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Genética Aplicada à Pesca e Aquicultura Prof. Renato César – 3366-9160 renatocesarufc@gmail.com Horário:3as e 5as das 9-12h . Local: Sala de aula do CEBIAQUA bloco 872. Pré-requisitos: Introdução à Bioquímica e Fisioecologia de Organismos Aquáticos Objetivo(s) da Disciplina: Fornecer aos alunos informações básicas sobre genética aplicada à pesca e aquicultura, para que sejam utilizadas em trabalhos teóricos e práticos sobre esta temática. Ementa: 1. Genética Básica: Padrões de herança mendeliana. Noções de genética quantitativa e de populações. Tópicos de genética moderna. Dogma central da biologia molecular. Mecanismos de regulação da expressão gênica. Tecnologia do DNA recombinante; clonagem e transformação de plantas e animais. 2. Parâmetros genéticos: Fenótipo, variabilidade, médias, repetibilidade e correlações. Estudos de caso - Crustáceos peneídeos, ciclídeos. 3. Características Qualitativas: Cromossomos, locus gênico e alelos. Dominância, formação dos gametas. Determinação de herança qualitativa. Estudos de casos – Herança padrões de coloração 4. Características Quantitativas: Efeitos Genéticos e variação fenotípica. Desvios de dominância. Influência das variações observadas nos efeitos genéticos. Utilidade da estimativa de variação genética: herdabilidade. Estudos de casos – cruzamento direto, identificação ou segregação de grupos familiares, interpretação e aplicação de estimativas de herdabilidade 5. Seleção e Herdabilidade: Estimativa e predição de herdabilidade. Aplicação da seleção. Respostas correlatas. Técnicas multi-fatoriais. Melhoramento da eficiência da seleção. Uso de dados familiares e de pedigree. Seleção e domesticação de espécies. Seleção indireta através de práticas de produção. Alteração de tolerâncias ambientais. Diferenças sexuais. Interações entre genótipo e ambiente 6. Endocruzamentos, Cruzamentos e Hibridização: Dominância e efeitos de características multi-locus. Genética de populações, Genética Molecular e efeitos da dominância. Utilização dos efeitos da dominância para melhoramento genético. Possibilidades do uso de hibridizações. Impacto dos endocruzamentos. Uso de heterose em ambientes de produção. Efeitos maternais. Combinação de espécies e variedades. Híbridos monossexuais e estéreis. Combinação apropriada de reprodutores e gametas. 7. Determinação e controle sexual:Estoques monosexuais homogaméticos. Estoques monosexuais heterogaméticos. Influências ambientais e genéticas. Estudos de casos – tilápias, crustáceos. 8. Organismos Aquáticos Transgênicos: Definição de Transgenia. Principais métodos: microinjeção, eletroporação, balística, lipofecção, incorporação e integração. Estudos de caso – catfish indiano, tilápia, salmão do atlântico, carpas, “glow-fish”. Bibliografia Básica: BOWMAN, John C. Introdução ao Melhoramento Genético Animal. Coleção Temas de Biologia, Volume 5. São Paulo: EDUSP, 1981. 87p. v FILHO, Euclides Kepler. Melhoramento genético Animal no Brasil. Disponível online no endereço. http://www.cnpgc.embrapa.br/publicacoes/doc/doc75/. GRIFFITHS, A.J.F., et al. 2006. Introdução à Genética. Rio de Janeiro, Ed. Guanabara Koogan, 8ª ed, 408p. GRIFFITHS, A.J.F. et al., 2001. Genética Moderna. Rio de Janeiro, Ed. Guanabara Koogan, 352p. LUTZ, C.G. Practical Genetics for Aquaculture. New York: Blackwell Publishing. 2003. 235p. Bibliografia Complementar: BEAUMONT, A.R.; HOARE, K. Biotechnology and Genetics in Fisheries and Aquaculture. London: Blackwell Publishing, 2003. FALCONER, D. S.; MACKAY, T. F. C. Introduction to quantitative genetic. London: Longman, 1996. KINGHORN, B.; VAN DER WERF, J.; RYAN, M. Melhoramento animal (uso de novas tecnologias). São Paulo: FEALQ, 2006. MOREIRA, H.L.M.; VARGA, L.; RIBEIRO, R.P.; ZIMMERMANN, S. Fundamentos da moderna aqüicultura. Canoas: ULBRA Editora, 2001. PEREIRA, J.C. Melhoramento genético aplicado à produção animal. Belo Horizonte: FEPMVZ Editora, 2004.FILHO, Euclides Kepler. Melhoramento animal: conquistas e perspectivas. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 32., 1995, Brasília. Anais...Brasília: SBZ,1995. p.611-615. AULA 1 DEFINIÇÕES DE GENÉTICA SUMÁRIO Porque estudar genética? Bases físicas e químicas da genética Genes a proteínas: Dogma central da biologia molecular Variação genética: alelos, fenótipo, genótipo Metodologias utilizadas em estudos de genética Genes, ambiente e organismo Genes e evolução Genética Humana Porque estudar genética? - Melhoria na produção de alimento - Prevenção de enfermidades: intensificação de cultivo - Biotecnologia - Manejo sustentável de recursos pesqueiros - Melhoramento genético: utilização de produtos químicos GENÉTICA (herança e variação) Hereditariedade – princípios de Mendel primeira e segunda Lei Charles Darwin Gregor Mendel Genética Clássica Populacional Molecular - Watson e Crick Genômica Comparativa Funcional Bases físicas e químicas da genética Genes: seqüência de nucleotídeos ao longo de uma molécula de DNA. Genes diferentes em cromossomos Informações características externas ou não DNA: dupla cadeia de polinucleotídeos Pares de base: A-T, G-C Haplóides (alossomos) bactérias, algas, fungos Diplóides (autossomos) plantas, animais 1 cópia de genoma 2 cópias de genoma (alelo do pai e mãe) Genoma: sequência de DNA completa Genes a proteínas: Dogma central da biologia molecular Proteínas: cadeia linear de polipeptídeos, com 3 estruturas. DNA - mRNA - polipeptídeo (transcrição) (tradução) Variação genética: alelos, fenótipo, genótipo Variação Alelos Alelos – diferentes formas do gene, localizam-se no mesmo locus. Locus – posição do gene no cromossomo homozigotos heterozigoto Fenótipo: expressão do gene, características manifestadas. Genótipo: constituição genética, alelos presentes no indivíduo. Metodologias utilizadas em estudos de genética • Isolamento de mutações • Análises bioquímicas de processos celulares • Citogenética • Manipulação Genética Hibridação; Endogamia; Biotecnologia e Engenharia Genética Genômica – sequenciamento, identificação e localização de genes, clonagem, expressão de genes Bioinformática - sistemas de software para registrar cada parte de uma sequência de genoma; estudo comparativo de genes. Basic Local Alignment Search Tool (BLAST); ClustalW; Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA); Software Treecon Genes, ambiente e organismo 1. Determinismo genético 2. Determinismo ambiental 3. Interação genótipo - ambiente Genótipo – vários fenótipos,dependendo do ambiente Eventos aleatórios desencadeiam variações genéticas. Causas da Diversidade: mutação; migração; recombinação; seleção... Genes e Evolução Evolução – variação na freqüência gênica em uma população, conseqüência de mudanças genéticas na população. Estudo comparativo entre organismos. Genética Humana DNA humano - 80.000 a 100.000 genes Sintetizar > 100.000 diferentes proteínas 3 x 108 pares de bases 3% do genoma humano é formado por genes Biotecnologiae Engenharia genética Desenvolvimento de fármacos Novas variedades de plantas e animais Ética e Segurança AULA 2 ESTRUTURA DE GENES E GENOMAS SUMÁRIO DNA Estrutura dos genes: regiões reguladoras, exons, íntrons Genes de procariontes e eucariontes Natureza e tipos de genomas Cromossomos Funções dos genes: transferência de informações RNA: estrutura, classes, enzimas, processamento Transcrição: fase Proteínas: estruturas e funções Tradução: fases Mutações: definição, tipos, efeitos DNA • codifica a especificação genética do organismo; • armazenador da informação genética; • visível ao microscópio óptico como cromossomos (grego chroma, “cor”; soma, “corpo”); Estrutura tridimensional - Dupla hélice – duas cadeias de polinucleotídeo Base Purina Base Pirimidina Desoxirribose Fosfato Pontes de Hidrogênio A C A T T A T G 5’ 3’ 5’ 3’ DNA complementariedade das bases Fonte: IPGRI Unidades de medida - Pares de base (bp) - kilobase (1kb) - megabase (1Mb) Estrutura do gene Gene: codifica molécula de RNA funcional, possui regiões reguladoras Estrutura dos genes: regiões reguladoras, exons, íntrons Região reguladora – início do gene, não codifica. Intron – Região não codificante de um gene, preenchimento (função desconhecida). Exon – Região codificadora (expressa). 1 gene mamífero ≈ 7 exons Genes de procariontes e eucariontes Quadro 1. Comparação entre a organização celular dos procariontes e dos eucariontes. Procariontes: Genes são arranjados com pouco espaço entre eles. Plasmídeo – DNA circular, presente na maioria dos procariontes Eucariontes: entre genes há muito espaço, DNA repetidos. Plasmídeo Natureza e tipos de genomas Genômica: estrutura e função dos genomas Genomas variam de tamanho Virais, bacterianos, plastidial e mitocondrial, eucariótico Viral - Partícula morta (proteína e ácido nucléico) - DNA ou RNA - Linear ou circular Procariótico - DNA e circular - Introns são raros Eucariótico nuclear - 1 ou 2 grupos de cromossomos lineares no núcleo Cromossomos Filamentos espiralados de cromatina, existente no suco nuclear de todas as células, composto por DNA e proteínas. cromossomos São dispostos individualmente nas células germinativas ou em pares nas células somáticas Cromatinas: 1. Eucromatina: desespiralada, DNA se ativo. 2. Heterocromatina:condensada, DNA inativo. (constitutiva e facultativa) Centrômero: parte mais condensada de cromatina, divide o cromossomo Telômero: extremidade Tipos: telocêntrico, acrocêntrico, metacêntrico. Cariótipo: conjunto ordenado de cromossomos A espécie humana: -22 autossômicos (1 a 22) -2 sexuais (X e Y) Mulheres : XX Homens: XY Funções dos genes: transferência de informações Genes – unidade fundamental da hereditariedade Funções reguladoras e codificantes Informação cromossomos DNA Genes codificam informação proteínas RNA: estrutura, classes, enzimas relacionadas, processamento • Fita única de ribonucleotídeos • Presença de Uracila • RNA polimerase- enzima catalizadora • Tipos: Mensageiro (RNAm) Transportador (RNAt) Ribossômico (RNAr) Transcrição: fases Síntese de RNA a partir de DNA Controle da expressão gênica Processo seletivo RNA polimerase – desempenham atividades necessárias para transcrição RNAP I, RNAP II, RNAP III, RNAP mitocondrial (mtRNAP), e RNAP de cloroplastos RNAP I - sintetiza os rRNAs RNA P II - que sintetiza mRNA RNAP III - sintetiza tRNA, rRNA 5S, e outros RNAs. Sequências reguladoras: padrão de bases promoters e enhancers Procariontes: transcrição e tradução são simultâneas. Eucariontes: transcrição ocorre no núcleo e a tradução no citoplasma. Procariontes e Eucariontes Proteínas: estruturas e funções Polímero de aminoácidos: cada aminoácido tem grupo R com propriedades únicas Grupos funcionais: amina e carboxila Funções determinadas pela estrutura primária Estrutural , Hormonal, Defesa, Enzimática Estruturas: primária,secundária, terciária, quaternária Tradução de proteínas Ligação de aminoácido a RNAt Ribossomos: Sítio da síntese protéica Iniciação, elongação, terminação Código genético: 20 aminoácidos Mutações:definição, tipos e efeitos Modificação da informação genética na transcrição ou tradução. Casual ou induzida Pontuais (substituição de bases), deleções e inserções,ou cromossômicas (inversões e translocações) Pontuais: afeta uma única posição no gene. Missense; Nonsense; Samesense Cromossômicas: alterações no número dos cromossomos ou alterações estruturais, rearranjos do DNA. (Síndrome de Down) Mutação Frameshift: inserção ou deleção de 1 ou 2 nucleotídeos na fase aberta de leitura. - Cada aminoácido após a mutação será alterado. - Geralmente resulta em proteína não funcional. Efeitos de Mutações: Reduz ou elimina função de proteína Surgimento de novas características em uma população Mutações em introns-exons, sequências reguladoras.
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