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REGULAÇÃO GÊNICA Informação genética... Informação genética... • Síntese de proteínas; • Mecanismos de regulação: – Gene RNA mensageiro Proteína = Expressão Gênica Diferencial; – Ligar/desligar um gene específico ou grupos de genes; Logo, o objetivo da regulação é… • Procariotos: – Ajuste às mudanças nutricionais no ambiente; – Crescimento e divisão otimizados. • Eucariotos: – Desenvolvimento embrionário; – Diferenciação. Diferenciação celular Desenvolvimento embrionário Pontos de regulação... • Efetores são pequenas moléculas (aminoácidos, açúcares, íons de ferro...) que se ligam a proteínas específicas. Regulação Negativa Regulação Negativa Regulação Positiva Regulação Positiva Regulação gênica em procariontes Em procariotos... • Operon: grupo de genes são expressos como uma unidade, além do promotor e das regiões regulatórias; • Geralmente, os genes de um operon codificam proteínas que atuam em uma mesma via metabólica, geralmente catalisando reações sequenciais. Trabalhos de Jacob e Monod • François Jacob e Jacques Monod (década de 50); • Metabolismo da Lactose: Operon lac; • Marco na compreensão do controle da transcrição; • Corroborado por Walter Gilbert e Benno Muller-Hill (1966), isolaram o repressor. Metabolismo da Lactose • Se houver glicose (monossacarídeo) no meio, a bactéria utiliza a glicose como fonte de energia; • Porém, em baixa ou nenhuma concentração da glicose no meio, a bactéria terá que optar por uma fonte alternativa de energia, no caso, a lactose (dissacarídeo); • B-galactosidase, permease e transacetilase. Operon lac Operon Lac: ~6000 bp Operador ocupa 26bp de lacZ Operon lac • Genes estruturais: – lac Z (β-galactosidase), lac Y (permease) e lac A (transacetilase); • Regiões reguladoras: – Promotor e operador; • Associado ao operon, havia a produção, de forma constitutiva, do gene regulador I (repressor). Operon lac Gene regulador Promotor Operador Proteína RNA polimerase Repressor ativo Sem RNA • Sem lactose, repressor ativo, operon desligado O operador Operador ocupa 26bp de lacZ Operon lac • Com lactose, repressor inativo, operon ligado Operon lac Repressor inativo Lactose (indutor) Proteína RNA polimerase Operon lac • O controle indutor-repressor do operon lac é um exemplo de controle negativo; • Um segundo sistema que atua neste operon é CAP-cAMP (controle positivo); – Enquanto tiver glicose no meio a célula irá manter sua maquinaria metabólica, mesmo na presença de lactose; – Quanto maior a concentração de glicose, menor a quantidade de cAMP, que é necessário (em altas concentrações) para a ativação do operon lac. Operon lac (a) Glicose alta ATP (b) Glicose baixa Adenilato ciclase inativa Sem cAMP Adenilato ciclase ativa ATP cAMP (a) Com glicose (cAMP baixo); sem lactose; sem mRNA lac (b) Com glicose (cAMP baixo); com lactose; pouco mRNA lac (c) Sem glicose (cAMP alto); com lactose; muito mRNA lac Pouco mRNA lac Muito mRNA lac Indutor-repressor Indutor-repressor Lactose Lactose Repressor Produção quase nula, basal Operon trp • Foi caracterizado por Charles Yanofsky; • O operon do triptofano (operon trp) é formado por genes que codificam as enzimas necessárias à síntese deste aminoácido, sistema de inibição feedback; • O aminoácido triptofano é um constituinte de diversas proteínas. Operon trp • Genes estruturais: – enzimas necessárias a síntese de triptofano (trpE, trpD, trpC, trpB, trpA); • Regiões reguladoras: – Promotor, operador e sequência líder – 5’UTR (atenuador); • O gene regulador trpR (repressor) é produzido de forma inativa. Operon trp Operon trp • Sem trp, repressor inativo, operon ligado Repressor inativo RNA polimerase Enzimas para síntese do triptofano Operon trp • Com trp, repressor ativo, operon desligado Inativo Ativo Triptofano (correpressor) RNA polimerase Operon trp • Como no operon lac, há outro nível de controle superposto ao mecanismo básico repressor-operador; • Sequência líder, 160 pares de bases antes da primeira trinca no gene trpE; • Atenuador leva a redução na taxa de transcrição de mRNA quando o triptofano está presente. Operon trp • Yanofsky descobriu que mesmo na presença de altas concentrações de triptofano, as primeiras 141 bases da sequência líder eram sempre transcritas na taxa máxima; • Mas, devido ao mecanismo atenuador, apenas 1 em 10 dos mRNA podiam ser transcritos até o fim. • Como funciona? Estrutura tridimensional Transcrição / Tradução Gene Fator Uso rpoD σ70 Geral rpoS σS Estresse rpoH σ32 Choque Térmico rpoE σE Choque Térmico rpoN σ54 Nitrogênio fliA σ28 (σF) Flagelar • Existem vários tipos de fatores sigmas, cuja função é direcionar a RNApol a regiões promotoras de interesse, importância adaptativa. A regulação pelo fator sigma Sensação térmica Resumindo regulação em procarioto... • Esses organismos necessitam ter mecanismos rápidos e eficientes de adaptação a mudanças no ambiente; • Produtos gênicos que funcionam em conjunto, normalmente tem regulação da expressão semelhante, ou estão organizados em operons; Resumindo regulação em procarioto... • A transcrição da maioria dos genes está em um estado “bloqueado”, pela ligação de proteínas inibidoras; • A dissociação dessas depende de um indutor, normalmente uma molécula pequena, que “sinaliza” a mudança ambiental. A importância • Fundamental em vários processos: – Interações com organismos eucarióticos complexos (simbiose) – Regulação da virulência – Formação de biofilme – Inibidor de crescimento populacional A comunicação bacteriana “Quorum sensing” A comunicação bacteriana “Quorum sensing” Simbiose Aliivibrio fischeri – lula havaiana • Bactéria produz luz (luciferase) em um órgão especial da lula – uso em camuflagem de sombras Biofilme Tártaro: exemplo de biofilme Regulação em Eucariontes Pontos de regulação... Regulação por histonas As modificações As caudas das histonas podem sofrer modificações pós- traducionais que aumentarão ou diminuirão a carga positiva das histonas As modificações -ACETILAÇÃO DE HISTONAS: associação com transcrição (enzimas são co-ativadoras transcricionais); -METILAÇÃO DE HISTONAS: H3 e H4 (mais comum) – modificação estável – marcador epigenético para manutenção do estado da cromatina por longo período. -UBIQUITINIZAÇÃO E BIOTINILAÇÃO: pouco conhecidos - FOSFORILAÇÃO: H1 (mais comum) e H3 – aumenta a dissociação da cromatina. Como retirar as histonas? Metilação do DNA Imprinting genético Metilação de DNA e o silenciamento gênico O papel dos íntrons Os microRNA (miRNA) O genoma humano pode codificar 1.000 tipos diferentes de miRNA. Esses RNAs tem 22 nucleotídeos de tamanho e podem reconhecer cerca de 90% dos genes humanos. Todos os organismos eucariontes possuem tal RNA.
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