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10/09/2020 1 Tecnologia de DNA recombinante Profa. Ivana Maria Póvoa Violante Análise estrutural e funcional de genomas • Atualmente, existem diversos bancos de dados e ferramentas computacionais que combinam algoritmos em uma interface amigável, permitindo o acesso e a análise das informações genômicas por meio da internet. 1 2 10/09/2020 2 Análises comparativas de estrutura e de funcionalidade de genomas que permitem: Comparar a estrutura genômica: • identificação de rearranjos no nível de DNA e de genes; análise de repetições; preservação da ordem linear de genes de diferentes espécies adquiridos de um ancestral comum (genes ortólogos) e análise de genes vizinhos ao gene em estudo. Funcionalidade de genomas: • identificação de regiões codificantes; comparação dos conteúdos gênicos e proteicos; análise de conservação de genes ortólogos e de família de genes parálogos (genes de mesma sequência obtidos por duplicação); eventos de fusão e/ou ligação funcional entre genes e identificação de vias metabólicas comuns aos genes. Comparação das regiões não codificantes: • envolve a identificação de elementos regulatórios. • A imagem apresenta a rede formada entre os genes PLAG1, IGF1 e IGF2 por meio do banco de dados String db. • Esse banco é desenvolvido com algoritmo que pesquisa, em vários bancos de dados de genes e depósitos de resultados científicos, as funções, a estrutura e a homologia dos genes. • Isso permite a formação de redes como essa, que agrupam genes em vias metabólicas em comum. • A rede formada na imagem é parte da via metabólica de crescimento em humanos e outras espécies. 3 4 10/09/2020 3 Tecnologia do DNA recombinante e conceito de bibliotecas genômicas • Genes de interesse são identificados, cortados por enzimas de restrição específicas capazes de identificá-los e inseridos a outros fragmentos de DNA cortados pela mesma enzima, chamados plasmídeos. • Os novos fragmentos obtidos já são moléculas de DNA recombinante, pois combinam, na mesma estrutura, DNAs provenientes de diferentes origens, que serão inseridos em outro organismo. • Ao final do processo, espera-se que todas as células contenham uma cópia do plasmídeo portador do gene de interesse, e que este possa se expressar produzindo a proteína desejada. Esquema da tecnologia de DNA recombinante O DNA da bactéria está representado em vermelho e o plasmídeo em azul. Pela ação das enzimas apropriadas, o DNA é cortado e o novo fragmento inserido, sendo, em seguida, multiplicado nas novas células. Técnica semelhante à descrita é utilizada para a construção de bibliotecas genômicas. Fonte: <https://goo.gl/8vZmto>. Plasmídeos: são moléculas de DNA circulares, extracromossômicas, presentes em microrganismos, sendo que muitos se replicam autonomamente. 5 6 https://goo.gl/8vZmto 10/09/2020 4 Clonagem em vetores de expressão para produção de proteínas recombinantes • Os vetores são moléculas de DNA parentais de um organismo com capacidade de replicação, o DNA recombinante é inserido nele e juntos serão capazes de autorreplicação, aumentando em quantidade e, assim, podendo ser aplicados em diversos usos, com produção de maior quantidade da proteína de interesse. Formação de uma molécula de DNA recombinante Clonagem em vetores de expressão para produção de proteínas recombinantes • Ex.: A deficiência de hormônio do crescimento faz com que a pessoa fique com uma estatura baixa. • Nesses casos, é necessário o uso hormônio do crescimento para que o crescimento dessas crianças. • O hormônio do crescimento foi um dos primeiros produtos da engenharia genética. • Ele foi produzido em E. coli a partir de um gene humano fusionado com elementos reguladores bacterianos. • Esse foi o segundo produto farmacêutico aprovado pelo FDA, em 1985. • O primeiro foi a insulina humana, em 1982.Formação de uma molécula de DNA recombinante 7 8 10/09/2020 5 Clonagem em vetores de expressão para produção de proteínas recombinantes • A maioria dos vetores de clonagem utilizados é derivada de cromossomos de plasmídeos, moléculas de DNA capazes de reproduzir independente do DNA cromossômico, ou bacteriófagos, vírus capazes de infectar bactérias e de integrarem seu material genético ao DNA delas, características que garantem a desejada amplificação dos segmentos recombinantes. Para que se tenha um bom vetor de clonagem, ele deve apresentar três estruturas essenciais: Um gene marcador dominante • geralmente confere resistência a fármacos e à célula hospedeira, que acompanhará o DNA recombinante durante a replicação. • usado para selecionar o clone de interesse e diferentes sítios de restrição. Uma origem de replicação • essencial para a sua replicação e transmissão para a descendência. Pelo menos sítio de clonagem múltipla (MCS) para endonuclease de restrição fora da origem de replicação e do gene marcador • um sítio que contenha as sequências reconhecidas pelas enzimas de restrição. Normalmente um sítio para cada enzima, para que esta possa “abrir” o plasmídeo e ser aí colocado o insert. Este sítio não é no entanto obrigatório. • permitirá a manipulação do material amplificado (DNA). 9 10 10/09/2020 6 • Estrutura do DNA do vetor Bluescript: em verde a origem de replicação; em vermelho, o gene de resistência à ampicilina; em azul o Sítio de Clonagem Múltipla (MCS), localizado na região do gene LacZ. O Bluescript é um vetor fago que contém um sítio de clonagem múltipla (MCS) e que apresenta vários sítios de clivagem por endonucleases, duas origens de replicação e um bom marcador selecionável, um gene que confere resistência à ampicilina.Fonte: adaptada de <https://goo.gl/TASfbV>. • Resultado da inserção do DNA recombinante: positivo nas colônias brancas/incolores, indicando a inatividade da β- galactosidase, e negativo nas colônias azuis, que continuam degradando o X-gal em produtos azuis. Codifica a enzima β-galactosidase hidrolisa a lactose para formar glicose e galactose. Composto quando degradado produz cor azul. Transgenia e organismos geneticamente modificados • Transgênicos Todo transgênico é um Organismo Geneticamente Modificado (OGM), porém nem todo OGM é um transgênico. • Muito frequentemente, os transgênicos são confundidos com os organismos geneticamente modificados, entenda a diferença: 11 12 https://goo.gl/TASfbV 10/09/2020 7 Aplicações biotecnológicas de organismos transgênicos • Os organismos transgênicos são desenvolvidos com o objetivo de conseguir a expressão de característica de interesse na planta ou animal, ou produção em larga escala de uma proteína. Alguns transgênicos desenvolvidos e suas características: 13 14 10/09/2020 8 OGM • A Lei de Biossegurança aprovada em 2005 estabelece normas sobre a pesquisa, produção, distribuição e comercialização de OGM. • A promulgação dessa lei ocorreu em contexto de intensa polêmica e debate, tanto no Brasil quanto no exterior, sobre possíveis danos e riscos à saúde humana e impactos ambientais que produtos transgênicos podem causar. • Em especial, os ambientalistas desejavam a proibição da comercialização de tais organismos com o código genético modificado. Embrapa Soja • Iniciou, em 1994, um programa de pesquisa visando a incorporação de técnicas de biotecnologia na áreas de melhoramento genético da soja, fixação biológica do nitrogênio, fitopatologia, entomologia, ecofisiologia, entre outras. • Existem vários tipos de soja transgênicas sendo desenvolvidas atualmente. • A mais conhecida e plantada comercialmente é uma planta que recebeu, por meio de técnicas da biotecnologia, um gene de um outro organismo capaz de torná-la tolerante ao uso de um tipo de herbicida, o glifosato. Produto comumente utilizado pelos agricultores no controle de plantas daninhas e limpeza de áreas antes do plantio de uma cultura. Suas moléculas se ligam a uma proteína vital da planta, impedindo seu funcionamento e ocasionando sua morte. 15 16 10/09/2020 9 Embrapa Soja • Esse gene foi extraído de uma bactériado solo, conhecida por Agrobacterium, e patenteado por uma empresa privada com o nome CP4-EPSPS. Estruturalmente, é muito parecido com os genes que compõem o genoma de uma planta. • Quando inserido no genoma da soja, tornou a planta resistente à aplicação do herbicida. • Essa novidade chegou ao campo pela primeira vez nos Estados Unidos, na safra de 1996. No ano seguinte, os agricultores argentinos também já aderiram à novidade. Com a nova tecnologia, fico mais fácil para os agricultores controlarem a planta daninha sem afetar a soja. • Num futuro próximo, a identificação das características expressas em plantas submetidas a condições de estresses, como o déficit hídrico e a presença de fungos e nematoides, por exemplo, será uma ferramenta importante para o programa de melhoramento genético de soja. Fitonematoides na agricultura mundial estão estimadas em aproximadamente, US$100 bilhões/ano. Perdas anuais estimadas em 12% à produção agrícola mundial. 17 18 10/09/2020 10 • Além disso, o sequenciamento do DNA de estirpes de bactérias do solo, como o bradirizobium, permitem conhecer e selecionar mais rapidamente as bactérias mais eficientes na fixação biológica do nitrogênio. Bactérias se instalam nas raízes da planta e ali permanecem durante a maior parte do ciclo da cultura, em uma relação simbiótica: a planta fornece energia para a bactéria, e como contrapartida a bactéria fornece nitrogênio para a planta. A biotecnologia em outras culturas • Os primeiros resultados proporcionados à agricultura pela Biotecnologia começaram a aparecer nos Estados Unidos, em 1995. • O primeiro produto comercial foi uma variedade de tomate que dura mais tempo nas prateleiras. • Em 1996, as culturas do milho, do algodão e da soja também começaram a se beneficiar com a Biotecnologia. 19 20 10/09/2020 11 A biotecnologia em outras culturas • No milho e no algodão, os cientistas aproveitaram um gene encontrado na bactéria de solo Bacillus thuringiensis (Bt), uma velha conhecida dos agricultores. • Essa bactéria é usada como controle biológico de pragas nas duas culturas. • O controle é feito a partir da pulverização da bactéria sobre as plantações. Ao consumir as folhas, as pragas ingerem a substância que contém a bactéria BT, tóxica ao inseto, porém inofensiva para os homens. • Por meio das técnicas de biotecnologia, o milho e o algodão receberam o gene expresso na bactéria BT e as plantas tornaram-se resistentes às pragas, broca europeia e lagarta- rosada, respectivamente, sem a necessidade de pulverização do produto. 21 22 10/09/2020 12 Vantagens dos alimentos transgênicos Por meio da técnica de alimentos transgênicos pode- se enriquecer os alimentos com componentes nutricionais essenciais que as vezes a planta não produz ou produz em baixa quantidade. Um exemplo disso seria um feijão geneticamente modificado com a inserção de gene da castanha do para com a intenção de que o feijão passe a produzir metionina, um aminoácido de extrema importância em nossa vida. Pode- se fazer um balanceamento nos nutrientes do alimento, proporcionando uma melhor dieta ao se consumir o mesmo. Pode-se também retirar algum componente do alimento. Um bom exemplo seria a retirada da lactose do leite, com o propósito de atender a população que tem alergia a esta substância. O alimento pode ter a finalidade de prevenir, reduzir e evitar riscos de certas doenças. Isso pode ser feito ao se modificar a planta geneticamente de modo que ela venha a produzir vacinas. Pode – se utilizar também antígenos, como por exemplo, em iogurtes ao se fermentá-los com organismos geneticamente modificados que estimulem o sistema imunológico. Reduzir ao máximo o uso de agrotóxicos, e se possível chegar a eliminar a necessidade da utilização dos mesmos. Com isso a planta fica mais forte, podendo resistir a ataque de insetos, e processos naturais como seca e geada. Isso garante estabilidade dos preços e custos de produção O aumento da produtividade agrícola por meio do desenvolvimento de lavouras mais produtivas e que agridam menos o meio ambiente. Pose-se conseguir aumentar o tempo de validade dos produtos. 23 24 10/09/2020 13 Desvantagens dos alimentos transgênicos Efeitos tóxicos a partir da síntese de substâncias indesejáveis. Isso pode ocorrer devido a uma perda no controle de alimentos transgênicos, fazendo com que outros alimentos sejam afetados, o que prejudicaria outras espécies de plantas, além de animais, causando um desequilíbrio ecológico com consequências imprevisíveis. O lugar em que o gene é inserido não pode ser controlado completamente, o que pode causar resultados inesperados, uma vez que os genes de outras partes do organismo podem ser afetados. No caso da soja modificada, tem-se o receio de que a substância EPSPS provoque efeitos inesperados no organismo dos consumidores, como alergias ou outro tipo de doença. Mesmo que o gene tenha sido preparado em laboratório para funcionar apenas nas folhas, a parte comestível da planta, não há como garantir que eles atuarão da forma programada. A falta da variabilidade genética leva a uma maior vulnerabilidade do cultivo porque a invasão de pestes, doenças e ervas daninha sempre é maior em áreas que plantam o mesmo tipo de cultivo, o que pode vir a ocorrer em cultivos de plantas transgênicas. Quanto maior for a variedade genética no sistema da agricultura, mais este sistema estará adaptado para enfrentar pestes, doenças e mudanças climáticas que tendem a afetar apenas algumas variedades. A alteração na quantidade de nutrientes do alimento, pode interferir na sua absorção pelo metabolismo do homem Pode ocorrer a transferência da resistência os antibióticos para bactérias presentes no intestino de humanos e animais, pois os genes antibiótico- resistentes contidos nos alimentos transgênicos podem passar sua característica de resistência para as pessoas e animais, o que poderia gerar a anulação da efetividade de antibióticos nos mesmos. Essas alterações genéticas podem causar um intenso desequilíbrio ecológico. Alguns cientistas acham que pode vir a ocorrer o empobrecimento da biodiversidade, uma vez que a hibridação das plantas modificadas com outras variedades pode criar “super pragas” e plantas “mais selvagens”, provocando a eliminação de espécies e insetos benéficos ao equilíbrio ecológico do solo. RESUMINDO AS DESVANTAGENS: Riscos para a saúde humana • Resistência das bactérias existentes no organismo humano a antibióticos. • Alterações no sistema imunológico e em vários órgãos vitais. • Alergias alimentares. • Redução de substâncias benéficas, inclusive que protegem contra o cancro. • Evidencias científicas de ação cancerígena. • Problemas gastrointestinais. Riscos para o meio ambiente • Perda da diversidade genética na agricultura. • Variedades de plantas suscetíveis ao ataque de pragas e doenças. • Poluição genética. • Surgimento de superpragas. • Extermínio de insetos benéficos para a agricultura. • Mudanças na vida microbiana do solo. • Irreversibilidade dos impactos na Natureza. 25 26 10/09/2020 14 São a solução definitiva para os problemas da agricultura, e consequentemente da fome, no mundo? Controle de qualidade na indústria de Biotecnologia • Alguns cuidados básicos devem ser praticados para conseguir bons resultados: Nunca colocar livros e objetos pessoais sobre as bancadas de trabalho. Sempre usar avental limpo, fechado. Não comer, fumar, beber, conversar e pipetar com a boca. Manter portas e janelas fechadas durante o trabalho Esterilização. Descartar, de forma apropriada, materiais já utilizados e contaminados. 27 28 10/09/2020 15 • Assim, percebe-se que o conhecimento de uma molécula aparentemente simples como o DNA, mas capaz de armazenar todas as informações dos organismos vivos, foi capaz de transformar a produção de medicamentos, produtos agrícolas e industriais com o desenvolvimento de técnicasmodernas e especializadas, produzindo em larga escala características de interesse, proteínas, e tornando indivíduos mais adaptáveis. 29
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