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Libro de Abstarcts GENETICS

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design. Esta aproximación 
combinada enriquece la cobertura de los genes diana con respecto a la secuenciación exómica. La 
secuenciación de las librerías, alineamiento, variant caller y anotaciones se realizaron en las plataformas 
de secuenciación Ion ProtonTM y Ion S5TM con Torrent Suite software y ION Reporter. 
3 Resultados 
Se analizaron un total de 122 pacientes (45% mujeres y 56% varones), de los cuales 90 fueron referidos 
con el diagnóstico de encefalopatía epiléptica de inicio precoz (EEIE). Se identificaron variantes 
potencialmente causales en el 49% (44/90) de los casos de EEIE, siendo en los genes SCN1A, KCNT1, 
SPTAN1, los más frecuentemente representados. En pacientes con otras manifestaciones fenotípicas la 
rentabilidad diagnóstica fue del 19% (6/32), identificándose variantes patogénicas en los genes ATP1A2, 
TPP1. En el global de pacientes analizados el 39% (66/169) de las variantes, estaban asociadas a un gen 
con herencia autosómica dominante. Se obtuvo un mayor número de variantes de significado incierto en 
los genes RYR3, GPR98 y FASN. La actualización recurrente de los genes a analizar, los estudios de 
segregación familiar, y el análisis de otros tejidos en los casos de mosaicismo, como en CDKL5 o en 
mecanismos hereditarios de interferencia celular como en PCDH19, han sido determinantes. 
 
4 Conclusiones 
El estudio genético de epilepsia mediante secuenciación de exoma enriquecido, es una estrategia 
diagnóstica con un óptimo ratio coste-efectividad. Establecer una adecuada correlación genotipo-fenotipo 
facilita una aproximación precisa al manejo clínico del paciente. 
 
 
 
Sesión: Farmacogenética y Cáncer Esporádico 
 
 
C0487 DETECCIÓN TEMPRANA DE CÁNCER COLORECTAL CON UN TEST DE SANGRE 
PERIFÉRICA: EVALUACIÓN DE LA METILACIÓN DEL GEN SEPT9 EN 2272 MUESTRAS 
DE POBLACIÓN ESPAÑOLA 
Beatriz Hidalgo Calero, Amanda Herranz Cecilia, Miriam León Otegui, Evangelina Pestaña Molinero, Alberta 
Belinchon Martinez, José Antonio López García-Asenjo 
 
Servicio de Genética, Synlab Diagnósticos Globales (Madrid) España 
 
1 Objetivos 
En España, el programa de detección precoz de cáncer de colorectal (CCR) mediante el test de sangre 
oculta en heces, ofrecido por la sanidad pública, tiene una baja aceptación. 
Actualmente se ofrecen nuevas opciones de cribado mediante la detección de marcadores de CCR en 
plasma de sangre periférica; el test “Septina9” detecta el estado de metilación del gen SEPT9, tiene 
una sensibilidad y especificidad de 80,6% y 99,3%, respectivamente, y el valor predictivo positivo es del 
47,5% (datos del fabricante), mientras que la del test de sangre oculta en heces tiene una sensibilidad y 
especificidad de 61-69% y 91-98%, respectivamente (1, 2). 
El objetivo de nuestro trabajo es realizar una revisión de los 2272 casos informados desde 2012 de 
población asintomática y mixta (de bajo y alto riesgo), donde se ha estudiado la metilación del gen SEPT9 
como marcador molecular de cáncer colorectal. 
2 Material y Método 
Se estudió 2272 muestras de plasma en población asintomática española, de bajo y alto riesgo, recogidas 
entre 2012 y 2016. 
Se realizó el ensayo Epi proColon 2.0 siguiendo las instrucciones del fabricante, tanto en la técnica como 
en el análisis (Roche LightCycler480). 
3 Resultados 
De las 2272 muestras recibidas, 154 (6,8%) fueron rechazadas previo al estudio debido, principalmente, a 
una mala conservación de la muestra durante el envío. De las 2118 muestras analizadas 148 se informan 
como positivas (7%), y 1970 como negativas (93%) 
4 Conclusiones 
El ratio de positividad (7%) es superior al descrito en la literatura (3,4%) analizado en población general 
(3); asumimos que se detectó un 3,6% de paciente con CCR y adenoma avanzados. 
La aceptación del programa de detección precoz de CCR mediante muestra de sangre periférica es 
cómoda y eficaz, lo que genera una mayor aceptación del estudio, permitiendo un mejor cumplimiento de 
dicho programa (4). 
 
 
C0280 CARACTERIZACIÓN BIOINFORMÁTICA DE LA REGULACIÓN EPIGENÉTICA DEL 
MICROARNOMA EN CÉLULAS TUMORALES DE CÁNCER DE PULMÓN Y OVARIO 
RESISTENTES A CISPLATINO 
Carlos Rodriguez Antolin1, Olga Pernía1, Fátima Sanchez-Cabo2, Ron Schuller3, Olga Vera1, Julia Jiménez1, Ana 
Dopazo2, Javier De Castro1, Inmaculada Ibáñez1 
 
1Hospital Universitario La Paz madrid (Madrid) España 
2Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares (Madrid) España 
3Centro Nacional de Análisis Genómicos (Cataluña) España 
 
1 Objetivos 
El resultado de nuestro trabajo tiene como objetivo identificar los microARNs inactivados 
epigenéticamente en cáncer de pulmón no microcítico (CPNM) y cáncer de ovario (CO) como 
consecuencia del tratamiento con cisplatino (CDDP) y cuya inhibición involucre el posible desarrollo de 
resistencia. 
2 Material y Método 
Analizamos el conjunto de micoARNs (microARNoma) inhibidos en resistencia y reactivados tras 
tratamiento con 5aza-dC y TSA en cuatro líneas celulares resistentes y sensibles a CDDP utilizando 
microarrays de expresión, seguido de la valoración de su estado de metilación a partir de la secuenciación 
del genoma completo modificado por bisulfito. Los candidatos se validaron por qRT-PCR y secuenciación 
por bisulfito. 
3 Resultados 
Encontramos 19 micrARNs con expresión diferencialmente inhibida (FDR<0.05) en el fenotipo resistente 
frente a los fenotipos sensibles y tras el tratamiento de reactivación (14 en CPNM, 7 en CO y 2 en 
ambos). De ellos, cuatro microARNs poseen hipermetilación en su zona promotora en el fenotipo 
resistente, mientras dos presentan hipermetilación en la zona promotora del gen huespéd. En al menos 
uno de ellos se valida el cambio en expresión y metilación. Las predicciones de interacción de estos seis 
microARNs con sus posibles genes diana indican que pueden estar regulando rutas de control de ciclo 
celular, respuesta a fármacos, estrés celular y daños en el ADN, todas ellas de gran implicación en el 
desarrollo y mantenimiento del proceso tumoral. 
4 Conclusiones 
1-De los 19 candidatos indentificados, en al menos seis la regulación de su expresión está vinculada a 
modificaciones en el perfil de metilación de la correspondiente área reguladora. 2-Se presenta por tanto 
una potencial herramienta que aportaría información novedosa sobre el perfil de respuesta a platino, 
basada en elementos de regulación epigenéticos de la expresión de microARNs y que podrían ser 
empleados como biomarcadores predictivos de uso clínico. 
 
 
C0116 ANALISIS DE MIRNAS ASOCIADOS A LOS DISTINTOS PATRONES DE 
AMPLIFICACIÓN DE EGFR EN EL GLIOBLASTOMA 
Lisandra Muñoz Hidalgo1, Concha López Ginés2, Javier Megías Vericat2, Rosario Gil Benso2, Teresa San Miguel2, 
Miguel Cerdá Nicolás2 
 
1INCLIVA Valencia (Valencia) España 
2Universidad de Valencia (Valencia) España 
1 Objetivos 
El Glioblastoma (GB) es el tumor de mayor agresividad biológica y clínica de los tumores primarios del 
SNC, con una supervivencia promedio de 12 meses. La amplificación del receptor del factor de 
crecimiento epidérmico (EGFR) presente en el 50-70% de los GBM es uno de los cambios genéticos más 
frecuente. Los miRNA, son RNAs de pequeño tamaño, que regulan la expresión del RNAm. Los genes 
implicados en las vías de señalización están también regulados por miRNA, entre ellas, las vías de 
señalización dependientes de EGFR. 
Este trabajo tiene como objetivo el estudio de la expresión de los miRNAs en el GB y el análisis 
comparativo con los diferentes niveles de amplificación del EGFR. Estos estudios están orientados a 
definir perfiles distintos en los GB, que permitan establecer criterios pronósticos y terapéuticos. 
2 Material y Método 
El estudio está basado en 46 tumores diagnosticados de GBs primarios. Se caracterizaron las muestras 
tumorales mediante un estudio clínico, morfológico,