Lista de Exercícios

Prévia do material em texto

MINISTÉRIO DA EDUCAÇÃO 
UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO 
INSTITUTO DE BIOLOGIA 
DEPARTAMENTO DE GENÉTICA 
 
Lista de Exercício 1 
Aluno:_______________________________________________________________ 
1. Descreva os tipos de ligações químicas na dupla hélice de DNA. 
2. Explique o que significam os termos replicação conservativa e semiconservativa. 
3. Qual o significado de primer, e por que os primers são necessários para replicação de DNA? 
4. O que são helicases e topoisomerases? 
5. Por que a síntese de DNA é contínua em um filamento e descontínuo no filamento oposto? 
6. Se os quatro desoxinucleotídeos mostrassem pareamento inespecífico de bases (A com C, A 
com G, T com G e assim por diante), a informação única contida em um gene seria mantida 
a cada ciclo de replicação? Explique. 
7. Se não houver helicases durante a replicação, o que aconteceria com o processo de 
replicação? 
8. Ambos os filamentos de uma molécula de DNA são replicados simultaneamente de modo 
contínuo em um filamento e descontínuo no outro. Por que um filamento pode ser 
totalmente replicado (de ponta a ponta) antes que a replicação do outro tenha começado? 
9. O que aconteceria se, no curso da replicação, as topoisomerases fossem incapazes de 
reconectar os fragmentos de DNA de cada filamento após a deselicoidização (relaxamento) 
da molécula de DNA? 
10. As polimerases geralmente adicionam apenas 10 nucleotídeos a um filamento de DNA 
antes de se dissociarem. Entretanto, durante a replicação, a DNA pol III pode adicionar 
dezenas de milhares de nucleotídeos a uma forquilha em movimento. Como é feita essa 
adição? 
11. Se a timina constitui 15% das bases em uma molécula específica de DNA, que porcentagem 
das bases é de citosina? 
12. Se o conteúdo GC de uma molécula de DNA é 48% quais as porcentagens das quatro bases 
(A, C, T, g)? 
13. Considere o seguinte segmento de DNA, que parte de uma molécula muito maior 
constituindo um cromossomo: Se a DNA polimerase começar a replicar o seguimento 
abaixo a partir da direita: 
5’ ... ATTCGTACGATCGACTGACTACAGT ... 3’ 
3’ ... TAAGCATGCTAGCTGACTGATGTCA ... 5’ 
a) Qual será o molde para o filamento contínuo? 
b) Desenhe a molécula quando a DNA polimerase está metade do caminho desse 
seguimento. 
c) Desenhe as duas moléculas filhas completas. 
d) O seu diagrama na letra b é compatível com a replicação bidirecional de uma única 
origem, o modo usual de replicação? 
Transcrição 
14. Descreva, em eucariotos e procariotos, o que mais está acontecendo ao RNA enquanto a 
RNA polimerase está sintetizando um transcrito do molde de DNA. 
15. Cite três exemplos de proteínas que atuam nos ácidos nucléicos e descreva suas ações. 
16. Por que o RNA é produzido apenas a partir do filamento – molde de DNA e não de ambos 
os filamentos? 
17. Existe similaridade nas bolhas de replicação de DNA e nas bolhas de transcrição 
encontradas nos eucariotos? Explique. 
18. Uma pesquisadora estava induzindo mutações em células procarióticas, inserindo 
segmentos de DNA. Desse modo, ela fez a seguinte mutação: 
Original: TTGACAT 15 a 17pb TATAAT 
Mutante: TATAAT 15 a 17 pb TTGACAT 
a) O que essa sequência representa? 
b) Qual o efeito você prevê para tal mutação? Explique. 
19. Desenhe um gene procarioto e seu produto RNA. Não se esqueça de incluir o promotor, o 
sítio de início da transcrição, o sítio de término da transcrição, as regiões não traduzidas e 
as pontas 5’ e 3’ marcadas. 
20. Desenhe um gene eucarioto com dois íntrons, e seus produtos pré-mRNA e mRNA. Esteja 
seguro de incluir todas as características do gene procariótico, mais os eventos dos 
processos necessários para produzir o mRNA. 
21. Determinado gene codificador de proteínas de Drosophila tem um íntron. Se uma grande 
amostra de alelos nulos desse gene for examinada, alguns sítios mutantes serão esperados. 
a) nos éxons? b) no íntron? c) no promotor? d) no limite íntron – éxon? 
22. O que são íntrons recompostos e por que a sua existência confirma a sua existência 
confirma a teoria de que o RNA surgiu antes das proteínas? 
23. Antibióticos são substâncias que matam seletivamente as bactérias sem prejudicar os 
animais. Muitos antibióticos atuam de maneira seletiva em determinadas proteínas que 
são críticas para o funcionamento das bactérias. Explique por que alguns dos mais bem-
sucedidos antibióticos têm como alvo a RNA polimerase bacteriana. 
 
Tradução 
24. A partir do código genético proposto, complete o quadro que se segue. Suponha 
que a leitura é da esquerda para a direita e que as colunas representam alinhamentos 
transcricionais e traducionais. a) Marque as extremidades 5’ e 3’ do DNA e do RNA. 
b) Quantos aminoácidos são transcritos e traduzidos? 
Exons Introns Exons Introns 
C T Dupla hélice de DNA 
(considere a 2ª fita como codificante) A G A 
 C A U RNAm transcrito 
 G U A Traduzido 
 A C U U C C Anticódon apropriado de RNAt 
 Tre Ser Aminoácidos incorporados à proteína 
25. Como a tradução é iniciada e terminada? 
26. Desenhe um esquema que representa a tradução em eucariotos. 
27. Como são relacionadas às sequências e um gene e sua proteína correlata? 
28. Por que se diz que o código genético é não superposto e degenera? 
29. Qual é a evidência de que o rRNA, e não as proteínas ribossômicas efetua as principais 
etapas da tradução? 
30. O que é o processamento pós-tradução, e por que é importante para o funcionamento da 
proteína? 
31. As bases A, G, U, C, I (inosina) ocorrem nas posições 5’ de anticódon do tRNA. a) Que base 
pode fazer par com três bases diferentes nas posições 3’ de códons no mRNA? 
 
Regulação da expressão gênica 
32. De que modo variam os níveis de transcrição gênica e tradução do DNA? 
33. Como as células ou os vírus percebem mudanças ambientais e disparam alterações na 
expressão gênica? 
34. Quais são os mecanismos moleculares de regulação gênica nas bactérias? E nos eucariotos? 
35. Explique as diferenças fundamentas entre controle positivo e o controle negativo? 
36. Como os eucariotos geram muitos padrões diferentes de expressão gênica com um número 
limitado de proteínas reguladoras? 
37. Que papel a cromatina tem regulação gênica eucariótica? 
38. Quais são as marcas epigenéticas e como influenciam a expressão gênica? 
39. Que papeis as moléculas de RNA desempenham na repressão da expressão gênica 
eucariótica? 
40. O que é atenuação e qual o seu mecanismo? 
41. Organize os processos a seguir em ordem cronológica, partindo do que ocorre primeiro: a) 
recomposição de uma molécula de RNA; b) migração de uma molécula de mRNA para o 
citoplasma, c) transcrição de um gene; d) degradação de uma molécula de RNA; e) síntese 
do polipeptídio. 
42. Indique os fatores que estão associados à atividade ou inatividade do gene. 
43. Qual o mecanismo de igualação do nível de expressão de genes ligados ao X nos dois sexos 
em a)seres humanos b)moscas e vermes? 
 
Bom estudo!!!