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Resumo: Replicação do DNA em procariotos A replicação de DNA envolve uma variedade de enzimas, muita dessas enzimas foram isoladas primeiramente em procariotos sendo, portanto melhor compreendidas em procariotos. Assim iniciamos com a descrição sobre a replicação deE. coli. Na bactéria E. coli, há uma região do DNA que contém a origem de replicação do cromossomo chamada de oriC, que apresenta uma seqüência rica em CATC que são sítios de metilação na Adenina das duas fitas do DNA. Em células eucarioticas, o processo de replicação ocorre durante o período de síntese (S) do ciclo celular. Origem de replicação: A replicação do DNA ocorre ao longo da molécula, a partir de um ponto de origem. - origem isolada de procariotos e de alguns eucariotos – são ricas em sequência AT. - células procarióticas, vírus e plasmídeos – só tem 1 origem de replicação. - células eucarióticas – várias origens de replicação Replicação do cromossomo de E. coli. A síntese de uma molécula de DNA pode ser dividida em 3 etapas: iniciação, alongamento e terminação. A oriC (ponto de origem da replicação) consiste de 245 pares de bases (pb) muito dos quais são altamente conservados entre as bactérias. Enzimas que participam da fase de iniciação: - DnaA – a ligação da dnaA a quatro locais em oriC próximos aos grupos de 13 ricos em AT inicia um intrincado processo de etapas que levam ao desenrolamento do molde de DNA e síntese de um primer. O DNA tem que ter superelicoidização negativa para possibilitar a ligação de dnaA. - As proteínas dnaB e dnaC juntam-se à dnaA para dobrar e abrir a dupla hélice. - A proteína dnaB é uma helicase: ela catalisa o desenrolamento da dupla-hélice de DNA. - A parte desenrolada do DNA é então estabilizada por uma proteína ligadora de fita simples (SSB) a um filamento de DNA. - O desenrolamento do DNA circular na origem produz uma superelicoidização positiva, que tem que ser aliviada para permitir que a replicação continue. O alívio é fornecido pela enzima DNA girase, que introduz superélice negativa à medida que hidrolisa ATP. O molde do DNA é então exposto, mas o novo DNA não pode ser sintetizado até que um primer seja construído. (lembre-se que a DNA polimerase necessita de um primer com uma 3’ OH livre para a síntese do DNA). O RNA serve comoprimer para a síntese do DNA. A RNA polimerase, chamada de primase junta-se ao pré-primer em uma montagem de múltiplas subunidades chamado de primossomo. A primase sintetiza um filamento curto de RNA (~5 nucleotídeos) que é complementar ao filamento molde do DNA. Obs: O primer de RNA é removido no final da replicação pela atividade 5’ → 3’ da DNA polimerase I. A holoenzima DNA polimerase III catalisa a formação de muitos milhares de ligação fofodiester antes de liberar seu molde (a DNA polimerase III não deixa o molde de DNA até que ele tenha sido replicado), em comparação a apenas 20 para a DNA polimerase I ( usado como preenchedora de espaço ou de reparo). A DNA polimerase III se posiciona na forquilha de replicação, onde começa a síntese da fita contínua (leading) e da fita descontínua (lagging). Usando o primer de RNA formado pela primase. A proteína de ligação (SSB) mantêm o DNA desenrolado distendido e acessível, de modo que ambos os filamentos podem servir como molde. O fita contínua (5’→3’) é sinteAzada conAnuamente pela polimerase III, que são libera o molde até que a replicação tenha sido completada. A DNA girase concomitantemente introduz superélices negativas para evitar uma crise topológica. A fita descontínua (3’→5’) é sintetizada em fragmentos pela polimerase III de modo que a polimerização 5’→ 3’ leva um crescimento geral no sentido 3’→5’. A DNA polimerase III deixa a fita descontínua após cerca de 1000 nucleotídeos adicionados, formando um fragmento de Okazaki. Um novo primer é sintetizado pela primase para iniciar a formação de um novo fragmento de Okazaki. Os espaços entre os filamentos nascentes (fragmento de Okazaki) são preenchidos pela DNA polimerase I. Esta enzima também usa a sua atividade de exonuclease 5’→ 3’ para remover o primer de RNA. O primer não pode ser removido pela DNA polimerase III porque a enzima não tem a atividade de exonuclease 5’→ 3’. Finalmente a DNA ligase une os fragmentos. Resumindo a função de cada enzima: Proteína função Helicase (dnaB) Desenrola a dupla hélice Primase Sintetiza primers de RNA SSB Estabiliza regiões unifilamentares DNA girase Introduz superélices negativas DNA polimerase III Sintetiza o DNA DNA polimerase I Elimina o primer e preenche os espaços DNA ligase Une as pontas do DNA Alguns Vírus tumorais com RNA e outros retrovírus se replicam por meio de DNAs intermediários de dupla hélice. Quando o RNA viral entra na célula hospedeira. Este RNA é o molde para a síntese de um filamento complementar de DNA pela enzima transcriptase reversa, uma enzima viral que também entra na célula hospedeira. A trasncriptase reversa sintetiza o Dna a partir do RNA, formando o híbrido DNA-RNA. O novo DNA serve como molde para a síntese da sua dupla fita, esta dupla fita de DNA viral fica incorporado no DNA cromossômico do Hospedeiro e se replica juntamente com o DNA celular normal no curso da divisão celular. Posteriormente, o genoma viral integrado se expressa para formar o novo RNA e proteínas virais, que se juntam em novas partículas virais. Referências: - ZAHA, A., FERREIRA, H. B. e, PASSAGLIA L. M. P. Biologia Molecular Básica. 3.ed Ed. Mercado Aberto, Porto Alegre, 2003. - STRYER ,L. Bioquímica. Editora: GUANABARA - Voet, D , Voet, J.G. e Pratt, C.W., Fundamentos da Bioquímica Ed. Artmed
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