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BIOLOGIA RESUMIDA – ÁCIDOS NUCLEICOS PROFESSOR RAFAEL MARQUES BIOLOGIA RESUMIDA ÁCIDOS NUCLEICOS PROF. RAFAEL MARQUES Apelidados de moléculas mestras da vida Funcionamento resumido no dogma central da vida Controlam a reprodução, e o metabolismo Gene é um trecho de DNA que são passíveis de transcrição A transcrição possibilita a chegada das informações genéticas aos ribossomos As células diplóides apresentam dois genomas originados dos parentais no momento da fecundação Ácidos nucleicos são polímeros de nucleotídeos Nucleotídeos: são formados por 3 componentes básicos 1. Base nitrogenada: são divididas em dois grupos: Purinas (adenina e guanina): apresentam 2 anéis Pirimidinas (citosina, timina e uracila): apresentam 1 único anel 2. Pentose: podendo ser a ribose ou a desoxirribose 3. Grupamento fosfato Ex.: Adenosina trifosfato (ATP): a hidrólise do ATP produz ADP + ácido fosfórico (𝑯𝑯𝟑𝟑𝑷𝑷𝑶𝑶𝟒𝟒) + energia (7,3 kcal) Os nucleotídeos ligam-se por ligações fosfodiéster A ligação se estabelece entre o fosfato 5’ e a hidroxila 3’ BIOLOGIA RESUMIDA – ÁCIDOS NUCLEICOS PROFESSOR RAFAEL MARQUES Polinucleotídeos são o produto da interação entre vários nucleotídeos Os nucleotídeos podem ser de dois tipos: 1. Desoxirribonucleotídeos: formados por desoxirribose, adenina, timina, citosina e guanina Formam o Ácido Desoxirribonucleico (DNA/ADN) 2. Ribonucleotídeos: formados por ribose, adenina, uracila, citosina e guanina Formam o Ácido Ribonucleico (RNA/ARN) Ácido desoxirribonucleico (DNA) Erwin Chargaff (1950): descreve a relação entre a quantidade de purinas e pirimidinas Adenina + guanina = timina + citosina James Watson e Francis Crick (1953): desvendam a estrutura tridimensional do DNA Dupla cadeia de polinucleotídeos Ligadas por pontes de hidrogênio entre A e T; G e C Apresentam giros no sentido horário (para a direita) Uma fita dá uma volta completa a cada 10 pares de bases As cadeias se apresentam numa configuração antiparalela Questão 1 Recentemente, cientistas construíram uma molécula de ácidos nucleicos formada por oito nucleotídeos que apresentavam as quatro bases nitrogenadas tradicionais (Adenina, Timina, Citosina e Guanina) e quatro novas bases (Z, P, S e B). Existe uma relação química e funcional das bases tradicionais já conhecidas com as novas bases, como descrita a seguir: A partir dessas informações e dos conhecimentos sobre a estrutura do DNA, é correto afirmar que, no ácido nucleico sintético: a) “P” se une a “Z” por três pontes de hidrogênio. b) “P” se une a “Z” por uma ligação peptídica. c) “S” se une a “B” por duas ligações peptídicas. d) “P” se une a “B” por três pontes de hidrogênio. e) “S” se une a “Z” por duas pontes de hidrogênio. Questão 2 Considere uma sequência de DNA com 100 pares de bases de comprimento contendo 32 timinas. BIOLOGIA RESUMIDA – ÁCIDOS NUCLEICOS PROFESSOR RAFAEL MARQUES Quantas citosinas, guaninas e adeninas essa sequência terá, respectivamente? a) 32, 68, 68. b) 68, 32, 68. c) 68, 68, 32. d) 32, 18, 18. e) 18, 18, 32. Replicação do DNA – “o sentido da vida” Propriedades da replicação 1. Com múltiplas origens de replicação: várias enzimas iniciam a replicação, simultaneamente em vários pontos); aumento da velocidade de replicação 2. É bidirecional: a partir de cada origem as enzimas agem nos dois sentidos (2 meses/12 horas) 3. Semi-conservativa: A replicação é semiconservativa: nas duas novas moléculas, uma fita é parental e a outra recém sintetizada: menor chance de ocorrência de erros 4. Descontínua em cadeia Visão geral da replicação semiconservativa 1. Helicase: rompe as pontes de hidrogênio 2. Forquilhas de replicação em forma de Y 3. Síntese de primers pela primase. 1 Primer no Molde da fita líder (3’ -> 5’); vários primers no Molde da fita retardada (5’ -> 3’) 4. DNA polimerase III sintetiza a nova fita de DNA complementar em cada fita original. (5’ - > 3’) 5. Fita líder replicada de modo contínuo 6. A Fita Retardada sintetizada de forma descontínua. Formação dos Fragmentos de Okazaki. 7. DNA polimerase I substitui os primers por nucleotídeos de DNA 8. DNA ligase liga os Fragmentos do Okazaki BIOLOGIA RESUMIDA – ÁCIDOS NUCLEICOS PROFESSOR RAFAEL MARQUES Experimento de Meselson e Stahl Tem como objetivo investigar as ideias de Watson e Crick em relação a semiconservatividade da replicação do DNA Utiliza-se bactérias em meios de cultura com N15 (nitrogênio pesado) e N14 (nitrogênio leve) 1. Replicação das bactérias em meio com N15 2. Transferência das bactérias para meio com N14 3. Retirada imediata de uma amostra: DNA com N15 /N15 4. Amostra retirada após 20 minutos: DNA com N15/N14 5. Amostra retirada após 40 minutos: 50% dos DNA’s com N15/N14 e 50% N14/N14 Conclusão: a fita de DNA com nitrogênio 15 se conserva em todas as gerações, portanto, confirma-se a semiconservatividade Transcrição: fenômeno de produção de RNA É feita a partir de um determinado gene ou sístron Genes apresentam duas fitas: Uma será a fita codificante, onde existe a sequência de bases que será transcrita A outra será a fita complementar, que apresenta apenas função estrutural Região promotora: sítio de ligação da enzima RNA polimerase; sempre antecedem os genes A transcrição também é feita no sentido 5’ 3’ por complementaridade de bases entre os nucleotídeos de RNA e os de DNA Adenina pareia com uracila e guanina com citosina Regiões não codificantes do DNA São consideradas regiões hipervariáveis (varia muito entre indivíduos; não está sujeito à ação da seleção natural) 98,5% do DNA não é codificadora de proteínas (1) Grande parte é formada por pseudogenes (genes herdados ao longo da história BIOLOGIA RESUMIDA – ÁCIDOS NUCLEICOS PROFESSOR RAFAEL MARQUES evolutiva) e (2) vírus incorporados ao DNAc (estratégia reprodutiva) As regiões hipervariáveis não são transcritas nem traduzidas! 2003 – Término do projeto genoma humano Teve o papel de sequenciar todas as bases nitrogenadas do DNA Ao final foram encontrados cerca de 25.000 genes Esse genoma é capaz de codificar cerca de 100.000 proteínas (?) Splicing alternativo Garante a produção de mais de um tipo de proteínas a partir de um único produto da transcrição (pré-mRNA) em células diferentes Íntrons: trechos dos genes que são apenas transcritos; não são traduzidos Éxons: transcritos e traduzidos Ocorre a remoção dos íntrons e a recombinação dos éxons ainda dentro do núcleo, formando vários RNAm Transcrição em eucariotos e procariotos Eucariotos Procariotos Apresentam íntros, éxons e splicig Não apresentam Sem colinearidade de genes (RNA ≠ GENE) Apresentam colinearidade de genes (RNA = GENE) Apresentam RNA monocistrônico (1 RNA = 1 GENE) Apresentam RNA policistrônico (1 RNA = vários genes) Questão 3 O Projeto Genoma Humano (PGH) teve por objetivo o mapeamento do genoma humano e a identificação de todos os nucleotídeos que o compõem. Após a iniciativa do National Institutes of Health (NIH) dos Estados Unidos, centenas de laboratórios de todo o mundo se uniram à tarefa de sequenciar, um a um, os genes que codificam as proteínas do corpo humano e também aquelas sequencias de DNA, que não são genes. Laboratórios de países em desenvolvimento também participaram do empreendimento com o objetivo de formar mão-de-obra qualificada em genômica. Fonte: Sobiologia, 16/05/2015 Disponível em: http://www.sobiologia.com.br Nesse sentido, analise as afirmações a seguir e marque com V as verdadeiras e com F as falsas. ( ) A transcrição ocorre no citoplasma das células e consiste na síntese de uma molécula de mRNA a partir da leitura da informação contida numa molécula de DNA. ( ) Éxon é umsegmento de bases nitrogenadas de um determinado gene eucarioto que http://www.sobiologia.com.br/ BIOLOGIA RESUMIDA – ÁCIDOS NUCLEICOS PROFESSOR RAFAEL MARQUES consiste em DNA que codifica uma sequência de nucleotídeos no RNA mensageiro. ( ) Os íntrons são segmentos de DNA que não codificam qualquer parte da proteína codificada pelo gene. ( ) O íntron é inicialmente transcrito na molécula de pre-RNAm (transcrito primário), mas depois é eliminado durante o processamento ou splicing do RNA, antes de sair do núcleo celular. ( ) A replicação é um processo no qual cada cadeia de DNA origina duas cadeias filhas idênticas a ela através de um processo semiconservativo. Este processo ocorre durante a subfase G1 da interfase. A sequência correta, de cima para baixo, e: a) V – F – V – F – V. b) F – V – V – V – F. c) V – V – F – F – V. d) F – F – F – V – V. Em eucariotos, a unidade de regulação da transcrição é o operon O promotor antecede uma sequência de genes específicos Entre o promotor e a sequência de genes existe o operador Apresenta um sítio de ligação com o repressor (inibe a transcrição) A regulação da expressão pode ser feita pela lactose Lactose liga-se ao repressor e torna os genes transcricionalmente ativos Ácido ribonucleico (RNA) RNAm: é o produto da transcrição que será traduzido à nível ribossomal Extremidade 5’: apresenta um cap formado por metilguanosina Extremidade 3’: apresenta uma cauda poli A OBS: Ambas com função de evitar a hidrólise por enzimas exonucleases RNAr: faz parte da estrutura do ribossomo; apresenta-se com função enzimática (ribozima) RNAt: transporta AAs para o ribossomo no momento da tradução; apresenta-se na forma de uma folha de trevo Alça aceptora ou extremidade livre (CCA): liga-se ao AA a ser transportado Alça do anti-códon (3 bases variáveis): determina o AA a ser transportado BIOLOGIA RESUMIDA – ÁCIDOS NUCLEICOS PROFESSOR RAFAEL MARQUES Mecanismos de síntese proteica Exigências para a ocorrência: 1. AA ligados ao RNAt: aminoacil-RNAt 2. RNAm 3. Ribossomos: São originados no nucléolo Apresenta composição química de 50% RNAr + 50% de proteínas Apresenta duas subunidades ligadas pelo magnésio Subunidade menor: sítio de ligação com o RNAm Subunidade maior: apresenta o (1) Sítio a: entrada de aa; (2) Sítio p: ocorre a ligação peptídica; e o (3) Sítio e: saída do RNAt Questão 4 Analise as afirmativas a seguir em relação aos tipos de RNAs e suas funções. I. O mRNA contém a sequência codificante da proteína e os elementos de reconhecimento para a iniciação e a terminação da tradução. II. Os nucleotídeos do RNA mensageiro podem ser de quatro tipos quanto às bases nitrogenadas que são A, G, C e T. III. Os RNAs transportadores são responsáveis pelo transporte dos nucleotídeos até seus respectivos códons no RNA ribossômico. IV. Os ribossomos são estruturas constituídas por RNA, conhecidos como RNAs ribossômicos, e por várias proteínas ribossômicas. V. Os tRNAs, cada qual unido ao seu respectivo aminoácido, unem-se à subunidade maior do ribossomo em locais específicos. Assinale a alternativa correta. a) Apenas as afirmativas I e II estão corretas. b) Apenas as afirmativas II, III e IV estão corretas. c) Apenas as afirmativas I, IV e V estão corretas. d) Apenas as afirmativas II e V estão corretas. Tradução do RNA mensageiro O código genético Representa a relação entre as bases nitrogenadas do material genético e os AAs do peptídeo Trinca de bases do DNA: codinome; Trinca de bases do RNA: códon; Cada códon determina 1 AA BIOLOGIA RESUMIDA – ÁCIDOS NUCLEICOS PROFESSOR RAFAEL MARQUES 64 códons codificam 20 tipos de aminoácidos O número de códons é maior do que o número de aminoácidos O código genético é degenerado ou redundante, pois: Mais de 1 códon podem definir o mesmo aminoácido (1 a 6 códons; códons sinônimos) Geralmente somente a 3ª base muda de um códon sinônimo para outro Mutações silenciosas geram um código sinônimo, consequentemente não altera o peptídeo (1/3 das mutações são silenciosas) Mutações de adição ou deleção alteram todas as trincas subsequentes Questão 5 Desde o seu surgimento, as células necessitam sintetizar proteínas estruturais e enzimas. Considerando a regulação e a manutenção da função ribossômica nesse processo, leia as afirmações abaixo. 1. Cadeias polipeptídicas são formadas pela união de aminoácidos, de acordo com a sequência de códons do RNA mensageiro. 2. A produção de enzimas depende da associação das duas subunidades do ribossomo ao DNA, na região que codifica para o aminoácido metionina. 3. Há participação de três tipos de RNA: o RNA mensageiro, o RNA transportador e o RNA ribossômico na síntese de proteínas. Está(ão) correta(s): a) 1 e 2, apenas. b) 1 e 3, apenas. c) 2 e 3, apenas. d) 1, 2 e 3. e) 3, apenas. Comparação entre código genético e material genético Código genético Material genético Relação entre códons e Aas Gene, DNA e cromossomo É universal: é o mesmo para todos os seres vivos (16 exceções entre 1,5 milhões de espécies) Varia de um indivíduo para outro (com exceção dos clones) Não pode ser alterado! Pode ser alterado por mutações, crossing over e engenharia genética Gabarito 01 02 03 04 B D B B
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