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PONTOS DE CONTROLE DE QUALIDADE NA REPLICAÇÃO DO DNA Alex Medeiros, Guilherme Machado, Karina Campaner, Leandro Panhan SQM0416 - Bioquímica II Prof. Drº Júlio Borges ROTEIRO • Dogma Central da Biologia; • Ciclo Celular; • Síntese de DNA; • Estágios da replicação: – Iniciação; – Alongamento; – Terminação. • Reparo de erros de pareamento; • Conclusão; • Referências bibliográficas. 2 DOGMA CENTRAL DA BIOLOGIA DNA RNA PROTEÍNAS REPLICAÇÃO TRANSCRIÇÃO TRADUÇÃO 3 CICLO CELULAR • A replicação ocorre em uma fase especifica. FASE G1 Transcrição RNA e síntese de proteínas FASE S Replicação do DNA FASE M Divisão celular FASE G2 Transcrição RNA e síntese de proteínas 4 • Semiconservativo; • Origens de replicação: – Região rica em pares de A-T; – Iniciada nas Forquilhas de Replicação; – Bidirecional. SÍNTESE DE DNA 5 REPLICAÇÃO DO DNA • Iniciação; • Alongamento; • Terminação. 6 REPLICAÇÃO DO DNA INICIAÇÃO Proteínas Participantes • Topoisomerase; • Helicase; • Primase; • SSB. 7 REPLICAÇÃO DO DNA INICIAÇÃO 8 Mecanismo catalítico da reação de polimerização. REPLICAÇÃO DO DNA ALONGAMENTO 9 • A DNA-polimerase III só pode catalisar o crescimento da cadeia de DNA no sentido 5’- 3’ em ambas fitas; • Uma fita é sintetizada de forma contínua (Fita líder) e outra descontínua; • A segunda fita é produzida em fragmentos de DNA (Fragmentos de Okazaki). REPLICAÇÃO DO DNA ALONGAMENTO 10 REPLICAÇÃO DO DNA ALONGAMENTO 11 • DNA-polimerase I; • Seleção das bases nitrogenadas: A-T e G-C; • Dependente da geometria dos pares. REPLICAÇÃO DO DNA ALONGAMENTO Ponto de controle de qualidade 12 • Atividade de polimerização (troca dos primers por DNA). • Atividade exonucleásica de edição (3’→5’); Ponto de controle de qualidade REPLICAÇÃO DO DNA ALONGAMENTO 13 • DNA-ligase; • Atua na formação da ligação entre os segmentos de DNA. REPLICAÇÃO DO DNA ALONGAMENTO 14 • Na E. coli encontram sequências de 20 pb denominadas Ter na região de terminação; • Sítios para ligação com a proteína Tus (substância de utilização do término); • Complexo Tus-Ter bloqueia forquilha; • Os pares finais são replicados por um mecanismo desconhecido; • Separação dos círculos concatenados requer a toposimerase IV. REPLICAÇÃO DO DNA TERMINAÇÃO 15 REPLICAÇÃO DO DNA TERMINAÇÃO 16 • Correção dos raros despareamentos na replicação da E. coli melhora a fidelidade global da replicação por um fator adicional de 100 a 1000; • Envolve aproximadamente 12 componentes proteicos tanto na discriminação das fitas quanto no próprio reparo; • Distinção das fitas de DNA: DNA parental (base correta) e fita-filha (base normal e incorreta); • A passagem da forquilha de replicação ocasiona uma breve metilação da fita parental. • Dam-metilases realizam a discriminação das fitas por meio da metilação; • Palíndromos GATC permanecem semimetilados até a Dam-metilase metilar a fita-filha; • A metilação ocorre na posição N6 de todas as adeninas (A) em sequências (5’) GATC; REPARO DE ERROS DE PAREAMENTO Ponto de controle de qualidade 17 • Formação de um complexo homodímero pelas proteínas MutS e MutL com os pares de bases despareados; • Encontro do complexo MutS-MutL com o palíndromo GATC semimetilado, recruta a proteína MutH; • Deslocamento através do DNA em ambas direções com a formação de uma alça no DNA; • Translado por meio da ATPase da MutS; • MutH possui atividade endonuclease sítio- específica que é ativada diante de uma sequência GATC semimetilada; REPARO DE ERROS DE PAREAMENTO 18 REPARO DE ERROS DE PAREAMENTO • MutH cliva a fita não-metilada no lado 5’ de G no GATC, ocasionando a marcação para o reparo; • Combinação da ação do complexo com uma DNA-helicase II e uma exonuclease específica; • Separação e degradação das fitas de DNA cortadas até além do malpareamento; • A lacuna é preenchida pela DNA polimerase III; • A DNA ligase volta a unir os fragmentos; • Restabelecimento da ordem (correção) no empareamento da sequência de pb no DNA. 19 CONCLUSÃO • A replicação é semiconservativa, ocorre em três estágios, tem origem de replicação e bidirecional; • O DNA sintetizado na direção 5’3’ pelas DNA-polimerases; • Os pontos de controle de qualidade: – Seleção das bases nitrogenadas; – Atividade exonucleásica 3’5’; – Repara erros de pareamento após a replicação. 20 REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS LEHNINGER, A. L.; NELSON, K. Y. Princípios de Bioquímica. Coordenação da tradução: Fabiana Horn; revisão técnica: Carla Dalmaz, Sandra Estrazulas Farias. – 5. ed. Porto Alegre: Artmed, 2011. VOET, Donald; VOET, Judith G. Bioquímica. 4. ed. Porto Alegre, Artmed, 2013. 21 AGRADECEMOS PELA ATENÇÃO OBRIGADO! 22 PONTOS DE CONTROLE DE QUALIDADE NA REPLICAÇÃO DO DNA ROTEIRO DOGMA CENTRAL DA BIOLOGIA CICLO CELULAR SÍNTESE DE DNA REPLICAÇÃO DO DNA REPLICAÇÃO DO DNA�INICIAÇÃO Número do slide 8 Número do slide 9 Número do slide 10 Número do slide 11 Número do slide 12 Número do slide 13 Número do slide 14 Número do slide 15 Número do slide 16 Número do slide 17 Número do slide 18 REPARO DE ERROS DE PAREAMENTO� CONCLUSÃO REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS AGRADECEMOS PELA ATENÇÃO
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