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UC: GENÉTICA Introdução à Genética de Populações Bibliografia: Cap. 17- Griffiths & col Cap. 23 - Pierce Genética de Populações: ramo da genética que estuda a constituição genética de grupos de indivíduos (populações) e como a sua composição genética muda no tempo e no espaço Introdução O que é uma população mendeliana? • Grupo de indivíduos que se reproduzem sexualmente; • Possuem um conjunto de genes em comum (pool gênico); • Os genes se segregam nos gametas, reunindo-se nos novos indivíduos na geração seguinte. Genes passam de indivíduos para indivíduos através da REPRODUÇÃO ao longo das gerações 1a. Geração – genótipos (pool gênico) Fase 2n Fase n 2a. Geração - gametas 3a. Geração – genótipos (pool gênico) Fase 2n Logo..... População EVOLUI através de mudanças no seu pool gênico Portanto... Genética de populações é o estudo da evolução! Investiga a variação genética (alelos) dentro e entre grupos (populações) e as FORÇAS EVOLUTIVAS que moldam essa variação O que é a composição genética de uma população? Coleção de freqüências de genótipos (freqüência genotípica) diferentes e de alelos (freqüência alélica ou gênica) que compõem esses genótipos Variação Genética Todos os organismos apresentam variação genética!! Porquê a variação genética é importante? variação não variação Porquê a variação genética é importante? variação não variação EXTINÇÃO!! Mudanças Ambientais Sobrevivência Diversificação – formação novas espécies Extensão da Variação Genética Dentro e entre populações: níveis morfológico, cromossomos, seqüência de aminoácidos, DNA, proteínas Polimorfimo cor da concha em Liguus fascitus Morfológico Polimorfismo de proteínas em Drosophila pseudoobscura Polimorfismo cromossômico no lagarto � Gymnodactylus amarali do Cerrado Pellegrino e col (2009) 2n=40 2n=39 Heterozigoto para translocação Robertsoniana 2n=38 Variação em sequências de DNA Fatores que alteram a composição genética nas populações Mais divergência entre populações Mutação Introdução de variação genética: novos alelos Migração Pops. fenotipicamente uniformes Reprodução preferencial Recombinação Deriva genética Introdução das mutações em ambas populações por migração. Seleção Natural Novas combinações de genes Alteração aleatória freqüência de genótipos e fenótipos Padrões reprodutivos (ex: endogamia) Acasalamento entre parentes Efeito dos padrões reprodutivos da população Acasalamentos Aleatórios x Preferenciais (ex: endogamia) Efeito da Endogamia Fatores que alteram a Composição Genética nas populações: Seleção Natural Os indivíduos de uma determinada espécie não são iguais entre si. Eles trazem em decorrência da variabilidade pequenas diferenças que os fazem únicos. CRUCIAL PARA A SELEÇÃO NATURAL A Seleção Natural atua sobre a variabilidade genética de uma população, selecionando os indivíduos mais aptos a sobreviverem e reproduzirem frente a uma mudança ambiental, em determinado período de tempo. A Seleção Natural diminue a variabilidade genética de uma população Seleção Natural e Adaptação Mudanças evolutivas de uma população resultam de uma alteração no ambiente Ricklefs, 2003 (Pag. 170) Colchonilha Genes para resistência ao cianeto presentes na população antes da exposição ao cianeto! Reprodução e sobrevivência diferencial dos indivíduos / sua prole Seleção Natural e a vantagem dos heterozigotos para genes nocivos Anemia falciforme Sobreposição geográfica entre prevalência de malária e anemia falciforme Seleção natural favorece portadores do alelo S = resistência a malária w = AA < SS < AS w= valor adaptativo Mais divergência entre populações Mutação Introdução de variação genética: novos alelos Migração Populações fenotipicamente uniformes Reprodução Preferencial Recombinação Deriva genética Introdução das mutações em ambas populações por migração Seleção Natural Novas combinações de genes Alteração aleatória frequência de Genótipos Padrões reprodutivos (ex: endogamia) Acasalamento entre parentes Deriva Genética: evento aleatório 8 RR 8 rr 0.50 R 0.50 r Antes: Deriva Genética: evento aleatório 8 RR 8 rr 2 RR 6 rr 0.50 R 0.50 r 0.25 R 0.75 r Antes: Depois: Deriva Genética *Muito mais intensa em populações pequenas *Promove PERDA ou FIXAÇÃO de alelos Efeito Fundador: tipo de Deriva Genética População Original Po pu laç õe s D esc en de nt es Diferença na frequência de indivíduos azuis e vermelhos nas populações descendentes devido ao acaso!!! Efeito Fundador em Populações Humanas Raras na maioria das populações Fatores que alteram a Composição Genética nas populações: Migração Fluxo de genes entre populações Variação Genética: como quantificar? Exemplo: grupos sanguíneos humanos Determinar % observada de genótipos na população Freqüências genotípicas Freqüências alélicas Podemos então obter.... Observar: Variação dos genótipos dentro das populações Variação dos genótipos entre as populações Grupo sanguíneo MN em várias populações humanas Cálculo de Freqüências Genotípicas e Alélicas População de indivíduos 2n: alelos A e a em um locus Logo... teremos 3 genótipos = AA Aa aa Freqüências genotípicas? f(AA): no. de indivíduos AA f(Aa): no. de indivíduos Aa N N f(aa): no. de indivíduos aa N N= número total de indivíduos na população f(AA) + f(Aa) + f(aa) = 1 Grupo sanguíneo MN em várias populações humanas f MM + f MN + f NN = 1 Esquimós= maioria MM MM= raro nos aborígines australianos Cálculo de Freqüências Genotípicas e Alélicas Freqüência Alélica: proporção da forma alélica do gene entre todas as cópias do gene em uma população 2n Ex: grupo sanguíneo MN: população de Esquimós f MM= 0,835 f MN= 0,156 fN/N=0,009 f alelos M e N representados por p e q, respectivamente Cálculo de Freqüências Genotípicas e Alélicas f MM= 0,835 f MN= 0,156 fN/N=0,009 Qual é a frequência dos genes M e N?? Cálculo de Freqüências Genotípicas e Alélicas f MM= 0,835 f MN= 0,156 fN/N=0,009 p e q= freqüência de homozigotos + 1/2 freqüência dos heterozigotos Logo.... p + q = 1 e q = 1 - p f (M) = p= 0,835 +1/2 x 0,156 p= 0,913 f (N) = q = 0,009 + 1/2 x 0,156 q= 0,087 Cálculo de Freqüências Genotípicas e Alélicas Alternativamente p e q podem ser calculados: p = f(M) = 2 x nMM + nMN q = f(N) = 2 x nNN + nMN *2N *2N nMM, MN, NN = no. de indivíduos com genótipos MM, MN, NN em uma população de N indivíduos *População diplóide: cada indivíduo tem 2 cópias do gene. Logo... Toda a população é 2N!! Exercícios Em Drosophila, corpo de cor preta é um caráter dominante enquanto corpo marrom é recessivo, sendo condicionada por um único gene. Em uma amostra de 210 drosófilas, 90 apresentam o genótipo duplo dominante,50 são heterozigotas e 70 moscas possuem o genótipo duplo recessivo para cor do corpo. Calcule as frequências genotípicas e alélicas para o gene da coloração de corpo nessa população Segregação meiótica e equilíbrio genético Numa população em que ♂e ♀ se cruzam aleatoriamente com relação ao mesmo locus A Mistura e união aleatória de espermatozóides e ovócitos Como calcular o pareamento aleatório desses gametas? Segregação meiótica e equilíbrio genético Se freqüência do alelo A é p tanto nos espermatozóides quanto nos ovócitos e a freqüência do alelo a é q = 1-p logo teremos.... Equilíbrio de Hardy-Weinberg q A/a Ovócitos ♀ A a Es pe rm ato zó ide s ♂ A a p p q AA p2 A/a pq pq a/a q2 Equilíbrio de Hardy-Weinberg Freqüência dos gametas são iguais as freqüências p e q na geração que os produziu As freqüências genotípicas da geração seguinte são: A/A A/a a/a p2 2pq q2 Essa distribuição é chamada de Equilíbrio de Hardy-Weinberg (1908) Equilíbrio de Hardy-Weinberg Modelo matemático assume que “em uma população em equilíbrio, as freqüências alélicas e genotípícas permanecerão constantes ao longo das gerações”. Quantidade de variação genética permanece constante geração após geração na ausência de *forças “perturbadoras” * mutação, seleção, migração, deriva genética Equilíbrio de Hardy-Weinberg Como p e q permanecem constantes na próxima geração? Freqüência de p em F1 será: p = f(AA) +1/2 f(Aa) p2 + ½ x 2pq = p2 + pq = p (p + q) = p q = f(aa) + ½ f (Aa) q2 + ½ x 2pq = q2 + pq = q (p+q) = q Portanto na segunda geração: freqüências dos 3 genótipos será novamente: p2 : 2pq : q2 A/A A/a a/a p2 2pq q2 O que é preciso para atingir o Equilíbrio de � Hardy-Weinberg? 1) Genitores se cruzam ao acaso: ausência de acasalamentos preferenciais como endogamia; 2) Tamanho populacional grande; 5) Ausência de mutação, seleção, migração ou deriva genética p2+ 2pq + q2 = 1 O que é preciso para atingir o Equilíbrio de Hardy- Weinberg? Trata-se de um modelo teórico que simplifica uma situação criando uma população teórica que permite que se estabeleça uma hipótese nula para estudarmos o comportamento dos genes em populações naturais mais complexas p2+ 2pq + q2 = 1 aa Aa A/A 0 1,0 0,5 1,0 0 p(A) q(a) 1,0 0,1 Freq. heterozigoto é máxima (50%) quando p = q = 0,5 Freqüência alélica Fr eq üê nc ia ge no típ ica 0.5 Quando a freq. de um alelo é alta, a maioria dos indivíduos é homozigota Freqüência de homozigotos e heterozigotos dependem das freqüências alélicas Alelos raros: maioria das cópias nos heterozigotos TESTE PARA VERIFICAR SE A POPULAÇÃO ESTÁ OU NÃO EM EQUILÍBRIO DE HARDY-WEINBERG Onde N = D+H+R Onde f(A) = p = 2D+H e f(a) = q = 2R+H 2N 2N Estimativa das freqüências gênicas não requer que a população esteja em equilíbrio de H.W. Com os valores p e q, estima-se as freqüências das três classes genotípicas, assumindo o equilíbrio de H.W. AA Aa aa nAA=D nAa=H naa=R TESTE PARA VERIFICAR SE A POPULAÇÃO ESTÁ OU NÃO EM EQUILÍBRIO DE HARDY-WEINBERG AA Aa aa Freqüências observadas D H R Freqüências esperadas p2xN 2pqxN q2xN AA Aa aa nAA=D nAa=H naa=R Quando os valores esperados (assumindo equilíbrio) e os observados não são exatamente iguais precisamos usar o teste do X2 (teste estatístico) para determinar, de forma mais objetiva, se a população está ou não em equilíbrio de H.W.� Assim:� X2 = Σ (observadoi- esperadoi)2� esperadoi� ou seja: X2 = (D - p2.N)2 + (H - 2pq.N)2 + (R - q2.N) 2� p2.N 2pq.N q2.N� Neste caso, temos 2 fenótipos (gl=1) e assumindo 5% de nível de significância: � X2 ≥3,841 → rejeita hipótese de equilíbrio� X2 < 3,841 → aceita hipótese de equilíbrio � df= n-1 n= no. de fenótipos diferentes esperados Maioria dos estudos assume 5% de significância (P=0,05) Como interpretar desvios das freqüências genotípicas das esperadas no Equilíbrio de HW? Desvios do equilíbrio são altamente informativos! Permitem detectar: Ocorrência de mutação e recombinação Endogamia (desvios da união ao acaso de gametas) Migração Seleção Natural Fragmentação de populações (populações pequenas sofrem mais a ação da deriva genética que altera a freqüência de alelos independente da seleção natural) Como aplicar o equilíbrio de H.W. a genes com alelos múltiplos? Basta expandir a expressão multinomial Para um gene com três alelos... (p + q + r)2 = p2 + q2 + r2 + 2pq + 2qr + 2pr p2+ 2pq + q2 = 1 Ex: três alelos do sistema sanguíneo ABO Tipo sanguíneo Genótipo Freqüência A IAIA p2 IAIO 2pr B IBIB q2 IBIO 2qr AB IAIB 2pq O IOIO r2 Exemplo 1) Estudo no Japão em 1958 sobre freqüência dos genótipos para grupo sanguíneo MN População N= 1482 MM=406 MN=744 NN=332 População está em equilíbrio de HW? df= n-1 n= no. de fenótipos diferentes esperados Maioria dos estudos assume 5% de significância (P=0,05) Exemplo Estudo no Japão em 1958 sobre freqüência dos genótipos para grupo sanguíneo MN População N= 1482 MM=406 MN=744 NN=332 D H R População está em equilíbrio de HW? p = 2D+H = 2.406+744 = 0,52 2N 2.1482 p + q = 1 logo… q=0,48 Se a população estiver em equilíbrio as freqüências genotípicas esperadas na geração seguinte serão... MM MN NN Freqüências observadas 406 (D) 744 (H) 332(R) Freqüências esperadas p2.N 2pq.N q2.N 0,27x1.482 2x0,52x0,48x1.482 0,23 x1.482 400,1 739,8 341,4 Exemplo X2 = (D - p2.N)2 + (H - 2pq.N)2 + (R - q2.N)2� p2.N 2pq.N q2.N� X2 = 0,0870+ 0,0238 + 0,2588 = 0,3696 Assumindo 5% de nível de significância e gl=2 (neste caso temos 3 fenótipos) � X2 ≥ 5,991 → rejeita equilíbrio� X2 < 5,991 → aceita equilíbrio� População do estudo está em equilíbrio de HW. Exercícios 2) Considere um locus com dois alelos (dominante e recessivo). Qual será a freqüência de heterozigotos em uma população em equilíbrio de H.W. na qual 84% dos indivíduos apresentam o fenótipo dominante? Exercícios 84% dominante: AA e Aa 16% recessivo: aa Considerando um gene A com dois alelos A e a aa= q2 = q= raiz de 0,16 (16%) = 0,4 Se p + q= 1 então.... p = 0,6 Freqüências genotípicas: AA Aa aa p2 2pq q2 0,36 0,48 0,16 36% 48% 16%
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