aula 6 a

Prévia do material em texto

Aula 6 – bioinformática
1 –
a) Iria selecionar a guia nucleotide blast 
b) protein blast 
2 – Em Choose Search Set iria selecionar Others (nr etc.):, visto que eu não conheço que organismo 
possui a sequencia pedida.
 Em Program Selection iria selecionar inicialmente Optimize forMore dissimilar sequences (discontiguous 
megablast) para ter uma visão mais ampla de todos as sequencias que podem ter similaridade mesmo que 
seja pequena.
 
3 – O gene pode ser identificado por conter muitos scores e o seu percentual ser maior que 200, sendo gene 
CD44 a identificação desse gene.
4 - Mus musculus 
5- pyruvate carboxylase 
6 -
PEIXE MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYN
CAMUNDONGO MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYN
GALO MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYN
HUMANO MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYN
CACHORRO MPIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYN
 * **********************************************************
PEIXE IQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLI
CAMUNDONGO IQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLI
GALO IQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLI
HUMANO IQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLI
CACHORRO IQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLI
 ************************************************************
PEIXE FAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKPLTGKTITLEVEPSDTIENVKA
CAMUNDONGO FAGKQLEDGRTLPDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKA
GALO FAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKA
HUMANO FAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKA
CACHORRO FAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKA
 ************ ************************* *********************
PEIXE KIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKT
CAMUNDONGO KIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQ-----
GALO KIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGN------
HUMANO KIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC------
CACHORRO KIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGC------
 ************************************************