélice em espiral comparada a uma escada em espiral, onde o corrimão da escada representa a pentose unida pela ligação fosfo-di-éster, enquanto que os degraus correspondem às bases nitrogenadas unidas por ligações de hidrogênio. As sequências de DNA onde há muitas ligações entre guanina e citosina (GC) são mais resistentes, devido ao maior número de ligações de hidrogênio formadas. Ligações hidrofóbicas e forças de Van der Waals também estabilizam a estrutura do DNA. Fatores que estabilizam a dupla hélice: • interações hidrofóbicas • forças de van der Walls • ligações de hidrogênio 8 • interações iônicas Ao elucidarem a estrutura secundária do DNA em 1953, Watson e Crick propuseram o arranjo de hélice dupla para a molécula de DNA, onde se destacam a cavidade maior e a cavidade menor, indicadas abaixo. O DNA pode adotar várias estruturas secundárias diferentes. Essas estruturas vão depender da sequência de bases e das condições em que elas são colocadas: DNA B: predominante nas células, giro da hélice para a direita DNA Z: as bases purínicas e piridímicas se encontram alternadas, giro da hélice para a esquerda Estrutura terciária do DNA Superenrolamento: a molécula de DNA apresenta um comprimento consideravelmente maior que o seu diâmetro, não sendo totalmente rígida, podendo dobra-se sobre si mesma. Desnaturação e renaturação do DNA As duas fitas da dupla hélice podem ser reversivelmente separadas quando as ligações de hidrogênio são rompidas Separação das fitas é denominada “FUSÃO” da molécula de DNA Quanto maior porcentagem de pares GC, mais difícil é a desnaturação. 9 Agentes de desnaturação do DNA Temperatura (calor) Soluções alcalinas Dupla Hélice DNA Separação da dupla- hélice DNA Dupla Hélice DNA 10 RNA- ácido ribonucleico A forma estrutural do RNA é de uma fita simples em espiral que se arranja, na maioria das vezes, formando pregas entre si, em virtude de ligações de hidrogênio ocorridas entre as bases nitrogenadas dos nucleotídeos da própria cadeia. Estas pregas dão a conformação de um grampo de cabelo (hairpins) às regiões onde ocorrem. 11 Existem três tipos básicos de RNA: mensageiro (RNAm), transportador (RNAt) e ribossômico (RNAr). RNAt e RNAr: existem as pregas RNAm: não possui tais grampos, devido a necessidade estar linear para ser “lido” pelos ribossomos durante a síntese proteica RNA mensageiro RNA mensageiro (RNAm): atua transferindo a informação contida no DNA para a síntese de proteínas nos ribossomos. Transcrição de uma das cadeias da hélice de DNA RNA transportador Realiza o transporte dos aminoácidos para a síntese protéica mediada pelo RNAm. Existem 20 tipos de RNAt (um para cada aminoácido), possuindo quatro domínios comuns: o ponto de ligação com o aminoácido na extremidade 3’ a alça D, com a presença do nucleotídeo diidrouridina (formado por hidroxilação da uracila) a alça T com a presença de timina formada por metilação da uracila (chamada de ribotimidina) 12 a alça do anticódon, que possui a sequência que se ligará ao RNAm no ribossomo durante a síntese protéica. Ainda se observa no RNAt a presença de outras bases modificadas como a pseudouridina(Ψ) e, algumas vezes, um mesmo tipo de RNAt pode apresentar ou C ou G em áreas em que não há formação de pregas, representado na estrutura simplesmente como uma pirimidina (Y). Reconhece determinados locais na molécula de RNAm (códon) → →→ → RNAt (anti-códon) → →→ → sequencias complementares 13 RNA ribossômico O RNAr (ribossômico) faz parte da composição molecular dos ribossomos, local da síntese protéica, onde se acopla o RNAm e, posteriormente, os aminoácidos. Possui uma estrutura extremamente pregueada onde se revelam domínios são responsáveis pela estrutura tridimensional final dos ribossomos Todos os RNAs estão envolvidos ativamente na síntese protéica. O RNAm será usado para transferir a informação genética do DNA às proteínas, mas os demais RNAs sintetizados têm, por si, funções finais na célula, tanto estruturais como catalíticas. Transcrição é o processo pelo qual uma molécula de RNA é sintetizada a partir de um molde de DNA. Através da transcrição, são sintetizados todos os tipos de RNAs da célula, ou seja, o RNA mensageiro (mRNA), o RNA ribossômico (rRNA), o RNA transportador (tRNA) e outros RNAs menores. 14 Estudo dirigido 1) Explique quimicamente o que são os ácidos nucléicos, quais as diferenças entre DNA e RNA 2) Explique a estrutura molecular do DNA 3) O que são os genes? 4) O que são as estruturas primárias e secundárias do DNA? 5) Quais fatores estabilizam a dupla hélice do DNA? 6) Explique o que é a desnaturação do DNA e quais fatores podem ocasionar esta desnaturação? 7) Qual a forma estrutural do RNA, como se formam as pregas? 8) Quais os tipos de RNA e quais apresentam pregas? 9) Explique o que é o códon do RNA mensageiro 10) Qual a função do RNA mensageiro? 11) Qual a função do RNA transportador? 12) O que é a replicação do DNA? 13) O que é o processo de transcrição? 14) O que é o processo de tradução?
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