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Disciplina: Bioquímica Básica Prof. Edézio Ferreira da Cunha Júnior Contato: prof.edezio.cunha@celsolisboa.edu.br Introdução a Bioquímica Objetivo: Entender as funções químicas orgânicas e inorgânicas importantes para o estudo da Bioquímica 1 EMENTA: Introdução ao estudo de bioquímica. Componentes da matéria viva. Estudo das macromoléculas. Bioquímica do sangue. Equilíbrio ácido-base e enzimas. Metabolismo básico de carboidratos. OBJETIVO GERAL: Conhecer as principais características estruturais e funcionais das biomoléculas sustentando a sua complexidade e articulando conhecimentos de química geral e orgânica, promovendo assim o início do estudo da bioquímica fornecendo as bases conceituais para bioquímicas posteriores. Apresentação: 2 Bibliografia Básica: 1. LEHNINGER, Albert L.; NELSON, David L.; COX, Michael M. Princípios de bioquímica de lehninger. 6.ed. Porto Alegre: Artmed, 2014. 1298 p. 2. STRYER, Lubert; BERG, Jeremy M; TYMOCZKO, John L. Bioquímica. 7.ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2014. 1162 p. 3. MURRAY, Robert K. et al. Bioquímica Ilustrada de Harper. 29.ed. Porto Alegre: AMGH, 2014. 818 p. Bibliografia Complementar: 1. VOET, D.; VOET, J. G.; PRATT, C. M. Fundamentos de Bioquímica: a vida em nível molecular. 4ª edição, Porto Alegre, Artmed, 2014. 2. VIEIRA, E.C.; GAZZINELLI, G.; MARES-GUIA, M. Bioquímica celular e biologia molecular. São Paulo: Atheneu, 2002. 3. ATKINS, P.; JONES, L. Princípios de Química: questionando a vida moderna e o meio ambiente. 3a ed. Porto Alegre: Bookman, 2006. 4. MOTTA, V. T. Bioquímica Clínica para o Laboratório: Princípios e Interpretações. 5ª edição, São Paulo: MedBook, 2009. 5. BAYNES, John W.; DOMINICZAK, Marek H. Bioquímica médica. Rio de Janeiro: Elsevier, 2010. 653 p. ISBN 978-85-352-3561-6. Apresentação: 3 Fundamentos da Bioquímica Fundamentos celulares Fundamentos químicos Fundamentos físicos Fundamentos genéticos Fundamentos evolutivos Bioquímica: Descreve em termos moleculares as estruturas, os mecanismos e os processos químicos compartilhados por todos os organismos e estabelece princípios de organização que são base da vida em todas as suas diversas formas, princípios esses referidos como a lógica molecular da vida. Características peculiares aos organismos vivos: Alto grau de complexidade química e organização microscópica; Sistemas para extrair, transformar e utilizar energia do ambiente; Funções definidas para cada um dos componentes de um organismo e interações reguladas entre eles; Mecanismos para sentir e responder às alterações no seu ambiente; Capacidade de auto replicação e automontagem precisa; Capacidade de se alterar ao longo do tempo por evolução gradual. Fundamentos da Bioquímica Introdução a Bioquímica: Fundamentos da Bioquímica Introdução a Bioquímica: Introdução a Bioquímica: Hierarquia estrutural na organização molecular das células. Introdução a Bioquímica: 8 ABC da bioquímica Introdução a Bioquímica: Grupos funcionais presentes nas biomoléculas Hidrocarbonetos Grupamentos contendo oxigênio Grupamentos contendo nitrogênio Grupamentos contendo enxofre Grupamentos contendo fosfato Grupos funcionais presentes nas biomoléculas (cont.) Menos de 30 entre os mais de 90 elementos químicos de ocorrência natural são essenciais para os organismos; Introdução a Bioquímica: Os quatro elementos químicos mais abundantes nos organismos vivos, em termos de porcentagem do total de número de átomos, são: hidrogênio, oxigênio, nitrogênio e carbono. 12 99,4% 0,6% Composição percentual elementar do corpo humano macroelementos microelementos (oligoelementos) Tanto os macroelementos como os oligoelementos são igualmente essenciais à vida!!! Abundância relativa dos elementos (%) CrostaTerrestre Corpo Humano O 47,0 H 63,0 Si 28,0 O 25,5 Al 7,9 C 9,5 Fe 4,5 N 1,4 Ca 3,5 Ca 0,31 Na 2,5 P 0,22 K 2,5 Cl 0,08 Mg 2,2 K 0,06 Ti 0,46 S 0,05 H 0,22 Na 0,03 C 0,19 Mg 0,01 Introdução a Bioquímica: RESUMO DO SLIDE A composição elementar dos organismos vivos é bem diversa da do ambiente de onde eles retiram esses elementos. C, H, O e N juntos somam mais de 99% da biomassa. Os microelementos, embora usados em pequena quantidade, são indispensáveis à vida 13 Introdução a Bioquímica: Introdução a Bioquímica: Introdução a Bioquímica: Classes de Biomoléculas Existem 4 classes de macromoléculas na bioquímica, cada uma formada por seu respectivo conjunto de blocos construtivos. Proteínas Polissacarídeos Ácidos nucléicos Lipídeos UNIDADE EXEMPLO insulina RNA (ácido ribonucléico) celulose Triacilglicerol CLASSE Amino ácido nucleotídeo açúcar Ácido graxo (também glicerol e outros componentes) 17 Composição percentual de biomoléculas numa célula bacteriana (ex: E. coli) % do peso total Número aproximado de espécies moleculares diferentes Água 70 1 Proteínas 15 3.000 Ácidosnucléicos DNA 1 1-4 RNA 6 >3.000 Polissacarídeos 3 ~10 Lipídeos 2 ~20 Monômerose intermediários 2 ~500 Íoninorgânicos (Ca2+, Na+, K+, PO42-...) 1 ~20 Introdução a Bioquímica: 18 Escala de tamanho das estruturas biológicas Metro (m) 100 metro Milímetro (mm) 10-3 metro Micrômetro (mm) 10-6 metro Nanômetro (nm) 10-9 metro alanina (0,5nm) glicose 0,7nm Mitocôndria 1,5mm Hemácia 9mm Humano 1,7 m Hemoglobina 6,8nm Célula do fígado 20mm Vírus FX-174 25nm Introdução a Bioquímica: Funcionalidade nos sistemas biológicos Nos sistemas biológicos tudo tem função desde membros, órgãos e tecidos Olhosvisão Pernaslocomoção Intestinodigestão Isso também é verdade a nível celular Eritrócitos (hemácias, células vermelhas do sangue)transporte de O2 Neurôniossinalização e processamento nervoso E também é verdade no nível molecular. Tanto para moléculas como para vias metabólicas Anticorpos(proteínas) Enzimas(proteínas) Glicose Via glicolítica Via da biossíntese de glicogênio Resposta imune Catálise Combustível biológico Obtenção de energia pela oxidação da glicose Armazenamento de combustível na forma de glicogênio Introdução a Bioquímica: 20 Origem das biomoléculas Aparelho para demonstrar a abiótica formação de biomoléculas simulando as condições da atmosfera primitiva Mistura de NH3 (amônia) H2(hidrogênio) CH4 (metano) e água 80oC Centelhas Condensador Eletrodos Compostos produzidos neste experimento Glicina (aminoácido) Alanina (aminoácido) Acido a-aminobutírico N-metil alanina Ác. Aspártico (aminoácido) Ác. glutâmico (aminoácido) Ác. Acético Ác succínico (intermediário do ciclo de Krebs) Uréia ...muitos outros 21 Um esquema possível para a evolução molecular Surgimento do genoma de DNA Desenvolvimento de um sistema de tradução primitivo. Genoma de RNA e catalizadores RNA-Proteína Co-evolução do RNA e das proteínas Síntese de peptídeos catalisada por RNA Surgimento de moléculas de RNA com atividade catalítica auto-replicativa Produção de pequenas moléculas de RNA com seqüências aleatórias “Sopa” pré-biótica contendo diversas biomoléculas originadas de precursores na atmosfera primitiva 4,5 Bilhões de anos Surgimento da Terra 3,5 Bilhões de anos Primeiro microorganismo fóssil 4,0 Bilhões de anos Formação dos oceanos e continentes 22 Obrigado! Prof. Edézio Ferreira da Cunha Júnior Contato: prof.edezio.cunha@celsolisboa.edu.br 23
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