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ENZIMAS Introdução Enzima: é uma molécula orgânica (proteína ou RNA) que catalisa uma reação química especifica Catalisador: toda substancia que aumenta a velocidade de uma reação, sem ser consumida durante o processo Todas as enzimas são proteínas, exceto por um pequeno grupo de moléculas de RNA que tem ação catalítica Tem um alto grau de especificidade com o substrato Tem poder catalítico muito maior que catalisadores sintéticos As estruturas 1°, 2°, 3° e 4° são essenciais para sua ação Dependem do PH do meio para agir. A pepsina tem PH~2 e a glicose-6-fosfatase tem PH~8 O ph altera a carga elétrica dos aminoácidos das proteínas e isso pode mudar a estrutura da molécula e fazer com que a enzima perca sua função Algumas enzimas não precisam de nenhum elemento adicional para ter ação, outras precisam e esse elemento a mais se chama Cofator, que pode ser uma molécula inorgânica, como Fe, Mg, Zn, ou orgânica, como as coenzimas Por exemplo, a urease, a qual quebra a uréia precisa de um átomo de Níquel (Ni--) para se tornar funcional Coenzimas: são carregadores de grupos funcionais específicos, são em grande parte derivadas de vitaminas ou nutrientes orgânicos Algumas enzimas precisam tanto de um íon inorgânico como de uma coenzima Grupo prostético: é chamado assim as coenzimas ou íons que se ligam fortemente a uma enzima Holoenzima: é a enzima completa cataliticamente ativa Apoenzima/Apoproteína: parte proteica da enzima Classificação e nomenclatura São nomeadas de acordo com sua atividade e tem o sufixo “ase”. Exemplo: uréase, catalisa a hidrolise da uréia Exemplos de cofatores Exemplos de Coenzimas ÍON ENZIMAS Cu++ Citocromo-oxidase K+ Pirtuvato-cinase Zn++ Anidrase carbônica Existiam muitas enzimas com o mesmo nome e por isso foi proposto um sistema de nomenclatura de enzimas Ex.: Glicose-fosfotransferase catalisa a transferência de um fósforo do ATP para a glicose, sendo glicose o receptor, fosforo o elemento e transferase a transferência As oxiredutases transferem elétrons, as liases quebram duplas ligações Transferases transferem grupos, Hidrolases quebram a agua Colisão de moléculas Para que as reações ocorram, as moléculas precisam se chocar efetivamente (os locais ativos dos produtos precisam se chocar no lugar certo) Funcionamento CONCEITOS A reação ocorre dentro de um sitio ativo. O contorno do sitio ativo tem aa com cadeias laterais que se ligam ao substrato fortemente A molécula que se liga no sitio ativo é o substrato e é a substancia cuja reação vai ser catalisada O ponto de partida da reação é chamado de estado fundamental o equilíbrio da reação entre os reagentes e produtos é a diferença entre suas energias quando o delta-G é negativo, a reação é favorecida para o lado dos produtos, quando é positivo, a reação é favorecida para o lado dos reagentes FUNCIONAMENTO EM UMA ÚNICA ETAPA Primeiro, o substrato deve se ligar ao seu sitio ativo. Os radicais dos aminoácidos ao redor do sitio devem ser compatíveis com o substrato, por exemplo, se o substrato for uma molécula polar, o radical do aa do sitio ativo deve ter caráter polar compatível para possibilitar a ocorrência de uma ponte de hidrogênio por exemplo. Se o substrato tiver grupos tiol, os aminoácidos do sitio podem ser metionina ou cisteina, para possibilitar a ocorrência de uma ligação dissulfeto, e assim por diante. A enzima pode catalisar tanto a reação direta quanto inversa. As reações químicas tendem ao equilíbrio, por isso a conversão do substrato em produto pode ser acelerada pela enzima, tanto quanto a reação do produto em substrato novamente, isso se chama estado de transição. Reagente + enzima = produto ou produto + enzima = reagente Para a reação ocorrer, a barreira energética, chama de energia de ativação, entre o reagente e produto precisa ser ultrapassada. Essa energia é a responsável por alinhar os grupos reagentes, fazer com que eles colidam efetivamente, quebrar a ligação inicial entre os reagentes, formar a ligação entre as moléculas para formar o produto, etc O topo da curva de energia livre é o ponto em que a formação de produtos ou de reagentes novamente tem a mesma probabilidade, isto é, a molécula pode continuar a reagir e formar o produto desejado, ou pode regredir a sua forma original, continuando como reagente e não formando o produto (estado de transição) O estado de transição não é a mesma coisa que intermediário de reação, que é a ligação do substrato a enzima ou do produto a enzima. Ele é um momento molecular transitório em que eventos como a quebra de ligações e a formação de ligações ocorrem com a mesma probabilidade de seguirem tanto para o lado dos produtos como dos reagentes Como já foi dito, as reações tendem a entrar em equilíbrio, por isso, tanto a formação de produtos como a volta para a forma de reagente acontecem naturalmente, pois o excesso de produto no nosso corpo pode ser prejudicial para as células, assim como o excesso de reagente, provocando a falta do produto que a célula precisa. COENZIMA GRUPO Coenzima A Acil B12 H+ FUNCIONAMENTO COM VÁRIAS ETAPAS Quando há varias etapas na reação, pode-se ocorrer a formação e consumo de espécies químicas transitórias, denominadas intermediários da reação Os complexos transitórios da enzima+substrato e produto+enzima podem ser considerados intermediários de reação Na teoria, quando uma reação tem várias etapas, a velocidade final é determinada pela etapa com maior energia de ativação Na pratica, as varias etapas podem ter energias de ativação semelhantes, fazendo com que a velocidade seja determinada por todas elas Importância da energia de ativação A barreira da energia de ativação é fundamental para o nosso metabolismo, pois sem essa barreira, as macromoléculas seriam espontaneamente transformadas em compostos menores e mais simples e não teria mais como estocar grandes compostos nas células. O glicogênio, por exemplo, libera glicose aos poucos, quando a celula precisa de energia. Se não houvesse a energia de ativação, não poderia haver glicogênio na celula pois ele seria continuamente transformado em glicose e assim não teríamos uma reserva de energia COMO BAIXAR A ENERGIA DE ATIVAÇÃO SEM ENZIMA? Elevação da temperatura, pela maior movimentação das moléculas Aumento da pressão e menor espaço para movimentação das moléculas, facilitando colisão O catalisador em si, que pode ser uma enzima, faz baixar a energia de ativação Quanto menor a energia de ativação, mais rápido a reação acontece Exemplo de reação Conversão da sacarose e oxigênio em gas carbônico e agua Essa reação requer uma grande energia de ativação, sendo naturalmente lenta. Dentro da celula, ela ocorre de maneira rápida, dada a ação catalizadora das enzimas, e a energia liberada pela quebra das ligações é armazenada e usada para outras atividades dentro da celula. COMO AS ENZIMAS CONSEGUEM DIMINUIR A ENERGIA DE ATIVAÇÃO? Alguns tipos de reações químicas ocorrem entre o substrato e os grupos funcionais das enzimas (como cofatores, ions metálicos, grupos polares,...) Os grupos funcionais das enzimas podem formar ligações transitórias com um substrato e ativá-lo Um grupo funcional da enzima também pode ser transferido para o substrato, ativando-o Esse tipo de reação, geralmente, ocorre só no sitio ativo da enzima. Esses tipos de reações diminuem a energia de ativação por fazerem com que uma reação ocorra em um lugar mais “apropriado”(com grupos ligantes como no sitio funcional da enzim) Outro meio de acelerar as reações é por meio de interações não covalentes entre a enzima e o substrato Algumas interações fracas, como as que acontecem na estrutura quaternária das proteínas, ocorre entre o substrato e o sitio ativo da enzima Um exemplo é a acetilcolinesterase que se liga em dois lugares a acetilcolina. As interações fracas formadas entre o substrato e a enzima vao desestabilizar o composto e torna-lo mais propenso a se quebrar e assim ele irá formar novos compostos, como nesse caso, o acido acético e a colina ENCAIXE DO SUBSTRATO E ENZIMA O modelo mais aceito atualmente e o encaixe induzido O substrato induz uma mudança conformacional no sitio ativo da enzima, quando é ligado a ela e essa transformação é a responsável pelo processo catalítico da enzima Ou seja, o substrato tem capacidade de induzir uma mudança tridimensional no seu sitio ativo Essas mudanças conformacionais podem ter diferentes amplitudes, ela pode ser no sitio ativo em si ou em outras partes da enzima O modelo antigo era o de chave-fechadura A enzima é complementar ao seu substrato A enzima poderia reagir somente com o seu substrato, nenhuma outra molécula teria acesso a ele Essa teoria de encaixe induzido pode ser aplicado a medicamentos, que agem como antagonistas, que podem, ao contrário de promover a catálise enzimática, reduzir a condutância de um canal iônico por exemplo COMO AS ENZIMAS USAM A ENERGIA DE LIGAÇÃO? A cada ligação fraca estabelecida, um pouco de energia é liberado e essa energia se chama energia de ligação A energia de ligação é usada pela enzima e ajuda a estabilizar o completo ES, para catalisar, para a especificidade, ... Especificidade Se o sitio ativo de uma enzima tiver grupos funcionais organizados otimamente de modo que se forme uma grande variedade de interações fracas com determinado substrato, a enzima não será capaz de interagir com a mesma intensidade com outra molécula Se o substrato tiver um grupo tiol que forme uma ligação dissulfeto com um resíduo especifico de cisteína de uma enzima, qualquer molécula que não tiver um grupo tiol naquela exata posição não poderá substituir aquele substrato Por isso a especificidade depende das interações fracas
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