Filogenia de grupos - Biodiversidade

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FILOGENIA DE GRUPOS
filogenia : estuda história evolutiva e padrões . pode significar
de relacionamento entre indivíduos → falta de dados
→ especiação rápida - múltiplos eventos de especiação
→ sequenciamento de proteínas e DNA na metade ocorreram ao mesmo tempo
do século XX .
→ após anos 2000 → filogenia ocupando papel
central na genômica evolutiva .
tánon A tánonb tánonc
{ µ ↳ e é o grupo
% ancestral comum
interno
A e B são
Ênio) métodos de análise filogenética
→ métodos fonéticos : árvores são calculadas por→
raiz
grupos irmãos similaridade e baseadas em métodos de distância
→ métodos cladística : árvores são calculadas
rladograma × filogenia considerando os vários caminhos evolutivos
te
t
• hipótese . historia verdadeira • métodos de distância : v eficiência computacional
ou ou × pouco eficiente quando
• comprimento de . compramos indica quantidade divergem muito
ramos é arbitrário de mudança de caracteres .
• métodos discretos - parcimônia
dados ↳ para cada posição no alinhamento, todas
árvores possíveis são avaliadas e recebem pontuação
LN W com base no número de mudanças evolutivas .
↳ a árvore t parcimoniosa é aquela com↳ menor número de mudanças evolutivas para todas
sequências derivarem de um ancestral comum .
Dado : grupo de organismos que inclui um ancestral ✓simples
e todos os descendentes desse ancestral . × falta de suposição a priori
↳
um galho da árvore da vida
↳
grupo monofiléticos
. métodos probabilísticas
↳ objetivo
: encontrar topologia de árvore
árvores em forquilha que aumente a probabilidade de conter um conjunto
A B C D E F de dados de acordo com um modelo de evolução
µµ . manimum likelihood
F-
- análise Bayesiana
↳ nós com mais de duas linhagens descendentes
formando pentes .