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P r o f . E s p . L u c a s M a n o e l L i m a S a n t o s MOLÉCULAS DA VIDA E SUAS TRANSFORMAÇÕES UNIVERSIDADE ESTADUAL DO PARÁ CENTRO DE CIÊNCIAS SOCIAIS E EDUCAÇÃO CURSO DE LICENCIATURA PLENA EM CIÊNCIAS NATURAIS Conceição do Araguaia – PA, Março de 2014. Os Genes Os genes são os segmentos funcionais do DNA; Conforme o objetivo do estudo, os genes podem ser analisados por três ângulos diferentes: O molecular, o mendeliana e o populacional. A biologia celular - que os estuda do ponto de vista molecular - define os gene como "a seqüência de DNA que contém as informações necessárias para produzir uma molécula de RNA e, se esta corresponder a um RNA mensageiro, a partir dele elaborar uma proteína". Calcula-se que existam cerca de 30.000 genes distribuídos nos 46 cromossomos das células humanas. Os Genes Cada gene está localizado em um local particular do cromossomo chamado locus. Cada laço, formado quando a cromatina de 30 nm se dobra, poderia corresponder a um gene. No total, os genes envolvem cerca de 10% do DNA nuclear, mas o significado da maior parte do DNA restante é ignorado. Os Genes Os genes não dirigem apenas a síntese das moléculas de RNA. Como o restante do DNA, antes que as células somáticas se dividam, eles se replicam, isto é, sintetizam moléculas de DNA complementares que se repartem nas células-filha com a final idade de se autoperpetuar. De modo complementar, pela forma como as células de DNA se replicam durante a meiose e se distribuem nas células germinativas, os genes constituem as entidades biológicas pelas quais são transmitidos os caracteres físicos dos pais aos filhos. Além disso, as mutações que os genes acumulam ao longo do tempo podem resultar benéficas para a evolução da espécie. Os Genes Como as informações genéticas depositadas nas moléculas de DNA estão localizadas no núcleo (à exceção do DNA mitocondrial) e a síntese protéica - baseada nessa informação - ocorre no citoplasma, é necessário que essa informação seja transferida do núcleo ao citosol. Tal transferência é um processo complexo que necessita da intervenção de uma molécula intermediária. Trata-se do RNA mensageiro (RNAm) que copia a informação contida no DNA e sai para o citosol, onde dirige a síntese da proteína. Os Genes Desta forma, no núcleo, o DNA determina a seqüência dos nucleotídeos do RNAm e, no citoplasma, o RNAm estabelece a ordem dos aminoácidos da proteína (Fig. 13.2). A síntese do RNA, que como acabamos de ver usa como molde um DNA; é denominada transcrição do DNA; Enquanto a síntese da proteína, cujo molde é o RNAm leva o nome de tradução do RNAm. Este fluxo de informações é conhecido como o "dogma central" da biologia molecular (Fig. 13.3). Os Genes As metáforas utilizadas para definir ambas as etapas são bastante adequadas: já que transcrição significa "cópia ou reprodução literal de um original" (o RNA se parece com o DNA) e tradução indica "escritura ou expressão em uma linguagem daquilo que anteriormente foi escrito ou expressado em outra" (é o que ocorre entre a proteína e o RNAm). Com relação a replicação do DNA, significa "cópia que reproduz com exatidão o original", que é o que faz o DNA quando se duplica; Os Genes Ao definir o gene como uma região do DNA que gera um caráter físico hereditário, sugere-se que cada gene dá lugar a uma única classe de proteína. Embora a maioria dos genes que produzem RNAm se conduza dessa maneira, alguns dão origem a poliproteínas, ou seja, produtos transitórios que se escondem em várias proteínas, cada uma determinante de um traço físico singular. Os Genes A célula produz vários tipos de RNA Existem três tipos de RNA principais: os já mencionados RNA mensageiros ou RNAm, que recolhem a informação dos genes e dirigem a síntese das proteínas; os RNA ribossômicos ou RNAr, que são fundamentalmente estruturais, e os RNA de transferência ou RNAt, que atuam como adaptadores. A síntese protéica (ou tradução do RNAm) ocorre no interior de células, estruturas citosólicas pequenas chamadas ribossomas, que constam de quatro RNAr diferentes entre si e numerosas proteínas. Os Genes Sob a direção de um RNAm ocorrem nos ribossomas as reações químicas que ligam os aminoácidos de cada proteína. A tradução necessita da participação dos RNAt, dos quais existem vários tipos, todos de tamanho pequeno, que se encarregam de transladar os aminoácidos para o ribossomo, seguindo a ordem que marca as informações genéticas do RNAm. Os Genes Além desses três tipos de RNA, existem os seguintes, o primeiro e o último localizados no citosol e os restantes no núcleo: O RNA citosólico pequeno ou RNAcp (em inglês, small cytosolic RNA), Os RNA nucleares pequenos ou RNAnp (em inglês, small nuclear RNA) que fazem parte de certas ribonucleoproteínas chamadas RNPnp. Estas moléculas desempenham funções importantes durante o processamento dos RNAm. Os RNA nucleolares pequenos ou RNAnop (em inglês, small nucleolar RNA), que fazém parte de certas ribonucleoproteínas chamadas RNPnop. Estas moléculas intervêm no processamento dos RNAr. Os Genes O RNA de inativação do cromossomo X ou RNAxist (em inglês, X- inactivation specific transcript RNA); O RNA da telomerase ou RNAte (em inglês, telomerase RNA), que faz parte de um complexo ribonucleoprotéico; Os microRNA (em inglês, microRNA ou miRNA); Os Genes Os transcritos primários são processados no núcleo As moléculas de RNA surgidas da transcrição do DNA são chamadas de transcritos primários. Convertem-se em RNA funcionais antes de sair do núcleo, ao fim de várias modificações, conhecidas pelo nome de processamento do RNA. Os Genes O processamento mais conhecido é o dos transcritos primários dos RNAm; Que contêm segmentos não funcionais intercalados com segmentos que contêm a informação genética que codifica a proteína. Os primeiros são denominados íntrons, os segundos éxons. O processamento remove os íntrons e conecta os éxons entre si, dando lugar a um RNAm com informações genéticas contínuas, apto para dirigir a síntese da proteína. Os Genes Cada aminoácido é codificado por uma trinca de nucleotídeos Devido ao fato de um gene ser um segmento de DNA que contém a informação necessária para gerar um RNA ou uma proteína, dizemos que ele codifica essas duas moléculas. O termo "codifica" é empregado porque as instruções que se trasladam do DNA para o RNA é no caso do RNAm - deste à proteína são transmitidas sob a forma de código. Os Genes Recordemos que tanto os ácidos nucléicos (DNA, RNA) como as proteínas são moléculas formadas por sequencias de monômeros (nucleotídeos nos ácidos nucléicos e aminoácidos nas proteínas) dispostos em linha. O sistema de códigos se baseia na disposição ordenada dos nucleotídeos no DNA, os quais determinam o ordenamento dos nucleotídeos no RNA. Por sua vez, os nucleotídeos do RNAm determinam o ordenamento dos aminoácidos na proteína. Os Genes Como no processo das informações genéticas, cada nucleotídeo é representado por uma letra: A, G, C ou T no DNA; A, G, C ou U no RNA; O alfabeto contido nas moléculasde DNA ou de RNA - por ter quatro letras somente - não é suficiente para simbolizar os 20 tipos de aminoácidos que podem ser encontrados numa proteína. As células resolvem o problema utilizando grupos de três nucleotídeos - em diferentes combinações - para codificar cada aminoácido. Os Genes Estas trincas de nucleotídeos são denominadas códons. Tendo em vista que há quatro tipos de nucleotídeos, o número de trincas possível, ou seja, de códons, é de 64 (4³ = 64). O conjunto de 64 códons leva o nome de código genético. Os Genes Existem 61 códons para codificar os 20 tipos de aminoácidos Como se utilizam 61 dos 64 códons para codificar os 20 tipos de aminoácidos, a maior parte deles pode ser codificada por mais de um códon, condição que levou a se dizer que existe uma "degeneração" no código genético. Os códons que codificam o mesmo aminoácido chamam-se "sinônimos". Somente a metionina e o triptofano, que são os aminoácidos menos comuns das proteínas, são especificados por um único códon. Os Genes Os três códons que não codificam aminoácidos (UAA, UGA e UAG) têm como função: uma vez que a cadeia polipeptídica incorporou o último aminoácido - sinalizar a conclusão da síntese da molécula protéica; eles recebem o nome de códons de terminação; As instruções do código genético emanadas do DNA constam, basicamente, de uma série de trincas de nucleotídeos; A sequencia determina o alinhamento dos códons no RNA, que são os que especificam o ordenamento dos aminoácidos na proteína. Os Genes Uma vez que a maior parte dos transcritos primários conta com sequencias de nucleotídeos superfluos que são suprimidos, estes - e por extensão os do DNA - não são representados no RNA processado nem na molécula proteica. Excetuando os segmentos supérfluos, de tudo o que foi mencionado até aqui, deduzimos que, em cada série: DNA -> RNA -> Proteína as unidades que integram estas moléculas - códons no DNA e no RNA, e aminoácidos na proteína - são colineares, já que os códons do DNA se correspondem com os do RNA e estes com os aminoácidos da proteína. Os Genes O gene tem várias partes funcionais Até agora, ao falar do gene, referimo-nos exclusivamente a seu segmento codificador. Contudo, o gene conta com outros componentes alheios a este segmento e que são: 1) O promotor, que inicia a transcrição e assinala a partir de qual nucleotídeo o gene deve ser transcrito e que pode estar localizado próximo da extremidade 5' do segmento codificador, onde começa a síntese do RNA. 2) Sequencias reguladoras, que determinam quando o gene deve ser transcrito e quantas vezes deve fazê-lo. Na maioria dos genes, estes segmentos estão localizados longe do codificador. Os Genes Existem dois tipos de reguladores, os amplificadores e os inibidores. Os primeiros são mais numerosos e por isso os mais estudados. Cada gene tem uma combinação particular de vários amplificadores e vários inibidores. Os Genes Algumas sequencias amplificadoras e inibidoras se repetem em genes diferentes, porém nunca os genes distintos têm uma mesma combinação destas sequencias reguladoras. Foi comprovado que quando se elimina uma seqüência amplificadora de um gene, a velocidade de transcrição diminui. Em contrapartida, quando se elimina uma seqüência inibidora, a velocidade aumenta. Os Genes 3) Finalmente, nas proximidades da extremidade 3' do segmento codificador, o gene conta com um segmento de DNA denominado seqüência de terminação - que não deve ser confundido com o códon de terminação do RNAm - o que marca a conclusão da síntese de RNA. Em seguida, analisaremos - separadamente - a composição dos genes que codificam os diferentes tipos de RNA. Os Genes Composição Dos Genes - Estrutura dos genes que codificam os RNA mensageiros A Fig. 13.5 mostra os diversos componentes dos genes que codificam os RNAm. O promotor pode contar com dois elementos. A combinação mais comum inclui as sequencias chamadas TATA e CAAT, situadas perto do codificador. Os Genes A caixa TATA com os 25 nucleotídeos posiciona-se "corrente acima" do primeiro nucleotídeo do codificador. A caixa CAAT se localiza no mesmo lado, porém um pouco mais distante, a cerca de 75 nucleotídeos ou seja, a 50 nucleotídeos da seqüência TATA. A seqüência de nucleotídeos mais comuns que se encontram na caixa TATA é a TATAAAA, embora, às vezes, dois T substituam os A nas quinta e sétima posições. A seqüência da caixa CAAT pode ser GGCCAATCT. Os Genes Devemos lembrar que muitos promotores contêm a sequencia TATA, porém não a seqüência CAAT. Às vezes estão ausentes as duas, caso no qual o promotor pode representar sequencias com uma concentração não usualmente alta de citosinas e guaninas, chamadas regiões CG. Os reguladores - amplificadores e inibidores - também podem ser encontrados "corrente acima" com relação à extremidade 5' do segmento codificador, embora muito distante, frequentemente a milhares de nucleotídeos. Os Genes Diferentemente do promotor, nos reguladores a seqüência de nucleotídeos - tanto em número quanto em qualidade - é específica, quer dizer, varia nos diferentes genes. No segmento codificador alternam-se segmentos de DNA utilizáveis como segmentos não funcionais. Como nos transcritos primários, são chamados éxons e íntrons, respectivamente; A maioria dos genes que codificam o RNAm contém entre um e 60 íntrons e são muito poucos os genes desprovidos deste tipo de sequência. Os Genes A seqüência de terminação não pode ser identificada ainda. No entanto, em um setor anterior a ela, é comum a presença da seqüência AATAAA, que é necessária para a conclusão da síntese do transcrito primário. A imensa maioria dos genes que codificam o RNAm é representada por cópias únicas (mais exatamente por duas cópias, o que se deve a condição diplóide das células somáticas). Uma das exceções corresponde aos genes que codificam as cinco histonas; Os Genes Os cinco genes são encontrados no cromossomo, alinhados um atrás do outro, separados entre si por seqüências de DNA que não se transcrevem e que se chamam espaçadores (Fig. 13.6). Neste jogo de cinco genes existem entre 20 e 50 cópias dispostas em fila, separadas entre si por novos DNA espaçadores. Estes genes estão separados por segmentos espaçadores ricos em A-T. Os Genes Estrutura do gene que codifica o RNA ribossômico 45S Os ribossomas são formados por duas subunidades, cada uma composta por RNA ribossômicos combinados com proteínas. Os RNAr são identificados tendo em conta seus tamanhos, expressos como coeficientes de segmentação; Desta forma, existem quatro tipos de RNAr, chamados 28S, 18S, 5,8S e 5S Os Genes Os três primeiros derivam-se de um transcrito primário comum denominado RNAr 45S; Existem, portanto, dois genes codificadores de RNAr, o correspondente ao RNAr 45S e o que codifica o RNAr 5S. A célula tem cerca de 200 cópias do gene do RNAr 45S. Os Genes Estão localizadas nas constrições secundárias dos cromossomos 13, 14, 15, 21 e 22, que se situam no nucléolo. Em média, cada constrição secundária conta com cerca de 20 cópias do gene. Como observamos na Fig. 13.7, as20 cópias do gene estão alinhadas em fila, separadas entre si por segmentos de DNA espaçadores que não se transcrevem. Em cada um desses espaçadores estão localizados o regulador e a maior parte do promotor. Os Genes Vejamos os elementos encontrados em cada cópia do gene (Fig. 13.8): Igualmente aos genes dos RNAm, o promotor do gene do RNAr 45S encontra-se "corrente acima" com relação à extremidade 5' do segmento codificador. Trata-se de uma seqüência em torno de 70 nucleotídeos, 20 dos quais são também os 20 primeiros nucleotídeos do setor codificador. Portanto, lida na direção 5'~3' , a última parte do promotor é a parte inicial do segmento codificador. O regulador, que atua como amplificador, é uma seqüência de cerca de 100 nucleotídeos. Os Genes Está situado a uns 50 nucleotídeos "corrente acima" do promotor, isto é, a uns 100 nucleotídeos da extremidade 5' do segmento codificador. No segmento codificador, as seqüências de DNA correspondentes aos RNAr 18S, 5,8S e 28S - nessa ordem - se acham separadas entre si por espaçadores. Estes, diferentemente dos espaçadores intercalados entre as cópias, transcrevem-se, de modo que aparecem no transcrito primário ou RNAr 45S (Fig. 15.9). A seqüência de terminação , na extremidade 3' de cada cópia, aparece depois do setor que codifica o RNAr 28S. Caracteriza-se por conter várias T seguidas. Os Genes Estrutura do gene que codifica o RNA ribossômico 55 Do gene do RNA 5S existem - uma depois da outra - cerca de aproximadamente 2.000 cópias separadas por segmentos espaçadores de DNA. Todas as cópias se localizam na extremidade distal do braço longo do cromossomo 1, de modo que não pertencem ao nucléolo. Cada cópia do gene tem duas seqüências especiais de nucleotídeos que constituem o promotor, situadas no interior do segmento codificador, do qual também fazem parte. Os Genes Devido a isto, as duas sequencias do promotor são transcritas. Além disso, têm uma seqüência situada "corrente acima" do codificador- quer dizer, no espaçador precedente - cuja função parece ser reguladora. A seqüência de terminação na extremidade 3' de cada cópia apresenta vários T contíguos, como no gene do RNAr 45S. Os Genes Estrutura dos genes que codificam os RNA de transferência Existem entre 10 e 100 cópias de cada um dos genes que codificam os diferentes RNAt, alguns dos quais se acham alinhados em fila - cópia depois de cópia - como os genes do RNAr SS . O promotor destes genes é constituído por duas seqüências de nucleotídeos separadas, ambas no interior do segmento codificador, do qual também fazem parte (Fig. 13 .10). Assim, tais seqüências, além de cumprir a função de promotor, se transcrevem. Os Genes Alguns genes dos RNAt apresentam um íntron de 4 a 15 nucleotídeos em meio ao segmento codificador e, por conseguinte, dois éxons. Não foram descritas seqüências reguladoras. A seqüência de terminação é semelhante à das cópias dos genes dos RNAr 45S e 5S .
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