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1) Considere o segmento de fita de DNA abaixo: 3' AAAGAACGATGATTTCGGATT 5' a) Qual a sequência de bases do RNAm correspondente? 5’ UUU CUU GCU ACU AAA GCC UAA 3’ b) Quantos tRNAs serão utilizados na síntese? 7 c) Quais os anti-códons dos tRNAs acima considerados? 3’ AAA GAA CGA UGA UUU CGG AUU 5’ d) Quantos aminoácidos poderão ser codificados? 3 e) Qual a sequência de aminoácidos codificados? LIS – GLU – ARG – FIM – FEN – ARG - ILE 2) É verdadeira a afirmação? "Existe 1 (um) códon e anti-códon específico para cada tRNA". Sim. Para cada um dos códons presentes em uma molécula de mRNA encontra-se uma molécula de tRNA com um único anti-códon complementar. Cada anti-códon é específico para um dado aminoácido, embora cada aminoácido possa ter de 1 a 4 ant-códons apropriados para ele. 3) Porque apenas 61 trincas (sequências de nucleotídeos) codificam aminoácidos? Porque 3 trincas UUA, UAG, UGA codificam o fim da síntese sem sentido e não codificam nenhum aminoácido. 4) De acordo com as informações dadas e usando a tabela do código genético, preencha os dados que faltam no esquema abaixo: Códon Anticódon Aminoácido AGG ACC ARG GUG CAC VAL UUA AAU LEU GUG CAC VAL CAC GUG HIS UGG ACC TRP CCG GGC PRO GUC CAG VAL UCC AGG SER UAG AUC STOP CÓDON 5) Em uma longa molécula de DNA isolou-se o seguinte segmento: 5’ ATCTTTAGGCTACAGGT 3’ 3’ TAGAAATCCGATGTCCA 5’ a) Se a fita sense for 5’3’, qual a sequência de hRNA? 5’ UGGACAUCGGAUUUCUA 3’ b) Dê o nucleotídeo da extremidade 5’ deste RNA. Uracil 6) Explique, detalhadamente, as etapas do processo de tradução de um RNAm. Ocorre no interrior do núcleo das células e consiste na síntese de uma molécula de RNAm a partir da leitura da informação contida no cístron de uma molécula de DNA. Esse processo inicia-se pela ligação de um complexo enzimático à molécula de DNA, o RNA- polimerase. A enzima helicase desfaz a dupla hélice, destruindo as ligações de hidrogênio que ligam as bases complementares das duas cadeias, afastando-as. O RNA- polimerase, inicia a síntese de uma molécula de RNAm de acordo com a complementaridade, inicia a síntese de uma molécula de RNAm de acordo com a complementaridade das bases nitrogenadas. Nesse processo, as bases pareiam-se: a adenina do DNA se liga à uracila do RNAm, a timina do DNA com a adenina do RNAm, a citosina do DNA com a guanina do RNAm, e assim sucessivamente, havendo a interação da enzima RNA-polimerase. Quando a leitura termina, a molécula RNAm separa-se da cadeia do DNA, esta restabelece as ligações de hidrogênio e a dupla hélice é reconstituída. Nem todas as sequencias da molécula DNA codificam aminoácidos. O RNA sintetizado sofre um processamento ou maturação antes de abandonar o núcleo. Algumas porções do RNA transcrito, “íntrons”, vão ser removidas e as porções não removidas, “éxons”, ligam-se entre si, formando assim um RNAm maturo. O RNA que sofre este processo de exclusão de porções é designado doRNA pré – mensageiro. No final do processo, o RNAm é constituído apenas pelas seqüências que codificam os aminoácidos de uma proteína, podendo assim migrar par o citoplasma, onde vai ocorrer a tradução da mensagem, insto é, a síntese de proteína. 7) Defina detalhadamente: códons e anticódons. Codon: Seqüência de três nucleotídeos do ácido ribonucleico mensageiro que, na síntese de proteinas, representa a codificação da informação genética para um determinado aminoácido ou para a terminação da cadeia polipeptídica. Anticodon: Seqüência de três nucleotídeos da molécula de ácido ribonucleico de transferência que se liga ao códon de uma molécula de ácido ribonucleico mensageiro durante a síntese de proteinas. 8) Considerando-se a sequência de códons 5’ AUG CGA 3’ responda justificando: a) De que molécula do ácido nucleico faz parte? RNAm b) Qual o anti-códon correspondente? 5’ UAC GCU3’ c) De que molécula a resposta faz parte? RNAt 9) Qual é o significado do código genético, associe esta questão com o processo de tradução. Código genético é a relação entre a sequência de bases no DNA e a sequência correspondente de aminoácidos, na proteína. Esse código fornece uma correspondência entre as sequências de bases nucleotídicas e uma sequência de aminoácidos. O código genético apresenta três características fundamentais que o definem: especificidade, universalidade e redundância, visto que um determinado aminoácido pode ser especificado por mais de um códon, mas cada códon só pode designar um aminoácido. Para que o processo de tradução ocorra é necessário um grande número de componentes, os quais incluem todos os aminoácidos encontrados no produto proteico final, o RNAm a ser traduzido, RNAt, ribossomos funcionais, fontes de energias e fatores proteicos necessários à iniciação, alongamento, e terminação. É importante ressaltar que o RNAm não se liga diretamente aos aminoácidos, mas sim, o RNAt, o qual fornece a ligação molecular entre a sequência de bases do RNAm e a sequência de aminoácidos da proteína. 10) Na soja, um determinado alelo apresenta a seguinte sequência de bases: Exon-1 Intron-1 Exon-2 Intron-2 Exon-3 5’ ATG CAC CGA AAT GAT AGA ATT ACG CCC CCA CCA CCA CCA CAA TAG 3’ 3’ TAC GTG GCT TTA CTA TCT TAA TGC GGG GGT GGT GGT GGT GTT ATC 5’ A fita sense (que deverá ser transcrita) dessa molécula tem a timina como primeira base na posição 3’. A partir desse modelo pergunta-se: a) Qual a sequência de bases do RNA mensageiro? b) Qual o número de aminoácidos que farão parte da proteína? c) Qual a sequência de aminoácidos da proteína? 11) Sobre o Shine Dalgarno responda: a) Representa que sequência? é uma sequência do RNA mensageiro de bactérias e arqueas. b) Função na tradução: Essa sequência de RNA ajuda a recrutar o ribossomo ao RNA mensageiro (mRNA) para iniciar a síntese de proteínas, alinhando o ribossomo com o códon de início. c)Onde está localizado? localizado a cerca de 8 bases a montante do códon de início AUG 12) Se uma cadeia peptídica for formada como a seguir: Met Pro Val Leu His Gly Ser Trp a) Quais serão os códons correspondentes? b) E os anticódons? 13) Explique detalhadamente o processo de Transcrição A Transcrição é o primeiro passo da expressão gênica. Durante esse processo, a sequência de DNA de um gene é copiada em RNA. Antes que a transcrição possa ocorrer, a dupla hélice de DNA deve se desenrolar próximo ao gene que está sendo transcrito. 14) O que acontece no processamento da molécula do RNA m que só acontece em eucariontes? Em eucariotas, a molécula de RNA resultante da transcrição é designada por pré-mRNA ou transcrito primário. Apresenta regiões codificantes (exões) e regiões não codificantes (intrões) que são identificadas e removidas. Ao conjunto de alterações que ocorrem no pré-mRNA designa-se por processamento de RNA. Tabela do códigogenéticopara o RNA mensageiro Primeira Base Segunda Base Terceira Base G A C U G GGG=Glicina GAG=Ac. Glutâmico GCG=Alanina GUG=Valina G GGA=Glicina GAA=Ác. Glutâmico GCA=Alanina GUA=Valina A GGC=Glicina GAC=Ác. Aspártico GCC=Alanina GUC=Valina C GGU=Glicina GAU=Ác. Aspártico GCU=Alanina GUU=Valina U A AGG=Arginina AAG=Lisina ACG=Treonina AUG=F. metionina G AGA=Arginina AAA=Lisina ACA=Treonina AUA=Isoleucina A AGC=Serina AAC=Asparagina ACC=Treonina AUC=Isoleucina C AGU=Serina AAU=Asparagina ACU=Treonina AUU=Isoleucina U C CGG=Arginina CAG=Glutamina CCG=Prolina CUG=Leucina G CGA=Arginina CAA=Glutamina CCA=Prolina CUA=Leucina A CGC=Arginina CAC=Histidina CCC=Prolina CUC=Leucina C CGU=Arginina CAU=Histidina CCU Prolina CUU=Leucina U U UGG=Triptofano UAG=Stopo Códon UCG=Serina UUG=Leucina G UGA=Stopo Códon UAA=Stopo Códon UCA=Serina UUA=Leucina A UGC=Cisteína UAC=Tirosina UCC=Serina UUC=Fenilalanina C UGU=Cisteína UAU=Tirosina UCU=Serina UUU=Fenilalanina U
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