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Bioquímica Unidade 1 – Introdução à Bioquímica: organização básica, atômico e molecular e a importância da água nos sistemas biológicos e sistemas tampão Introdução As células são as unidades estruturais e funcionais de todos os organismos vivos. Células de todos os tipos compartilham algumas características estruturais comuns: Bioelementos essenciais nos organismos vivos: principais átomos Rosa: elementos estruturais das células e dos tecidos (dieta de vários gramas /dia) Amarelo: elementos traço (alguns miligramas /dia) Principais átomos • 1- Elementos principais da matéria orgânica • Carbono – C • Hidrogênio – H • Oxigênio – O • Nitrogênio –N • Fósforo – P • Enxofre – S Principais átomos • 2 – Elementos presentes como íons • Sódio – Na+ • Potássio – K+ • Magnésio – Mg2+ • Cálcio – Ca2+ • Cloreto – Cl- Principais átomos • 3 - Microelementos • Ferro • Cobre • Zinco • Manganês • Cobalto • Iodo • Molibdênio • Vanádio • Níquel • Cromo • Flúor • Selênio • Silício • Estanho • Boro A maioria das biomoléculas são compostos de carbono Estrutura Geométrica do Carbono Grupos funcionais nas Biomoléculas • Biomoléculas são compostos de carbono com uma grande variedade de grupos funcionais. • Grupos funcionais das biomoléculas orgânicas determinam as suas propriedades químicas. Principais grupos funcionais Principais grupos funcionais Biomoléculas com múltiplos grupos funcionais Carbono quiral Encaixe complementar na macromolécula é uma molécula pequena. Enantiômeros Principais classes de biomoléculas • Praticamente toda a matéria sólida de todas as células é orgânica. • Estão presentes em 4 formas: – Proteínas (depois da água é o constituinte mais abundante) – Ácidos nucléicos – Polissacarídeos – lipídeos Unidades fundamentais das biomoléculas As proteínas são constituídas por um total de 20 aminoácidos Estão representados apenas 6 desses 20 aminoácidos. Em rosa: cadeias laterais que diferencia os aminoácidos. Componentes dos ácidos nucléicos: 5 bases nitrogenadas 2 açúcares de cinco C (pentoses) 1 grupo fosfato Nucleotídeos: Unidades manoméricas dos ácidos Nucléicos DNA e RNA Componentes dos lipídeos: Ácidos graxos Grupo fosfato Glicerol Colina Componentes dos polissacarídeos: Glicose Unidades fundamentais como precursoras de outras moléculas Glicose Ácido palmítico Aminoácidos Adenina Celulose Manose Amido Sacarose Frutose Lactose Proteínas Hormônios peptídeos Neurotransmissores Alcalóides Ácidos nucléicos ATP Coenzimas Ácido úrico Fosfolipídios Gorduras Ceras Hierarquia estrutural das células Hierarquia estrutural das células Células Organelas Montagens supramoleculares Macromoléculas Unidades fundamentais Núcleo Mitocôndria Aparelho de Golgi Retículo endoplasmático Membranas Ribossomos Cromatina Microtúbulos Proteínas DNA, RNA Lipídeos Polissacarídeos Aminoácidos Glicose Bases nitrogenadas Ácidos graxos , glicerol... Ligações químicas • Ligações covalentes • Ligações não covalentes: – Interações eletrostática (entre íons de cargas opostas) – Ligações de hidrogênio (Ponte de Hidrogênio) – Interações de van der Waals – Interações hidrofóbicas Ligações covalentes fortes • São ligações fortes entre os átomos: Interações não covalentes fracas Ligações de hidrogênio comuns Ligações de hidrogênio Ligações de Hidrogênio em biomoléculas Estrutura da água Ligações de Hidrogênio na água (gelo) Características da água nos sistemas biológicos • A água forma ligações de hidrogênio com solutos polares. • A água interage eletrostaticamente com solutos carregados. • É um solvente polar. • Dissolve a maioria das biomoléculas pois estas são polares ou carregadas eletricamente. • Moléculas hidrofílicas: tem afinidade com água (polares ou carregadas) • Moléculas hidrofóbicas: não tem afinidade com a água (moléculas apolares como lipídeos e ceras) • Moléculas anfipáticas: apresentam um grupo polar (hidrofílico) e outro apolar (hidrofóbico). Biomoléculas polares, apolares e anfipáticas A água forma ligações de hidrogênio com solutos polares A água interage eletrostaticamente com solutos carregados Compostos anfipáticos em água Aglomerado de moléculas lipídicas Micelas Ionização da água A água pura é levemente ionizada: A ionização da água é expressa pela constante de equilíbrio: Kw = Produto iônico da água. Em meio neutro Escala de pH pH de alguns fluidos aquosos Ácidos e Bases – Fortes e Fracos Ácidos e Bases – Fortes e Fracos Ácidos e bases fracas têm constantes de dissociação características Constante de Equilíbrio Ácidos e bases fracas têm constantes de dissociação ácidas características pKa Sistemas tampão • Tampões são sistemas aquosos que tendem a resistir a mudanças de pH quando pequenas quantidades de ácido (H+) ou base (OH–) são adicionadas. • Um sistema tampão consiste em um ácido fraco (o doador de prótons) e sua base conjugada (o aceptor de prótons). • Os fluidos intracelulares ou extracelulares têm pH quase constante. A primeira linha de defesa dos organismos contra mudanças internas de pH é proporcionada por sistemas tampão. Tamponamento contra mudanças no pH em sistemas biológicos Tamponamento contra mudanças no pH em sistemas biológicos Tampões biológicos importantes: •Tampão bicarbonato: HCO3-↔ H+ + CO3-2 •Tampão fosfato: H2PO4-↔ H+ + HPO4-2 Sistemas tampão • Cada par conjugado ácido-base tem uma zona de pH característica na qual é um tampão efetivo. • O par H2PO4–/ HPO42– tem um pKa de 6,86 e, portanto, pode servir como um sistema tampão efetivo entre os pH 5,9 e 7,9; • O par NH4+/NH3, com um pKa de 9,25, pode agir como um tampão em um intervalo de pH aproximado entre 8,3 e 10,3. Sistemas tampão • Sistema tampão fosfato é mais efetivo em um pH perto de seu pKa de 6,86 e, portanto, tende a resistir a mudanças de pH em um intervalo de 5,9 e 7,9. • Esse é, então, um tampão efetivo em fluidos biológicos; em mamíferos, por exemplo, fluidos extracelulares e a maioria dos compartimentos citoplasmáticos têm pH no intervalo de 6,9 a 7,4. Sistemas tampão • O plasma sanguíneo é tamponado em parte pelo sistema tampão do bicarbonato, consistindo em ácido carbônico (H2CO3) como doador de prótons e bicarbonato (HCO3–) como aceptor de prótons (K1 é a primeira de várias constantes de equilíbrio no sistema de tamponamento do bicarbonato): Sistemas tampão • Esse sistema tampão bicarbonato é mais complexo que outros pares ácido-base conjugados porque um de seus componentes, ácido carbônico (H2CO3), é formado a partir de dióxido de carbono (d) dissolvido e água, em uma reação reversível: Sistemas tampão • O dióxido de carbono é um gás sob condições normais, e CO2 dissolvido em uma solução aquosa está em equilíbrio com o CO2 em fase gasosa (g): Sistemas tampão • O pH de uma solução tampão de bicarbonato depende da concentração de H2CO3 e HCO3–, os componentes doador e receptor de prótons. • A concentração de H2CO3 por sua vez depende da concentração de CO2 na fase gasosa, ou da pressão parcial de CO2, designada por pCO2. • Portanto, o pH de um tampão de bicarbonato exposto a uma fase gasosa é determinado pela concentração de HCO3 – na fase aquosa e pela pCO2 na fase gasosa. Bioquímica Introdução Bioelementos essenciais nos organismos vivos: principais átomos Principais átomos Principais átomos Principais átomos A maioria das biomoléculas são compostos de carbono Número do slide 8 Grupos funcionais nas Biomoléculas Principais grupos funcionais Número do slide 11 Biomoléculas com múltiplos grupos funcionais� Carbono quiral� Principais classes de biomoléculas Unidades fundamentais das biomoléculas Número do slide 16 Número do slide 17 Unidades fundamentais como precursoras de outras moléculas Hierarquia estrutural das células Hierarquia estrutural das células Ligaçõesquímicas Ligações covalentes fortes Interações não covalentes fracas Ligações de hidrogênio comuns Ligações de hidrogênio Número do slide 26 Número do slide 27 Estrutura da água Ligações de Hidrogênio na água (gelo) Características da água nos sistemas biológicos Biomoléculas polares, apolares e anfipáticas A água forma ligações de hidrogênio com solutos polares� A água interage eletrostaticamente com solutos carregados Compostos anfipáticos em água Número do slide 35 Ionização da água A ionização da água é expressa pela�constante de equilíbrio: Escala de pH pH de alguns fluidos aquosos Número do slide 40 Número do slide 41 Número do slide 42 Ácidos e bases fracas têm constantes de dissociação ácidas características pKa Número do slide 45 Número do slide 46 Sistemas tampão Número do slide 48 Número do slide 49 Tamponamento contra mudanças no pH em sistemas biológicos Tamponamento contra mudanças no pH em sistemas biológicos Sistemas tampão Sistemas tampão Sistemas tampão Sistemas tampão Sistemas tampão Sistemas tampão Número do slide 58 Número do slide 59
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