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FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AV1 HELINE COSTA SOARES CONTEÚDO DESTA AULA Estrutura e função das biomoléculas Bioquímica dos aminoácidos Bioquímica das proteínas Enzimas e cinética enzimática Desnaturação de proteínas Introdução ao metabolismo FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA • Carboidratos, proteínas, lipídeos, vitaminas, ácidos nucleicos COMPOSTOS ORGÂNICOS • Água e sais minerais. COMPOSTOS INORGÂNICOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA O que distingue os organismos vivos dos seres inanimados? 1) Estrutura complexa e alto índice de organização; 2) Adaptação ao meio e evolução; 3) Capacidade de auto replicação e auto montagem; 4) Extração, transformação e utilização da energia que encontram no meio ambiente, sob forma de nutrientes químicos ou luz solar. A Bioquímica e a Condição Vital FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ÁTOMOS E MOLÉCULAS CAFEÍNA ÁCIDO CLORÍDRICO CLORETO DE SÓDIO FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA MACROMOLÉCULAS ÁTOMO MOLÉCULAS ORGANELAS CÉLULAS TECIDOS ÓRGÃOS SISTEMAS CORPO FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA CÉLULAS • EM MÉDIA: 70% DE ÁGUA 27% DE MACROMOLÉCULAS 3 % DE SAIS INORGÂNICOS E PEQUENAS BIOMOLÉCULAS 1. Carbono: 50 a 60 % 2. Oxigênio: 25 a 30 % 3. Nitrogênio: 08 a 10 % 4. Hidrogênio: 03 a 04 % FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA MOLÉCULAS HIDROFÍLICAS POLARES HIDROFÓBICAS APOLARES ANFIPÁTICAS X X FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA MONÔMEROS X MACROMOLÉCULAS PROTEÍNAS AMINOÁCIDOS CARBOIDRATOS MONOSSACARÍDEOS LIPÍDIOS ÁCIDOS GRAXOS NUCLEOTÍDEOS ÁCIDOS NUCLÉICOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA REVISANDO AS PROTEÍNAS • Biomoléculas orgânicas mais abundantes nos seres vivos depois da água. • Formadas por : C, O, N e H. • Polímeros constituídos por aminoácidos Estrutura básica Aminoácido * Carbono α * FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AMINOÁCIDOS Existem 20 aminoácidos comumente encontrados nas proteínas. O átomo de carbono α é um centro quiral ou centro assimétrico. Nas proteínas são encontrados estereoisômeros L. * exceção da glicina * * FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AMINOÁCIDOS Em pH fisiológico (aproximadamente 7,4), o grupo carboxila encontra-se dissociado, formando o íon carboxilato, carregado negativamente (–COO–), e o grupo amino encontra-se protonado (–NH+). Os 20 AA se dividem em apolares, polares desprovidos de carga e polares com carga Classificação dos 20 aminoácidos comumente encontrados nas proteínas de acordo com a carga e a polaridade: FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AMINOÁCIDOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AMINOÁCIDOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AMINOÁCIDOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA • Classificação dos aminoácidos de acordo com a sua essencialidade AMINOÁCIDOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Alguns aminoácidos apresentam funções específicas e de fundamental importância para diferentes funções bioquímicas. • Glicina - neurotransmissor no sistema nervoso; • Triptofano e tirosina - precursores de serotonina e dopamina, respectivamente e também podem atuar como neurotransmissores; • Tirosina - precursor dos hormônios adrenalina e noradrenalina, bem como dos hormônios produzidos pela glândula tireoide, T3 e T4; • Histamina - derivado de aminoácido que participa como mediador de reações alérgicas. AMINOÁCIDOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA LIGAÇÃO PEPTÍDICA • função mais relevante dos aminoácidos é atuar como unidade básica para a formação das proteínas, que são cadeias polipeptídicas FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ESTRUTURA DE PROTEÍNAS • A união de até 10 aa : oligopeptídeo. • Se superior a 10 aa: polipeptídeo. • Se o n for superior a 50 aa: proteína. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Uma cadeia polipeptídica é constituída de uma parte repetida regularmente, cadeia principal ou espinha dorsal, e de uma parte variável, compreendendo as distintas cadeias laterais ou grupos R. ESTRUTURA DE PROTEÍNAS Ser Gly Tyr Ala Leu C - terminalN - terminal FUNÇÕES DAS PROTEÍNAS Estrutural Transporte Defesa Enzimática Hormonal https://pdb101.rcsb.org/motm/14 Contração muscular https://www.youtube.com/watch?v=j-5959hSHCc FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA CLASSIFICAÇÃO DAS PROTEÍNAS: 1) Proteínas Simples: Formadas somente pelo encadeamento de aminoácidos. Ex: globulinas, albuminas. 2) Proteínas Complexas: Formadas por aminoácidos mais um radical não- proteico (prostético). Ex: cromoproteínas (hemoglobina); glicoproteínas; fosfoproteínas; nucleoproteínas; lipoproteínas. ESTRUTURAS DAS PROTEÍNAS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ESTRUTURA ESPACIAL O enovelamento de proteínas (arranjo espacial) que resulta nas estruturas secundária, terciária e quaternária é obtido através de ligações fracas (forças não-covalentes): • ligações de hidrogênio; • forças de interação hidrofóbica; • interação iônica. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ESTRUTURA ESPACIAL FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Cada proteína tem uma função química e uma estrutura específica. Cada proteína tem um pequeno número de formas estruturalmente estáveis. A estabilidade das proteínas é determinada principalmente por interações não-covalentes. As proteínas possuem alguns padrões estruturais comuns. Ex. Insulina em várias espécies. FUNÇÕES x ESTRUTURA PROTEICA FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ESTRUTURA DAS PROTEÍNAS Quando uma proteína é sintetizada na célula, sua estrutura primária dobra-se espontaneamente, originando as estruturas secundária, terciária e quaternária. A proteína assume então, sua conformação NATIVA. DESNATURAÇÃO - Alteração ou destruição da estrutura espacial das proteínas, mantendo somente a estrutura primária. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA DESNATURAÇÃO DAS PROTEÍNAS FATORES: • Temperatura. • pH. • Ação de solventes orgânicos. • Agentes oxidantes e redutores. • Agitação intensa. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA CONSEQUÊNCIAS DA DESNATURAÇÃO • Diminuição de solubilidade. • Perda da atividade biológica. • Alterações na viscosidade e coeficiente de sedimentação. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA BIOMOLÉCULAS - REVISANDO AS ENZIMAS ENZIMAS • São proteínas que apresentam atividade catalítica. Algumas são feitas de RNA • São altamente específicas. • Não são gastas nas reações químicas. • Apresentam meia vida enzimática. • Podem ter suas atividades reguladas pelas células. Harvey e Ferrier, 2012 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ENZIMAS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ENZIMAS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA PROPRIEDADES DAS ENZIMAS A região a qual o substrato se liga à enzima é chamada centro ativo (ou sítio ativo) da enzima. O centro ativo é formado por resíduos de aminoácidos que estão próximos devido à sua estrutura terciária. O centro ativo constitui uma cavidade com forma definida, que permite à enzima “reconhecer ” o substrato. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA FUNCIONAMENTO ENZIMÁTICO FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Cofator Inorgânico: Íons metálicos Orgânico: Coenzima cofator Apoenzima (inativa) + cofator holoenzima (ativa) - A atividade de uma enzima depende de sua integridade e conformação nativas. - A atividade de algumas enzimas depende de cofatores ENZIMAS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ENZIMAS Classificação das enzimas segundo suas atividades catalíticas: FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA CINÉTICA ENZIMÁTICA Fatores que interferem na velocidade das reações enzimáticas • Fatores externos • Temperatura • pH • Fatores internos • [ ] de substrato • [ ] de enzima • Presença de inibidores FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA CINÉTICA ENZIMÁTICA Substrato x atividade enzimática FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA INIBIDOR ENZIMÁTICO • Inibição reversível • Inibição irreversível. -Inibidor é uma substância que diminui a velocidade de uma reação - Papel regulador importante FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA INIBIDOR ENZIMÁTICO - Inibição competitiva: Inibidor compete com o substrato pelo sítio ativo enzimático. - Inibição não-competitiva: Inibidor se liga a um ponto diferente do sítio ativo, inibindo o complexo ES. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABOLISMO • É o conjunto de processos físicos e de reações que ocorrem em um sistema vivo e resulta na montagem ou quebra de moléculas complexas. É constituído por reações anabólicas e catabólicas. Anabolismo • Reações de síntese • Absorvem energia • Exemplo: Glicogênese Catabolismo • Reações de degradação • Liberam energia • Exemplo: Glicólise Glicogenólise FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA FUNÇÕES DO METABOLISMO • Obter energia química capturando energia solar ou degradando nutrientes; • Converter moléculas dos nutrientes e da célula em precursores de macromoléculas. • Polimerizar precursores em macromoléculas. • Sintetizar e degradar biomoléculas de acordo com a necessidade celular. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Proteínas Polissacarídeos Lipídeos Ác. Nucleicos Aminoácidos Açúcares Ácidos Graxos Bases Nitrogenadas Carboidratos Gorduras Proteínas CO2 H2O NH3 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA REGULAÇÃO DO METABOLISMO • Síntese e degradação de uma molécula não podem ocorrer simultaneamente na mesma célula ou tecido. • Para que as rotas sejam controladas devem utilizar enzimas distintas e compartimentos celulares diferentes. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AV1 Slide Number 2 Slide Number 3 Slide Number 4 Slide Number 5 Slide Number 6 Slide Number 7 Slide Number 8 Slide Number 9 Slide Number 10 Slide Number 11 Slide Number 12 Slide Number 13 Slide Number 14 Slide Number 15 Slide Number 16 Slide Number 17 Slide Number 18 Slide Number 19 Slide Number 20 Slide Number 21 Slide Number 22 Slide Number 23 Slide Number 24 Slide Number 25 Slide Number 26 Slide Number 27 Slide Number 28 Slide Number 29 Slide Number 30 Slide Number 31 Slide Number 32 Slide Number 33 Slide Number 34 Slide Number 35 Slide Number 36 Slide Number 37 Slide Number 38 Slide Number 39 Slide Number 40 Slide Number 41 Slide Number 42 Slide Number 43 Slide Number 44 Slide Number 45 Slide Number 46
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