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UNIVERSIDADE FEDERAL DE MATO GROSSO CAMPUS UNIVERSITÁRIO DE RONDONÓPOLIS/CUR INSTITUTO DE CIENCIAS EXATAS E NATURAIS/ICEN DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS Mônica Ehrhardt Relatório Relatório da visita técnica no laboratório de citogenética – ufmt/cuiabá genética humana Docente responsável pela disciplina: Lucas Silveira Lecci Rondonópolis 2019 Sumário INTRODUÇÃO 3 1. OBJETIVOS 4 1.1. Objetivo Geral 4 1.2. Objetivo Específico 4 2. MATERIAL E MÉTODOS 5 2.1. Amostragem 5 2.2. Extração e Amplificação de DNA 5 3. DISCUSSÃO 6 REFERÊNCIA BIBLIOGRÁFICA 7 INTRODUÇÃO De acordo com Sollero et al. (2004), o DNA corresponde à matéria prima para qualquer conhecimento de genética. Estudos básicos sobre metodologias específicas que possam otimizar a extração de DNA de boa qualidade de uma amostra, para que as regiões desejadas sejam localizadas e amplificadas, são de grande importância para o desenvolvimento de pesquisas no campo da biologia molecular. O isolamento do DNA é uma etapa importante na análise de estrutura e organização do genoma dos animais. Independente do tipo de estudo molecular, as preparações de DNA devem produzir amostras puras suficientes para não inibir os tratamentos enzimáticos ou causar interferências nos padrões de migração em gel de eletroforese (ROMANO; MIRANDA, 1999). Para isso são utilizados protocolos de extração de DNA que, apesar de apresentarem pequenas diferenças na dependência do material biológico que será utilizado, consistem de duas etapas principais. Na primeira etapa os reagentes mais comumente empregados para a obtenção de lise das membranas celulares são os detergentes, permitindo a liberação do DNA. Na segunda etapa, realiza-se um ou mais tratamentos enzimáticos ou químicos para purificar a preparação de contaminantes como RNA, proteínas e outras macromoléculas (BLOOM; FREYER; MICKLOS, 2002). Assim como os reagentes, a boa qualidade do DNA é essencial para se obter bom resultado em experimentos (HOY, 1994), especialmente no uso da reação da polimerase em cadeia (PCR), nos quais os excessos de estruturas celulares e proteínas podem inibir o processo de amplificação (SAIKI, 1990). De acordo com Valentim, Vargas e Moreira (2003), a quantificação do DNA pode ser realizada por meio da comparação entre a intensidade das bandas visualizadas no gel de agarose das amostras extraídas, com aquela observada nos padrões de DNA lambda, que apresentam as concentrações de 5, 10 e 20 ng/mL. Porém alguns autores vêm utilizando a análise espectrofotométrica para quantificar e avaliar a pureza que é expressa pela razão das absorbâncias A260nm/A280nm, para leitura do DNA e proteína, respectivamente. 1. OBJETIVOS 1.1. Objetivo Geral Acompanhar a rotina do Laboratório de Citogenética da UFMT – Cuiabá. 1.2. Objetivo Específico Aprender os procedimentos de Extração de DNA, PCR e Eletroforese em Gel de agarose, assim como a manipulação dos aparelhos utilizados nos mesmos; Aprender a realizar a leitura dos resultados obtidos na Eletroforese. 2. MATERIAL E MÉTODOS 2.1. Amostragem As amostras de tecido (músculo e fígado de peixe; músculo de Beija-Flor) foram coletadas em microtubos estéreis contendo etanol absoluto na proporção de nove partes de álcool para uma parte de tecido, sendo armazenadas a -20 ºC, no Laboratório de Citogenética da UFMT – Cuiabá. 2.2. Extração e Amplificação de DNA A extração de DNA foi realizada conforme protocolo de extração salina publicado por ALJANABI & MARTINEZ (1997). Os loci selecionados foram amplificados, por meio da PCR no termociclador que consistiu nas seguintes etapas: 1. Desnaturação (95ºC a 96ºC): Aquece fortemente a reação para separar, ou desnaturar, as fitas de DNA. Isso proporciona um molde de fita simples para a próxima etapa; 2. Anelamento (55ºC a 65°C): Resfria a reação para que os primers possam se ligar às suas sequências complementares no DNA molde de fita simples; 3. Extensão (72°C): Eleva a temperatura da reação para que a Taq polimerase estenda os primers, sintetizando novas fitas de DNA. Estas etapas se repetiram por 35 vezes, num período de 2 horas. A análise da integridade do DNA foi visualizada através de eletroforese em gel de agarose 1% corado com brometo de etídio e a concentração determinada através de espectrofotometria a 260/280 nm. 3. DISCUSSÃO Por meio desta visita Técnica ao Laboratório de Citogenética da UFMT – Cuiabá, foi possível entender como é a rotina do laboratório, desde o armazenamento das amostras, até a análise do material. A utilização de marcadores moleculares para estudos populacionais, programas de melhoramento, monitoramento da diversidade genética de espécies cultivadas e conservação do patrimônio genético tem se expandido muito na última década, tanto no Brasil (MELO et al., 2006; ESPÍNDOLA, 2007; MOREIRA et al., 2007) quanto em outros países do mundo (CARLETON et al., 2002; BHASSU et al., 2004; RUTTEN et al., 2004; HASSANIEN e GILBEY, 2005; ROMANA-EGUÍA et al., 2005; NYINGI et al., 2009). Considerando que a extração do DNA é uma das primeiras etapas para o monitoramento genético de populações, faz-se necessário obter uma quantidade suficiente de DNA de boa qualidade, para que as regiões desejadas sejam localizadas e amplificadas por meio de técnicas de biologia molecular. REFERÊNCIA BIBLIOGRÁFICA ALJANABI, S.M. e MARTINEZ, I. Universal and rapid salt-extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques. Nucleic Acids Research, 25: 4692-4693, 1997. 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