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Ligação gênica: segregação dependente Bruna Mayumi Sugita Doutoranda PPG-GEN brunasugita@gmail.com AU04 Leis de Mendel (1865) • Primeira Lei de Mendel Cada característica é determinada por um par de fatores que se segrega durante a gametogênese. P.G.= 1:2:1 • Segunda Lei de Mendel Os alelos de diferentes pares segregam-se independentemente e combinam-se aleatoriamente durante a gametogênese P.G.= 1:2:1:2:4:2:1:2:1 P.F.= 9:3:3:1 • Bateson, Saunders & Punnet (1905) – Detectaram um desvio significativo da P.F. de 9:3:3:1 do cruzamento diíbrido • Morgan (1911) – Quando dois genes estão próximos em um mesmo cromossomo, eles não segregam independentemente. SEGREGAÇÃO DEPENDENTE • Se as características estudadas por Mendel fossem controladas por genes próximos no mesmo cromossomo, ele não encontraria a PF de 9:3:3:1. – Genes Sintênicos: encontram-se no mesmo cromossomo – Genes Ligados: mais do que 50% dos gametas produzidos apresentam combinações parentais dos marcadores, e menos de 50% apresentam recombinações dos marcadores Ligação Gênica • Os genes localizados próximos no mesmo cromossomo tendem a permanecer unidos durante a gametogênese, sendo herdados “em bloco”. • A Frequência de Recombinação é proporcional à distância entre os genes ao longo dos cromossomos. • Vamos considerar: – 2 genes autossômicos com 2 alelos cada: A e a, B e b; – Para cada um dos genes há dominância completa: A>a, B>b; – Não envolve epistasia (cada gene atua sobre uma característica distinta da outra) Genes em cromossomos diferentes Por ser segregação independente, a combinação entre os alelos é aleatória = 1:1:1:1 50% Parental 50% Recombinante Genes no mesmo cromossomo Quando há ligação entre os genes, a recombinação ocorre em menor porcentagem = não é 1:1:1:1 > 50% Parental < 50% Recombinante Recombinação • Ocorre durante o pareamento dos homólogos: formam quiasmas na Prófase I da meiose • Troca de segmentos Crossing over, Permuta ou Recombinação A recombinação ocorre ao acaso e pode ocorrer em outros locais que não entre os genes que estamos analisando. Fases dos Genes • Atração ou Cis – As formas selvagens dos alelos se encontram em um cromossomo, e as formas mutantes em outro cromossomo • Repulsão ou Trans – As formas mutantes e selvagens se encontram no mesmo cromossomo A B A b a b a B Arranjo em Cis ou Arranjo em Trans ou Acoplamento Repulsão Frequência de Recombinação • No Cruzamento Teste: FR= no de recombinantes x 100 (cM ou %) total de descendentes • Na F2: Z= no de Recomb1 x no de Recomb2 no de Parent1 x no de Parent2 *O valor de Z é tabelado e indica o FR correspondente • A frequência de recombinação é influenciada pela distância entre genes 1cM = 1% de recombinação • Estabelecendo a distância entre os genes é possível desenhar o Mapa Gênico. • Mapas Gênicos são diagramas no quais são representados os genes em suas respectivas posições no cromossomo. • Mapas de Ligação são mapas que representam genes ligados (um único cromossomo). São lineares, isto é, todos os genes de um dado grupo podem ser mapeados em um arranjo linear. Experimento de Bridges e Olbrycht • Fêmeas homozigotas para três utações recessivas ligadas ao cromossomo X: – Cerdas scute (sc) – Olhos echinus (ec) – Asas crossveinless (cv) • Machos tipo selvagem F2 F2 Construindo o Mapa Gênico • Primeiro Passo: Ordem Relativa dos Genes • Segundo Passo: Cálculo da Distância dos Genes • Interferência • Coincidência Ordem Relativa dos Genes • Determinar quais são os tipos Parentais, Recombinantes Simples e Duplo Recombinantes – Parentais: apresentam maior frequência – Recombinantes: apresentam menor frequência • Três possíveis ordens sc – ec – cv ec – sc – cv ec – cv - sc As pontas direita e esquerda no cromossomo não podem ser distinguidas • Seis classes recombinantes em F2: – Quatro Recombinantes Simples: um único crossing – Duas Duplo Recombinantes: dois crossings Ordem relativa dos genes Classes raras: – sc ec+ cv (1) – sc+ ec cv+ (1) Comparando com os parentais: – sc ec cv (1.158) – sc+ ec+ cv+ (1.455) sc – ec - cv Cálculo das Distâncias entre genes • Número médio de crossings em cada região cromossômica • Identificar classes recombinantes: – RRI – RRII – DR Cálculo da Distância entre genes • FRRI = f recomb. RI + fDR total descendentes • FRRII = f recomb. RII + fDR total descendentes • dA-C = RRI + RRII + 2xDR total descendentes Cálculo das distâncias entre genes Interferência e Coeficiente de Coincidência • Os crossings duplos permitem determinar se as as trocas em regiões adjacentes são independentes umas das outras. • A recombinação em uma região pode interferir na ocorrência de uma outra recombinação em suas proximidades. • A estimativa de Interferência é calculada pela comparação das frequências de DR observada e esperada. • FRDRobs= n DRobs x 100 total desc. • FRDResp= FRRI x FRRII 100 • cc= FRDRobs / FRDResp • I = 1 - cc Interferência e Coeficiente de Coincidência • FRDRobs= 2 x 100 = 0,0006 3248 • FRDResp= 9,1 x 10,5 = 0,0095 100 • cc= 0,0006 / 0,0095 = 0,063 • I = 1 – 0,063 = 0,937 Interferência e Coeficiente de Coincidência • A Interferência é forte em distâncias de mapas menores que 20 cM • Em regiões grandes a Interferência é muito fraca Interferência e Coeficiente de Coincidência Exemplo: Num cruzamento de milho, foram estudados 3 caracteres: Cor da folha: A_ verde / aa virescente Brilho da folha: B_ sem brilho / bb brilhante Pendão: C_ normal / cc estéril Foi feito o cruzamento parental puro e obteve-se na F1 um triplo heterozigoto (ABC/abc), com o qual foi feito o Cruzamento Teste (x abc/abc), obtendo os seguintes resultados: FENÓTIPO GENÓTIPO No. de indivíduos Normal 235 Brilhante/Estéril 62 Estéril 40 Estéril/Virescente 4 Brilhante/Esteril/Virescente 270 Brilhante 7 Brilhante/Virescente 48 Virescente 60 TOTAL 726 FENÓTIPO GENÓTIPO No. de indivíduos Normal ABC/abc 235 Brilhante/Estéril Abc/abc 62 Estéril ABc/abc 40 Estéril/Virescente aBc/abc 4 Brilhante/Esteril/Virescente abc/abc 270 Brilhante AbC/abc 7 Brilhante/Virescente abC/abc 48 Virescente aBC/abc 60 TOTAL 726 FENÓTIPO GENÓTIPO No. de indivíduos Normal ABC/abc 235 P1 Brilhante/Estéril Abc/abc 62 RRI Estéril ABc/abc 40 RRII Estéril/Virescente aBc/abc 4 DR Brilhante/Esteril/Virescente abc/abc 270 P2 Brilhante AbC/abc 7 DR Brilhante/Virescente abC/abc 48 RRII Virescente aBC/abc 60 RRI TOTAL 726 Ordem Relativa dos Genes Parentais DR A B C A b C a b c a B c O gene alterado nos DR é o gene que se encontra no meio. A ordem relativa dos genes é A – B – C. Cálculo da Distância entre genes • FRRI = f recomb. RI + fDR total descendentes • FRRII = f recomb. RII + fDR total descendentes • dA-C = RRI + RRII + 2xDR total descendentes FENÓTIPO GENÓTIPO No. de indivíduos Normal ABC/abc 235 P1 Brilhante/Estéril Abc/abc 62 RRI Estéril ABc/abc 40 RRII Estéril/Virescente aBc/abc 4 DR Brilhante/Esteril/Virescente abc/abc 270 P2 Brilhante AbC/abc 7 DR Brilhante/Virescente abC/abc 48 RRII Virescente aBC/abc 60 RRI TOTAL 726 Cálculo da Distância • FRRI = (62+60) +(4+7) = 0,183 = 18,3% ou cM 726 • FRRII = (40+48) + (4+7) = 0,1364 = 13,6% ou cM 726 • dA-C = (62+60) + (40+48) + 2x(4+7) = 0,319 = 31,9% 726 ou cM A B C 18,3cM 13,6cM 31,9cM Interferência e Coincidência • FRDRobs= (4+7) x 100 = 1,52 726 • FRDResp= 18,3 x 13,6 = 2,4888 100 • cc= 1,52 / 2,4888 = 0,611 • I = 1 – 0,611 = 0,389 ou 38,9% Isso significa que 38,9% dos DR esperados não ocorreram por causa da interferência 01) Fêmeas de Drosophila heterozigotas para três marcadores recessivos ligados ao X, y (corpo amarelo - yellow), ct (asas cut) e m (asas miniature), e seus alelos tipo selvagem (wild-type) foram cruzadas com machos y ct m. Foi obtida a seguinte prole: Classe Fenotípica N Yellow, cut, miniature 30 Wild-type 33 Yellow 10 Cut, miniature 12 Miniature 8 Yellow, cut 5 Yellow, miniature 1 Cut 1 a) Que classes são tipos parentais? b) Que classes representam crossings duplos? c) Qual é a ordem dos genes? d) Qual a fase das fêmeas heterozigotas utilizadas no cruzamento? e) Determine a distância entre os genes y, ct e m e desenhe o mapa correspondente. F) Calcule a interferência e a coincidência. 02) Em aves existe um grupo de genes ligados, associados a características comportamentais: A agressividade e a submissão; B cuidado parental curto e b cuidado parental longo; C monogamia estrita e c monogamia “frouxa”. O cruzamento ABC/abc x abc/abc gerou a seguinte prole: a) Represente os genótipos correspondentes a cada fenótipo da prole. b) O heterozigoto parental apresenta os genes em cis ou em trans? c) Quais são os parentais e duplo- recombinantes? d) Qual é a ordem dos genes A, B e C? e) Construa o mapa gênico, indicando as distâncias em unidades de mapa. Fenótipo N Agressivo, curto, estrita 450 Submisso, longo, “frouxa” 430 Agressivo, longo, estrita 26 Submissos, curto, “frouxa” 24 Agressivos, curto, “frouxa 32 Submissos, longo, estrita 33 Agressivos, longo, “frouxa” 03 Submissos, curto, estrita 02 Referências GRIFFITHS, A.J.F. et al. An introduction to Genetic Analysis 8th Ed. W. H. Freeman, 2004. Miko, I. (2008) Thomas Hunt Morgan and sex linkage. Nature Education 1(1):143 SNUSTAD, D.P.; SIMMONS, M.J. Fundamentos de Genética. Ed. Guanabara-Koogan, Rio de Janeiro, 6ª Ed., 2013.
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