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Fisiologia Microbiana Uma vez que uma bactéria é cultivada em laboratório, geralmente é simples determinar o que ela faz para sobreviver, ou seja, determinar suas capacidades metabólicas. (...) Que nutriente são essenciais? (...) em que quantidades? Contudo, quando microrganismos ainda não podem ser cultivados, podemos estudá-los? Sim, podemos. Mas não da mesma forma. Podemos porém estudar os seus genes em vez dos metabolismos. Fonte: Microbiologia de Brock p. 379 1. Nutrição Microbiana ◆ Todos os microrganismos precisam de nutrientes para seu crescimento e multiplicação (reprodução) ◆ Os nutrientes serão utilizados no metabolismo microbiano para: – Obtenção de Energia (moléculas de ATP) – Formação de Biomoléculas – Moléculas reguladoras do Metabolismo ou Fatores do Crescimento (ex. Vitaminas) 2. Categorias Nutricionais FONTES DE ENERGIA A partir da LUZ >==> FOTOTRÓFICOS A partir de Redução de Moléculas >==> QUIMIOTRÓFICOS FONTES DE CARBONO Se carbono orgânico >==> HETEROTRÓFICOS Se carbono inorgânico >==> AUTOTRÓFICOS Estas podem ser classificadas com base em duas fontes: de Energia e de Carbono 2. Categorias Nutricionais MICRORGANISMOS QUIMIO-HETEROTRÓFICOS (Bactérias, Protozoários e Fungos) A nutrição dos seres QUIMIO-HETEROTRÓFICOS ocorre por meio da ABSORÇÃO dos nutrientes a partir do meio ambiente externo. Os nutrientes são absorvidos do meio externo e metabolizados para gerar energia para suas atividades vitais por meio de: • RESPIRAÇÃO CELULAR ou FERMENTAÇÃO (serão vistos na aula sobre Metabolismo Microbiano) MICRORGANISMOS QUIMIO-AUTOTRÓFICOS OU FOTO-AUTOTRÓFICOS (Bactérias, Arqueobactérias e Algas) A nutrição ocorre por meio da AUTOTROFIA. As espécies autotróficas são capazes de produzir o seu próprio alimento (nutrientes) por meio de: • FOTOSSÍNTESE (FOTO-AUTOTRÓFICOS ) ou da QUIMIOSSÍNTESE (QUIMIO-AUTOTRÓFICOS) (também serão vistos na aula sobre Metabolismo Microbiano) COMPOSIÇÃO QUÍMICA DAS CÉLULAS Os microrganismos são compostas, essencialmente, por ● compostos orgânicos: proteínas, ácidos nucléicos, polissacarídeos, lipídeos, vitaminas. ● compostos químicos inorgânicos, íons e água NUTRIENTES: substâncias que participam do metabolism celular, seja para serem quebradas em moléculas menores e/ou obter energia (catabolismo), seja para, a partir de moléculas menores, se construirem biomoléculas (anabolismo). Logo, as funções dos nutrientes são energética, construtora, reguladora Macronutrientes: nutrientes necessários em grandes quantidades. Micronutrientes: nutrientes necessários em pequenas quantidades. Fatores de crescimento: compostos essenciais ao metabolismo, que não são sintetizados pela célula e partcipam como coenzimas, cofatores (ex. vitaminas) 4. Macronutrientes e Micronutrientes Carbono: presente nos compostos orgânicos como aminoácidos, ácidos orgânicos, açúcares, bases nitrogenadas. Fonte inorgânica de C: carbonatos, CO2, etc). Hidrogênio: presente em proteínas, açúcares e demais moléculas orgânicas. Também é obtido a partir da água. Um dos principais constituintes celulares. Oxigênio: provém de compostos orgânicos ou da água, do C02...; é essencial como aceptor final de elétrons na respiração celular aeróbica. Mas não é essencial a todos os seres vivos (ex. seres anaeróbios) Nitrogênio: fonte de N pode ser de compostos orgânicos ou inorgânicos; vem da degradação de proteínas e ácidos nucléicos, amônia e nitratos. Fonte externa inorgânica: nitrito, nitrato, amônia; ou pela fixação biológica de N2 por bactérias específicas. Fósforo: orgânico (ácidos nucléicos) ou inorgânico (fosfatos). Presente nos ácidos nucléicos e fosfolipídeos. Em sua maioria, os microrganismos utilizam o fósforo sob a forma de compostos inorgânicos. Principais Macronutrientes Enxofre: presente nos aminoácidos (cisteína e metionina) e em vitaminas (tiamina, biotina); sofre uma série de transformações naturais, exclusivamente realizadas por microrganismos. Fontes: sulfatos orgânicos, inorgânicos, sulfetos, H2S. Potássio: papel ativador de várias enzimas, tais como aquelas envolvidas na tradução. Magnésio: grandes quantidades, papel na estabilização de ribossomos, membranas e ácidos nucléicos, importante para o funcionamento de diferentes enzimas, especialmente as envolvidas na transferência de fosfato. Cálcio: obtido na forma de sais de cálcio, importante para certas enzimas, estruturas como endosporos, estabiliza a parede cellular. Sódio: essencial em quantidades variadas, dependendo das espécies. Espécies Halófilas requerem altas concentrações de sal. Ferro: provém de sais de ferro, hidróxidos de ferro. Importante na respiração celular (citocromos), em enzimas e cofatores. Principais Micronutrientes Necessários em pequenas quantidades. Seu papel é tão importante quanto os macronutrientes. Cobalto: necessário para a formação da vitamina B12. Zinco: tem papel estrutural em várias enzimas (DNA e RNA polimerases) e outras proteínas de ligação ao DNA. Molibdênio: presente em certas enzimas como a nitrato redutase assimilativa. Cobre: importante para enzimas respiratórias. Manganês: ativador de muitas enzimas. Níquel: presente em hidrogenases. Cromo: metabolismo da glicose. Compostos orgânicos necessários para o crescimento celular mas que as células são incapazes de sintetizar: Exemplos: Vitaminas, Aminoácidos, Purinas e Pirimidinas Algumas funções desempenhadas pelas principais vitaminas requeridas pelos microrganismos: biotina - Biossíntese de ácidos graxos, b-decarboxilações, fixação de CO2; tiamina (B1) - a-decarboxilações e transcetolase piridoxina (B6) - transformações de aminoácidos e ceto ácidos cobalamina (B12) - redução e transferência de fragmentos únicos de carbono, síntese de desoxirribose. Fatores de Crescimento 5. Meios de Cultura Meios de Cultura ou Meios de Cultivo ou Meios Nutritivos são soluções aquosas contendo nutrientes importantes para o crescimento dos microrganismos em laboratórios. Os meios são utilizados para diversos fins: isolar os microrganismos, estudar seu metabolismo bioquímico, energético, para fins de diagnóstico, etc… Para isso, é necessário o conhecimento das exigências nutricionais para o desenvolvimento de cada microrganismo em específico. Além dos nutrientes, é preciso também conhecer as condições físico-químicas ideiais para cada espécie, como temperatura, pH, umidade, oxigênio, pressão, entre outros. 6. Meios de Cultura Devem conter fontes nutricionais de macronutrientes (C, N, P e S, e outros) ; micronutientes e fatores de crescimento. Podem estar em estado sólido, semi-sólido ou líquido. Neste caso solidifica-se acrescentando agarose (semelhante a gelatina) Existem variados tipos de Meios de Cultivo para os inúmeros microrganismos já isolados Possuem composição variada dependendo da finalidade do experimento (se isolamento, se crescimento, se testes, etc..) Meio de Pré-enriquecimento: para amostras debilitadas no crescimento, que sofreram algum dano, e precisam ter seus crescimento reativado (Ex.: caldo lactosado); Meio de Enriquecimento: para favorecer o crescimento inespecífico de bactérias em geral (Ex.: Caldo Tetrationato); Meio Seletivo: para inibir o crescimento de alguns microrganismos e propiciar o desenvolvimento de outros (Ex.: Manitol e MacConkey); Meio Diferencial: para permitir a diferenciação de microrganismos parecidos (Ex.: Ágar sangue e MacConkey); Meio Triagem: para avaliar as atividades metabólicas específicas das espécies, permitindo a identificação de microganismos. (Ex.: Tríplice açúcar e ferro); Meio Identificação: para realizar provas bioquímicas e avaliar as funções fisiológicas do microrganismo a ser identificado (Ex.: Ágar citrato, Caldo nitrato); Meio quimicamente definido: meio que se conhece a constituição nutricional e quantidades de cada nutriente, para estudos bioquímicos dosmicrorganismos Meio complexo: que apresenta compostos orgânicos complexos como peptona, extrato de levedura, e não se conhece exatamente a composição nutricional de cada elemento Meio de Manutenção: conserva os microrganismos em laboratório (Ex.: Ágar Sabouraud). Exemplos de Meios de Cultivo Conformação de Meios de Cultura Meio de Cultivo Líquido, distribuído em tubos de ensaio. Observe os tubinhos de Duhan internamente (usados em testes de produção de gases pelo microrganismo) Meio de Cultivo Sólido (1% ágar), distribuído em Placas de Petri. Observe a Alça (em anel - azul) para inocular os microrganismos na superfície do meio Meio de Cultivo Semi-Sólido(0,5% ágar), distribuído em Tubos de Ensaio. Observe que o meio solidificou inclinado para aumentar a superfície de semeadura do microrganismo Meio de Cultivo Sólido Meio de Cultivo Semi-Sólido Etapas importantes para o preparo de meios de cultura 1. Seleção dos nutrientes e pesagem 2. Dissolução em água e aliquotagem em frasco para esterilizar 3. Esterilização em autoclave 4. Aliquotagem após esterilização (em alguns casos) Etapa 1 Etapa 2 Etapas importantes para o preparo de meios de cultura 1. Seleção dos nutrientes e pesagem 2. Dissolução em água e aliquotagem em frasco para esterilizar 3. Esterilização em autoclave (calor úmido, sob pressão) 4. Aliquotagem após esterilização (em alguns casos) Etapa 3 Etapa 4 Meios SEM e COM crescimento microbiano SEM crescimento COM crescimento Crescimento evidente pela turvação Crescimento evidente pelas colônias na superfície do meio OUTROS EXEMPLOS DE MACROCOLÔNIAS CRESCIDAS EM MEIO SEMI- SÓLIDO OU SÓLIDO Caldo Simples - formulação: Extrato de carne ............ 0,3 g Peptona ......................... 1,0 g Cloreto de sódio ............ 0,5 g Água destilada .............. 100,0 ml Agar Sabouraud - formulação: Peptone Dextrose Agar EXEMPLOS DE COMPOSIÇÃO DE ALGUNS MEIOS DE CULTIVO Divisão celular bacteriana É exponencial REPRODUÇÃO ASSEXUADA POR FISSÃO BINÁRIA Crescimento é exponencial Lag Log Estacionári a Declínio ou morte CURVA PADRÃO DE CRESCIMENTO Qual(is) espécie(s) atingiu(ram) maior população? Qual(is) espécie(s) apresentou(aram) maior fase lag? Qual(is) espécie(s) apresentou(aram) fase estacionária? Qual(is) espécie(s) apresentou(aram) fase decínio ou morte? CURVA DE INIBIÇÃO OU CURVA DE MORTE Fonte: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100- 40422018000400367 Curva de morte obtida com os filmes poliméricos de Ecoflex® aditivados com 1 e 2% (m/m) de NPs-ZnO e para o filme polimérico de Ecoflex® puro frente a bactéria E. coli http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-40422018000400367 Fatores físico-químicos importantes para o crescimento microbiano: pH temperatura oxigenação salinidade pH Maioria bactérias crescem em pH perto da neutralidade 6,5 a 7,5. Fungos crescem normalmente em pH mais ácido pH 5-6 Valores extremos são restritos a alguns grupos microbianos Temperatura Oxigenação 1- Aeróbios estritos ou obrigatórios (precisam O2 para viver. Não vivem sem O2) 2 - Anaeróbios estritos (não usam O2. e na presença de O2 morrem) 3 - Anaeróbios facultativos (podem usar O2 mas na falta deste crescem também). Na fermentação ou respiração anaeróbia (nitrato substitui o O2) 4 – Microaerófilos (necessitam baixas quantidades O2). Uso de Jarras com condições de microaerofilia 5 - Anaeróbios aerotolerantes (não usam, mas toleram o O2 ) Tubos 1 2 3 4 5 Salinidade Salinidade Os microrganismos variam de acordo com sua tolerância à concentração de sal no meio. Podem ser Não Halófilo, Halotolerante, Halófilo, Halófilo Extremo Quando uma célula está num meio rico em sais (hipertônico) ocorrerá a perda de água da célula para o meio externo, causando a plasmólise da célula. Ex. conservação alimentos pelo processo de salgamento Pressão Osmótica é a pressão decorrente da Osmose: transporte passivo onde a água sempre migra do meio hipotônico para um meio hipertônico Técnicas Semeadura Microbiana CONCEITOS IMPORTANTES ISOLAMENTO de um microrganismo é possível pela obtenção de uma cultura pura. Esta colônia pura deve ser formada a partir de um único microrganismo. Por isso, ao semear o microrganismo no meio sólido, deve-se estriar de tal forma que as células microbianas fiquem separadas entre si. SEMEADURA: Inocular ou fazer o plantio de um microrganismo em um meio de cultura, a partir de um material já contendo o micróbio. REPIQUE: transferência de um microrganismo daquele meio de cultura que estava crescendo (meio 1) para outro meio novo e estéril (meio 2), considerando-se o esgotamento nutricional e acúmulo de metabólitos tóxicos no meio 1, e a necessidade de se manter a população microbiana sempre viva e metabolicamente ativa. Equipamentos e Instrumentos Bico de Busen Capela Fluxo Laminar Cabo de Kolle e alça em anel Alça em anel (3 tamanhos), em picada e para espalhamento Equipamentos e Instrumentos Micropipetador e ponteiras Alça de Drigalski Pipetas Semeadura em Meio Sólidos Esgotamento de alça Em Picada Semeadura em Meio Sólidos Estrias Múltiplas para Isolamento Espalhamento Repique em Meio Líquido Difusão Técnicas de Quantificação Pour plate Contagem em Câmara de Neubauer Contagem Espectrofotômetro Processos Automatizados O BD BACTEC é um sistema automatizado desenvolvido para detectar o crescimento de microrganismos em amostras de sangue. O aparelho não é invasivo e monitora, agita e incuba frascos simultânea e continuamente.