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Dr. Ricardo Salviano dos Santos 1 Universidade Federal Dos Vales Do Jequitinhonha E Mucuri Faculdade De Ciências Biológicas E Da Saúde Departamento: Farmácia Disciplinas: Bioquímica Geral Diamantina 2016 Aminoácidos, peptídeos e Proteínas 2 PROTEÍNA 3 Aminoácidos – Estrutura geral • Estruturas monoméricas formam proteínas por ligações peptídicas. • 1806 – descoberta do primeiro aminoácido, ASPARAGINA, encontrado no aspargo. • até 1938 – descoberta dos 20 aminoácidos existentes, o último foi a TREONINA. •Todos 20 AAs são -aminoácidos. Possuem grupo carboxila (COO-) e amino (NH3+) ligados ao mesmo átomo de carbono (carbono α). • Diferem nas cadeias laterais, ou grupos R (RADICAL). 4 RADICAL Aminoácidos – Estrutura geral GLICINA 5 Aminoácidos – Estrutura geral Aminoácidos - Estereoisomerismo Aminoácidos - Estereoisomerismo Grupo R - apolar e alifático Grupo R - polares carregados negativamente Grupo R - polares carregados positivamente Grupo R - aromáticos Grupo R - polares não-carregados Glicina Triptofano Tirosina Fenilalanina Cisteína Treonina Serina Glutamina Asparagina Prolina Arginina Histidina Lisina Glutamato Aspartato Leucina Metionina Isoleucina Alanina Valina 8 Aminoácidos - Classificação Aminoácidos – apolares, alifáticos Aminoácidos – apolares, alifáticos Aminoácidos – aromáticos Aminoácidos – aromáticos Aminoácidos – Polares, não carregados Aminoácidos – Polares, carga + Aminoácidos – Polares, carga - Essenciais Não-essenciais Arginina1 Alanina Fenilalanina Asparagina Histidina Aspartato Isoleucina Cisteína Leucina Glutamato Lisina Glutamina Metionina Glicina Treonina Prolina Triptofano Serina Valina Tirosina Tabela 3:Aminoácidos essenciais e não-essenciais para seres humanos 1 Mamíferos sintetizam arginina, mas em quantidade insuficiente 16 Aminoácidos Titulação de Aminoácidos Titulação de Aminoácidos Titulação de Aminoácidos pI= pka1 + pKa2 2 Titulação de Aminoácidos Titulação de Aminoácidos • Resultam da modificação específica de um resíduo de aminoácido após a síntese protéica. • Ocorre adição de grupos químicos nas cadeias laterais do AA: hidroxilação, metilação, acetilação, carboxilação e fosforilação. 23 Aminoácidos incomuns Aminoácidos incomuns •derivado da prolina encontrado na parede celular de plantas e no colágeno. •constituinte da miosina (Proteína contrátil do músculo). •derivado de 4 resíduos de lisina, encontrada na elastina. •derivado da lisina encontrado no colágeno. •encontrado nos fatores de coagulação sangüínea (Protrombina, fator VII, fator IX, fator X, proteína C e S). Aminoácidos incomuns LIGAÇÃO PEPTÍDICA 26 Peptídeos São classificados de acordo com o número de resíduos de AA na cadeia: •Dipeptídeos – 2 resíduos de AA. •Tripeptídeos – 3 resíduos de AA. •Tetrapeptídeos – 4 resíduos de AA. •Pentapeptídeos – 5 resíduos de AA. •Oligopeptídeos – uns poucos resíduos de AA. •Polipeptídeos - são polímeros lineares de até 50 resíduos de AA. •Mais de 50 resíduos é considerado proteína. 27 Classificação dos Peptídeos 28 Ligação peptídica Os menores peptídeos podem ter efeitos biológicos importantes. Ex: Aspartame - L-aspartil-L-fenilalanil metil éster, adoçante artificial. • Hormônios são peptídeos pequenos: • Ocitocina (estimula contração uterina), • Bradicinina (inibe inflamação dos tecidos), • Tirotropina (hormônio da hipófise). • Venenos tóxicos de cogumelos e alguns antibióticos. • Insulina e Glucagon (hormônios pancreáticos). • Corticotropina (estimula córtex adrenal). 29 PEPTÍDEOS DE IMPORTÂNCIA BIOLÓGICA Funcionam como mensageiros químicos na comunicação entre células. • Glicina, ácido γ–aminobutírico (GABA) e a dopamina são neurotransmissores. • Histamina, produto da descaboxilação da histidina, potente mediador local em reações alérgicas. • Tiroxina, hormônio tireóideo, derivado da tirosina. 30 Funções especializadas dos Aminoácidos Estrutura da proteína 31 • Primária • Secundária • Terciária • Quaternária Figura 1: Níveis da estruturas das proteínas Fonte: Voet, 2008 Estrutura Primária Estrutura Primária: - Corresponde à sequencia de aminoácidos - Determinada geneticamente Estrutura Primária Estrutura Primária: - Corresponde à sequencia de aminoácidos - Determinada geneticamente A função de uma proteína depende de sua sequência de aminoácidos??? • Conformação Visão geral - Estrutura das proteínas • Conformação – Proteínas nativas • Estabilização – Ligações de dissulfeto – Interações fracas Visão geral - Estrutura das proteínas Ligação peptídica Ligação peptídica Estrutura Secundária Estrutura Secundária – α Hélice Estrutura Secundária – Folhas ß-pregueadas Estrutura Secundária – Folhas ß-pregueadas Estrutura Secundária – Voltas ß Mioglobina (α-hélice) Concanavalina A (Folha ß pregueada) Toxina Diftérica (α-hélice + folha ß) Estrutura Terciária Ligações que estabilizam a estrutura terciária 1- Interações hidrofóbicas 2- Pontes de hidrogênio 3- Interações iônicas Estrutura Terciária Estrutura Quaternária • Extrato bruto • Preparação pura • Estabilização das proteínas: – pH, – temperatura, – presença de enzimas degradativas, – adsorção às superfícies, – armazenamento à longo prazo • Purificação e métodos de separação (2 etapas) Purificação e análise de proteínas Solubilidade das proteínas Solubilidade das proteínas Diálise de proteínas Cromatografia em colunas Cromatografia de troca iônica Cromatografia de Exclusão Cromatografia de Afinidade Métodos Eletroforéticos – SDS-PAGE Gel de poliacrilamida (PAGE) peneira molecular, SDS dodecilssulfato de sódio (carregado -) Eletroforese de proteínas Eletroforese de proteínas Focalização isoelétrica 57 Eletroforese Bidimensional: 1a. Focalização isoelétrica; 2a. Incorporação de SDS e separação por massa molecular em PAGE. Eletroforese de proteínas
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