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GENÉTICA DE POPULAÇÕES - grupo de organismos da mesma espécie (intercruzáveis) que compartilham um mesmo conjunto gênico - comunidade evolutiva POPULAÇÃO • os membros de uma população apresentam grande variabilidade entre si (variabilidade fenotípica e variabilidade genotípica) Como analisar a variabilidade genética hereditária presente nas populações ? GENÉTICA DE POPULAÇÕES GENÉTICA DE POPULAÇÕES estudo da variabilidade genética populacional hereditária e sua alteração no tempo e espaço • estudo da estrutura genético- populacional • análise das frequencias alélicas (gênicas) e das frequencias genotípicas das populações. FREQUENCIA GÊNICA OU ALÉLICA frequencia de um determinado alelo em relação a todos os alelos do gene FREQUENCIA GENOTÍPICA frequencia de um determinado genótipo em relação a todos os possíveis genótipos de um gene FREQUENCIA FENOTÍPICA frequencia de um determinado fenótipo em relação a todos os fenótipos determinados por um gene A a A A A a aa freq. alelo A = 10/20 = 0,50 freq. alelo a = 10/20 = 0,50 freq. genótipo AA = 3/10 = 0,30 freq. genótipo Aa = 4/10 = 0,40 freq. genótipo aa = 3/10 = 0,30 freq. flores rosas = 7/10 = 0,70 freq. flores bcas = 3/10 = 0,30 freq. alelo A = 14/20 = 0,70 freq. alelo a = 6/20 = 0,30 FREQUENCIA GÊNICA OU ALÉLICA freq. genótipo AA = 5/10 = 0,50 freq. genótipo Aa = 4/10 = 0,40 freq. genótipo aa = 1/10 = 0,10 FREQUENCIA GENOTÍPICA freq. flores rosas = 9/10 = 0,90 freq. flores bcas = 1/10 = 0,10 FREQUENCIA FENOTÍPICA alelo A - determina cor rosa alelo a – determina cor branca CÁLCULO DAS FREQUENCIAS GÊNICAS (ALÉLICAS) E GENOTÍPICAS • Ex: loco gênico com alelos A e a f (A) = p f (a) = q f (A) + f (a) = 1 p + q = 1 Genótipos AA, Aa e aa f (AA) = p x p p2 f (Aa) = p x q ou q x p 2pq f (aa) = q x q q2 FREQUENCIAS GÊNICAS (OU ALÉLICAS) FREQUENCIAS GENOTÍPICAS A (p) a (q) a (q) A (p) AA Aa g a m e t a s m a s c u l i n o s (p2) (q2) Aa (pq) (pq) aa gametas femininos Aa x Aa GENÓTIPO FREQUENCIA AA Aa aa p2 2pq q2 ALELO FREQUENCIA A a p q Exemplo: • Sabendo-se que a frequência de albinos (alteração genética autossômica recessiva) em uma população é de 49%, qual a frequencia de indivíduos heterozigotos nesta população? EXERCÍCIO alelo A normal alelo a alterado genótipos AA Aa aa normal albino fenótipos normal freq. albinos = 49% = 0,49 f (aa) = 0,49 f (aa) = q2 q2 = 0,49 q = 0,49 q = 0,7 p + q = 1 p = 0,3 freq. indivíduos heterozigotos: f (Aa) = 2pq f (Aa) = 2 x 0,3 x 0,7 = 0,42 = 42% • diversos genótipos e diversos fenótipos; Exemplo: • Como calcular as frequências alélicas e genotípicas para o sistema sanguíneo ABO? Cálculo das frequências alélicas e genotípicas =Situação de alelos múltiplos= freq. alelo IA = p =0,4 freq. alelo IB = q= 0,2 freq. alelo i = r = 0,4 A IAIA (p2) IBIB (q2) IAi (2pr) IBi (2qr) IAIB (2pq) ii (r2) B (p + q + r)2 = p2 + 2pq + q2 + 2qr + r2 + 2pr p + q + r = 1 AB O r = 1 - 0,4 - 0,4 = 0,2 A IAIA (p2) = 0,4 x 0,4 = 0,16 IBIB (q2) = 0,2 x 0,2 = 0,04 IAi (2pr) = 2 x 0,4 x 0,4 = 0,32 IBi (2qr) = 2 x 0,2 x 0,4 = 0,16 B IAIB (2pq) = 2 x 0,4 x 0,2 = 0,16 AB ii (r2) = 0,4 x 0,4 = 0,16 O = 1 • dois genótipos masculinos e três genótipos femininos; Exemplo: • Em uma amostra de 200 homens, 24 têm daltonismo (alteração genética recessiva ligada ao cromossomo X) e todos os outros têm visão normal. Qual a frequencia, nos homens, do alelo recessivo para daltonismo? Quais as frequencias genotípicas dos homens? Cálculo das frequencias alélicas e genotípicas =Situação de genes ligados ao sexo (no cromossomo X)= machos normal afetado XDY XdY fêmeas normal afetada XDXD XDXd normal XdXd f (d) = no. alelos d no. total de alelos da amostra f (d) = 24/200 = 0,12 f (D) = no. alelos D no. total de alelos da amostra f (D) = 176/200 = 0,88 • as frequências dos alelos D e d podem ser determinadas diretamente pela incidência dos fenótipos/genótipos correspondentes NOS HOMENS através da contagem dos alelos. Equilíbrio de Hardy-Weinberg Godfrey Harold Hardy (1877 - 1947) Wilhelm Weinberg (1862 - 1937) Matemático Inglês Médico Alemão • “As FREQUENCIAS ALÉLICAS E GENOTÍPICAS de uma população (infinitamente grande, com acasalamentos ao acaso, indivíduos igualmente férteis, proporção de 1:1 de machos e fêmeas, reprodução sexuada) PERMANECERÃO CONSTANTES ao longo das gerações na ausência de fatores evolutivos” Equilíbrio ou Lei de Hardy-Weinberg (1908) QUANDO A POPULAÇÃO ESTÁ EM EQUILÍBRIO • populações SEM alterações nas frequencias gênicas (alélicas). POPULAÇÕES EM EQUILÍBRIO Freq. alélica inicial Freq. alélica final Genótipo Genótipo Genótipo POPULAÇÕES EM EQUILÍBRIO • populações COM alterações nas frequencias gênicas (alélicas). POPULAÇÕES NÃO EM EQUILÍBRIO • alteração na estrutura (constituição) genética das populações ao longo do tempo (ao longo das gerações). QUANDO A POPULAÇÃO NÃO ESTÁ EM EQUILÍBRIO POPULAÇÕES NÃO EM EQUILÍBRIO • ALTERAÇÃO NAS FREQ. ALÉLICAS E GENOTÍPICAS. Fatores Evolutivos ALTERAÇÕES NAS FREQUENCIAS GÊNICAS / ALÉLICAS: DERIVA GENÉTICA SELEÇÃO NATURAL MIGRAÇÃO MUTAÇÃO Como determinar se as populações encontram-se em equilíbrio ou não? Populações idealizadas x Populações reais POPULAÇÃO EM EQUILÍBRIO TESTE PARA VERIFICAR SE UMA POPULAÇÃO ENCONTRA-SE EM EQUILÍBRIO DE HARDY- WEINBERG (1) determinar as freqüências alélicas a partir do número dos genótipos observados; (2) calcular o número de genótipos esperados; (3) comparar os números observados com os números esperados utilizando o teste de qui-quadrado. χχχχ2 = ΣΣΣΣ(observado - esperado)2/esperado COMO ANALISAR VALOR DE QUI-QUADRADO: • Graus de liberdade (GL) : representa, em estatística, o número de determinações independentes (número de classes) menos o número de parâmetros estatísticos a serem avaliados em uma população. 3 (classes) – 2 (parâmetros) = 1 no. classes genotípicas no. alelos VALORES DE QUI-QUADRADO LIMITE DA SIGNIFICÂNCIA Imagine um determinado gene que possui dois alelos (F e f). Em uma população humana Africana (N = 190), sabe-se que existem 135 indivíduos homozigotos dominantes (FF), 44 indivíduos heterozigotos (Ff) e 11 indivíduos homozigotos recessivos (ff). Determine se esta população encontra-se em equilíbrio de Hardy-Weinberg para este determinado loco gênico. TESTE PARA VERIFICAR SE UMA POPULAÇÃO ESTÁ EM EQUILÍBRIO 1. Cálculo das frequencias alélicas: 2. Cálculo das frequencias genotípicas: Cálculo das frequencias alélicas e genotípicas esperadas f (f) = no. de alelos a no. total de alelos 2 N f (f) = 2 x no. homozigotos para o alelo a + no. heterozigotos f (F) = no. de alelos A no. total de alelos f (F) = 2 x no. homozigotos para o alelo A + no. heterozigotos 2 N 3. Cálculo entre número observado e número esperado de indivíduos; 4. Comparação entre esperado e observado – Teste χχχχ2 Observado (O) Esperado (E) (O-E)2/E p2 135 0.682 x 190 = 129.6 0.22 2pq 44 0.287 x 190 = 54.5 2.02 q2 11 0.03 x 190 = 5.7 4,93 χχχχ2 = 7.17 χχχχ2 = ΣΣΣΣ(observado - esperado)2/esperado Multiplica-se a freq. esperada de cada genótipopelo número total da amostra. PROCESSOS QUE ALTERAM AS FREQUENCIAS GÊNICAS Fatores que alteram as frequencias alélicas e genotípicas: • MUTAÇÃO • MIGRAÇÃO • SELEÇÃO NATURAL • DERIVA GENÉTICA • Mudanças no DNA: “Transformação” dos alelos • alterações em cromossomos; alelo A alelo a • fonte primária de toda variação genética; • alterações em genes. Alterações nas frequencias gênicas • MUTAÇÃO • MIGRAÇÃO • SELEÇÃO NATURAL • DERIVA GENÉTICA • Indivíduos se movem entre populações • fluxo gênico introdução de alelos Alterações nas frequencias gênicas POPULAÇÃO 1 Ex: migração frequencia do alelo para cor branca (alelo a) é maior frequencia do alelo para cor preta (alelo A) é maior • alelo A – determina cor preta • alelo a – determina cor branca POPULAÇÃO 1 • MUTAÇÃO • MIGRAÇÃO • SELEÇÃO NATURAL • DERIVA GENÉTICA • Sobrevivência e reprodução diferenciais entre os indivíduos de uma população. Genótipos com maior sucesso reprodutivo Tendência a aumentar a freqüência de seus alelos na população > Sucesso Reprodutivo de alguns indivíduos (transmissão de genes para a geração seguinte) Alterações nas frequencias gênicas • Ex: peso ao nascimento; • População humana = estabilidade no tamanho dos bebés recém- nascidos. • MUTAÇÃO • MIGRAÇÃO • SELEÇÃO NATURAL • DERIVA GENÉTICA • Alterações genéticas devidas ao acaso = em populações pequenas (número de indivíduos). • Mudanças nas frequencias gênicas que ocorrem porque os alelos que aparecem em uma geração não são uma amostra representativa dos alelos da geração anterior. Alterações nas frequencias gênicas Ex: Colonização de ilhas Ilha de Lençóis (São Luis – MA) • alta incidência de albinos • frequencia alta do alelo recessivo a • colônia fundada por poucos indivíduos (incluindo portadores do alelo recessivo para albinismo) CONSANGUINIDADE • CONSANGUINIDADE ou ENDOGAMIA • Ocorrência de acasalamentos entre indivíduos aparentados, • “ACASALAMENTO ENTRE PARENTES BIOLÓGICOS” . • Existência de ancestrais comuns (mesmos pais ou avós) = indivíduos podem ter genes idênticos em comum, • GENES IDÊNTICOS POR DESCENDÊNCIA!!! • IDÊNTICOS POR DESCENDÊNCIA ≠ IDÊNTICOS POR ESTADO: • Genes idênticos (homozigose) por estado relacionam-se às cópias idênticas de um gene geradas por mutações recorrentes – genes presentes em pessoas ao ACASO. • Genes idênticos (homozigose) por descendência = relacionam- se às cópias idênticas de um gene geradas por herança de um ancestral (parente) comum. • EFEITOS DA CONSANGUINIDADE • Quando 2 parentes se cruzam, a prole resultante pode ser homozigota para um determinado alelo ; • Esse alelo em HOMOZIGOSE pode apresentar efeitos não desejáveis aos seus portadores; • Tais como: 1) Efeitos Epistáticos; 2) Efeitos Deletérios = apresenta fortes interações com alelos recessivos . = EFEITO EPISTÁTICO ou EPISTASIA = • Quando o efeito de um par de genes em homozigose influencia ou MODIFICA o efeito de outro par de genes; • Os genes envolvidos podem influenciar na mesma característica fenotípica de maneira antagonista; • Ex.: Fenótipo Bombaim • Algumas combinações homozigotas de alelos diferentes podem interagir para reduzir a sobrevivência do indivíduo por EPISTASIA. = EFEITO DELETÉRIO – GENE LETAL = • Quando um gene em homozigose leva à MORTE do seu portador; • Afeta a SOBREVIVÊNCIA do indivíduo; • Exemplo: acasalamentos entre primos representam 0,05% dos acasalamentos nos EUA; • Devido a esses cruzamentos, existem 27-53% dos casos da doença Tay-Sachs (doença genética letal) nessa população. Doença de Tay-Sachs • A endogamia é medida pelo coeficiente de endogamia – F. • F = probabilidade de que um alelo existente em um dos ancestrais comuns (de um casal consanguíneo), produza uma progênie homozigota por descendência em um loco autossômico qualquer. = COEFICIENTE DE ENDOGAMIA = • O cálculo de F pode ser determinado pela análise de heredogramas. • Probabilidade (D=A1A1) = (½)6 = + 1/64 • Probabilidade (D=homozigoto) = F 1/64 x 4 = 1/16 • D pode ser homozigoto para A1, A2, A3 e A4 = 4 opções de alelos em homozigose, o que justifica o cálculo: F = 1/64 x 4 = 1/16 D • O valor de F – que é 1/16 quando o casal é formado por primos de primeiro grau – reduz-se pela metade ou aumenta 2x, cada vez que passa de um grau de consanguinidade para outro. • Diminui ou aumenta mais uma pessoa intermediária na cadeia de parentesco; • Fator ½ entra mais uma vez no cáculo de F. • Exemplo = cruzamentos entre irmãos. A B C D A1A2 0,50,5 0,50,5 Homozigoto • Probabilidade (D=homozigoto) : F = 1/16 x 4 = 1/4 A3A4 Exemplo = cruzamentos entre primos de segundo grau A3A4 A A A A1A2 0,50,5 0,5 0,5 A A A 0,50,5 A AA 0,5 A • Probabilidade (D=homozigoto) : F = 1/128 x 4 = 1/32 • Implicações sobre o coeficiente de endogamia (F) • F = não pode ser usado para se buscar desvios do Equilíbrio de Hardy- Weinberg . • Mas a endogamia apresenta importantes implicações populacionais, quanto às frequências gênicas . Godfrey Harold Hardy Wilhelm Weinberg • Populações: • infinitamente grande, • com acasalamentos ao acaso, • indivíduos igualmente férteis, • proporção de 1:1 de machos e fêmeas, • reprodução sexuada • Para populações em equilíbrio (sem endocruzamentos) F = 0. • Se houver endocruzamento F > 0 = consequente ocorre uma DIMINUIÇÃO de HETEROZIGOTOS na população – alteração nas frequências gênicas. • Para populações que tiverem F > 0: • NÃO SE PODE AFIRMAR que os genótipos de um par de alelos autossômicos, se distribuem segundo a lei de Hardy e Weinberg: • AA= p2, • Aa = 2pq e • aa = q2. • Esses genótipos se distribuirão de acordo com a LEI DO EQUILÍBRIO DE WRIGHT, que considera o valor de F (ou Fpq) • AA = p2+ F pq, • Aa = 2pq - 2 F pq e • aa = q2+ F pq. = EQUILÍBRIO DE WRIGHT= SUBTRAÇÃO = em endogamia diminui a quantidade de heterozigotos • CONCLUSÃO : • Casamentos consangüíneos são capazes de alterar as freqüências genotípicas; • Mas as freqüências alélicas manter-se-ão constantes, independentemente do coeficiente médio de consanguinidade ou endocruzamento da população. • COM ENDOCRUZAMENTO = as frequências gênicas não se alteram – SOMENTE AS GENOTÍPICAS E FENOTÍPICAS.
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