Aula1--Planejamento de fármacos baseado em ligantes

Prévia do material em texto

Planejamento de fármacos 
baseado em ligantes
MINISTÉRIO DA EDUCAÇÃO
UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAPÁ
PRÓ-REITORIA DE ENSINO E GRADUAÇÃO
DISCIPLINA: QUÍMICA FARMACÊUTICA
Professora: Drª . Lorane Hage Mel im
Professora Estag iár ia : Lenir Cabral Correia
Etapa 1 – Identificar compostos de uma biblioteca que tenham 
maior probabilidade de se ligar a um alvo biológico
Introdução
Química 
Farmacêutica
Ciências 
Biológicas
Ciências 
médicas
Ciências 
Farmacêuticas
Química
Estudo do metabolismo
Interpretação do mecanismo de 
ação a nível molecular
Construção das relações entre 
estrutura química e a atividade 
(SAR)
Descoberta, planejamento, 
identificação e preparação de 
protótipos
1
[http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/medchem/]. 
Objetivo
Montar uma base de dados de inibidores com atividades já determinadas na
literatura.
Esses compostos serão utilizados nas aulas seguintes, em uma sequência de
atividades envolvendo inibidores e enzima, servindo de modelo para a
realização dos projetos.
2
wixsite.com
Prática
1) Criar na área de trabalho pasta com o nome do alvo que você está pesquisando
oSDF
oMOL_HYPER
oMOL_V2000
oMOL2
oADMET
oSK2
oTIF
oTOXICITY
3
http://www.ff.ul.pt/qft/files/2012/01/qft06.jpg
Prática
 Acessar o site do banco de dados BindingDB: https://www.bindingdb.org/bind/index.jsp
4
Prática
 Acessar o site do banco de dados BindingDB: https://www.bindingdb.org/bind/index.jsp
6
Alzheimer: Beta secretase
Gastrite: 3 dehydroquinate
Transtorno de ansiedade: COX-2
Prática
 Acessar o site do banco de dados BindingDB: https://www.bindingdb.org/bind/index.jsp
7
Prática
 Selecionar os 15 inibidores mais ativos
8
Prática
 Selecionar os 15 inibidores mais ativos
9
Prática
 Abrir o Discovery Studio Visualizer
10
Prática
 Usando o Discovery Studio Visualizer
11
Prática
 Usando o Discovery Studio Visualizer
12
Prática
 Usando o Discovery Studio Visualizer
13
Prática
 Usando o Discovery Studio Visualizer
15
Prática
 Usando o Discovery Studio Visualizer
16
Prática
 Usando o Discovery Studio Visualizer
14
Prática
 Usando o Discovery Studio Visualizer
17
Na pasta SDF
Prática
 Usando o Discovery Studio Visualizer
18
Na pasta SDF
Prática
 Usando o Discovery Studio Visualizer
19
Na pasta MOL2
Prática
 Usando o Discovery Studio Visualizer
20
Na pasta MOL_V2000
Sugestão de leitura