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DNA RNA protein Expressão gênica em procariotos x eucariotos - membrana nuclear: ausente presente - cromatina: ausente presente - transcrição: policistrônica monocistrônica - presença de operons: presente ausente - RNA polimerase:holoenzima + sigma multimérica - afinidade por DNA: alta baixa - fatores de transcrição: ausente vários fatores - transdução de sinal: ausente vários mecanismos - processamento do RNA: ausente presente - níveis de controle: transcricional vários Estrutura do genoma em eucariotos e procariotos Níveis de Controle da expressão gênica • Pre-transcricional (modificações da cromatina) • Transcricional • Post-transcricional - Processamento do mRNA - Transporte núcleo/citoplasma do mRNA - Estabilidade/degradação do mRNA - Trandução - Modificação na proteína • Papel estrutural: empacotamento do DNA no núcleo • papel regulatório: controle do acesso da maquinaria de transcrição: Exemplo: histonas acetilases histonas desacetilases Ligação de fatores de transcrição e Acetilação de histonas desempacotamento da cromatina ativação da expressão gênica Histonas desacetiladas cromatina fechada expressão gênica inativa Papel estrutural e regulatório da cromatina + +/- + - + Diminuição das cargas positivas das histonas por modificação de Lys X Menor interação DNA-histona Ativação do gene Elementos em cis controlam a transcrição de genes eucariotos Iniciação da transcrição Estruturas similares de ativadores/repressores procarióticos dedos de zindo hélice loop hélice ziper de leucina hélice volta hélice Motivos estruturais de fatores de transcrição eucarióticos Diferenças na expressão gênica: genes com splicing alternativo Cromossomo 22 humano: 59% dos genes sofrem splicing alternativo (média de 2,6 transcritos/gene) WT1 (Wilms Tumor) gene: Zn finger com 24 isoformas: splicing alternativo exons 5 e 9 códons de iniciação alternativos Processamento alternativo do gene WT1 Processamento alternativo do mRNA e a determinação de sexo em Drosophila Transporte de mRNAs para o citosol • Células eucarióticas: mecanismos de controle de qualidade reconhecem e degradam mRNAs aberrantes • NMD – decaimento mediado por mutações nonsense: relação espacial entre o códon de terminação e outras características do RNA Behm-Ansmant, et al, 2007 • NMD acelera deadenilação, decapping e clivagem endonucleotídica • Leveduras: decapping independente de deadenilação • P-bodies • Aglomerados de mRNPs não tradutores • Controle traducional • Armazenamento de mRNA tamanho e número -enzimas decapping – Dcp1 e Dcp2 -ativadores de decapping – Dhh1p, Pat1p e Lsm-7p - exonuclease 5’-3’ Xrn1p Em procariotos: mRNA policistrônico, várias ORFs, cada uma c/ RBS (sítios de entrada do ribossomo) Em eucariotos: mRNA monocistrônico, interação entre proteínas que se ligam a cauda poliA e proteínas do Complexo de Iniciação Controle traducional
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