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UFCSPA CURSO DE MEDICINA DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA Estudo dirigido - ESTRUTURA DE PROTEÍNAS 1. Defina estrutura primária de proteínas. 2. Como ela é mantida (tipo de ligação)? E como esta estrutura é rompida? 3. O que são proteínas multisubunidade? 4. O que são proteínas oligoméricas? 5. A insulina possui subunidades? Explique. 6. Na anemia falciforme há a substituição de um resíduo de Glu por um resíduo de Val, na posição 6 da cadeia de -globina. Esta substituição é do tipo conservativa ou não-conservativa? Este tipo de substituição poderia afetar a estrutura tridimensional da proteína? E sua função poderia ser afetada? Explique. 7. Nas proteínas que exercem função em meio aquoso como nas proteínas citoplasmáticas ou do sangue, os resíduos de Val, Leu e Phe, ficariam especialmente voltados para interior molécula proteica Esta afirmação está correta Justifique 8. O que é estrutura secundária? 9. Diferencie -hélice de -conformação. 10. Defina estrutura terciaria. 11. Como é a estrutura terciária em proteínas fibrosas? E em proteínas globulares? 12. Quais as forças que mantém a estrutura terciária? 13. Exemplifique dois aminoácidos que podem formar curvas (dobras) na estrutura terciária das proteínas: 14. Comente a afirmação Cada proteína globular tem uma estrutura diferente adaptada à sua função biológica 15. No caso das proteínas globulares, para se entender a estrutura tridimensional completa é preciso analisar seu padrão de enovelamento, e há dois termos que descrevem os padrões de estruturas de proteínas ou elementos de cadeia polipeptídica: motivo ou estrutura super- secundária e domínio. Explique cada um deles: 16. O que são famílias e superfamílias de proteínas? 17. Defina estrutura quaternária. 18. Que forças a mantem? 19. A insulina possui estrutura quaternária? Explique. 20. O que é desnaturação proteica? 21. Cite dois agentes desnaturantes. 22. Diferencie proteína nativa de proteína desnaturada. 23. Com relação ao processo de digestão de proteínas, qual a função do ácido clorídrico liberado no estômago? (Explique com base nos seus conhecimentos sobre estrutura proteica e desnaturação). 24. Durante o processo de síntese proteica, a maneira mais comum das proteínas assumirem a sua conformação nativa é com o auxílio das chaperonas. O que são as chaperonas? Onde se localizam? Qual o seu papel no enovelamento proteico? 25. Qual o destino das proteínas enoveladas de forma inadequada? 26. Agregados intra e extracelulares de proteínas inadequadamente dobradas podem formar acúmulos proteicos insolúveis. Este processo de dobramento inadequado de proteínas dá origem a diversas doenças. Comente a relação entre os agregados proteicos e a etiologia: a) Do Alzheimer b) Da doença da vaca louca c) Do diabetes tipo II 1) Estrutura primária é a sequência linear de aminoácidos 2) A ligação peptãtra é o que une os aminoácidos . Ela é rompida por hidrólise ( adição de had . 3) Proteínas multimhmidadr são aquelas com 2 ou mais cadeias polipeptídicas ( associadas de modo não covalente . 4) Ohjoméricas tem subunidades iguais , que são chamadas de protômevr . 5) A insulina possui 2 subunidades ( A e B) , que são unidos por uma ponte dissulfeto ( união entre doisresíduosde cisterna cys). 6) A substituição do resíduo de Gto na posição 6 da P - globina por uma Val não é conservativa , pois o resíduo de Glu é hidrofílica , e o resíduo de Val é hidrofóbico . Isso faz com que a parte hidrofílica nova (do Val ) que fica despontada pl fora da proteína interaja com outra p - glebiwe , aglomerando as mobíubs de Hbs em fibras rígidas , " adoecendo " se eritrócitos . 7) Está correto , pois a Valina , a Leucina e a Fenilalanina são reis apolares , ou seja , seus radicais são hidrofóbicos , o que faz com que eles se voltem pl dentro da proteína quando em meio aquoso . 8) A estrutura secundária é a conformação espacial que a sequência de aàs adquire . 9) d- hélice: uma espiral que se forma por pontes de H entre os NM de um resíduo e o CO de outro B- conformação ( P - pregueadd: ela é composta por pontes de H perpendiculares à espinha dorsal . Ela pode ser composta por 2 ou mais cadeias. peptídios ( fitas B) . 1H Estrutura terciária : é o arranjo tridimensional de todos os átomos da proteína . 4) Nas proteínas fibrosas a estrutura terciária é simples , pois elas são formadas por apenas um tipo de estruturasecundária . Nas proteínas globulares, a estrutura terciária varia , devido aos diversos tipos de estruturas secundárias . Cada pvt . gbb . tem estmt . 5- adaptada à função biológica . 127 Diversas internas entre os reis estabilizam a esta . 3' , são elas: - Ligações iônicas / salinas : atração eletrostática entre grupos carregados com cargas opostas - Ligações hidrofóbicas : entre radicais de aàs apolares , se aproximam e repelem a água . - Pontes de Hidrogênio : geralmente entre H - F, O , N - Ligações cadentes: entre os Átomos , através do compartilhamento de e- ( ex : ponto dissulfeto) B) la aàs Pro , Thr , Ser e Gly tendem a formar curvaturas . 141 As proteínas globulares têm grande divindade e complexidade estrutural , devido ao enovelamento e dobramentos , o que garante ,consequentemente , diversas funções biológicas . 1 5) motivo / superestrut . 21 domínio : parte independente estaúl ou que se movimenta como Refere- se aos tipos de estmt E que compõem uma entidade isolada , a eshtt. 2! Podem ser : Domínios t podemter função F na proteína - todo o - todo B - d / R ( segmentos x e B intercalados) - d t B (regiões d e B um pouco separadas) 1 6) Família proteica : classificação de proteínas com semelhantes esta# e/ou semelhantes estrut. 31 e funções . Syserfamília proteica : famílias d pouca similaridade na estvt. A, mas com motivos e funqêes semelhantes . 1 7) Estrutura quaternária é a interação entre duas ou mais cadeias polipeptídicas ( subunidades . 1 8) É mantida por ligações iônicas , patos de tl e interações hidrofobia . B) A insulina possui estrutura quaternária , já que ela possui duas cadeias interligados de modo covalente ( s - s) . G) Desnaturação é a alteração da estrutura proteica , mas sem romper as ligações peptídios . 2N Os agentes desnaturados podem ser físicos ( temperatura , raio X , ultra-som e químicos ( ácidos e bases fortes , detergentes , meia , menapttand ) 22) A proteína nativa possui conformação 3D e está biologicamente ativa . A proteína desnaturada está inativa , possuindo somente a estrutura primária . B) O adido clorídrico ( Mdl , presente no suco gástrico, tem pH entrevamento alado, o que desnatura as proteínas e contribui para facilitar a digestão . 2 4) As chaparmos são proteínas de choque térmico ou proteínas do estresse , que se ligam às cadeias polipeptídicas que não possuem o ddramento correto, impedindo a sua agregação . Há chapamos eitádicas ( presente no eitosd) , como a Msp 70 , e as organelas (presentes em organelas), como a Hspbl No enovelamento elas contribuem para um microambiente adequado e facilitam os mecanismos . Aumentam a velocidade , limitando o n° de vias não produtivas. Podem dobrar corretamente as proteínas desdobrados ou levá- los para serem degradadas pelos prdeotsomos . {5) As proteínas dobradas de forma inadequada são marcadas pela ubigmtina e posteriormente degradadas pelo proteassomo, um processo dependente de ATP . 2 6) Amiloidose : doenças degenerativas causadas pela deposição de agregados proteicas em órgãos(tecidos . a) Alzheimer : a proteína p - amiloide (A pd, formada por 40 - 43 aás, é depositado no cérebro . Quando agregado nessa configuração esse peptdio torna - se neurotóxico b) " Vaca louca" : A encefalopatia espongiforme bovina tem como característica um cérebro cheio de buracos. Isso ocorre quando a proteína príon ( Pr P ) se encontra numa configuração alterada, a RP " lscrapid . A estrutura da Pr P é duas hélicesd, já a da Pr P " , maior parte foi convertida em folhas p . A interação da Pr P " com a RP transforma a última naforma Prp? c)Diabetes tipo I : A anilina l pepthdio amiloide das ilhotas é um hormônio armazenado junto com a insulina nas células B, liberado em aumento glicêmico . tem grandes concentrares, pode ocorrer a fibrilação ( organização em fibrilas) e a formação de amiloides , que se depositam ao redor das ilhotas e destroem gradualmente as células B. tem essas ilhotas de células, não há produção de insulina .
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