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GD – Estrutura de proteínas 1 - William Astbury descobriu que o padrão de difração dos raios-X da lã mostra uma unidade estrutural repetitiva espaçada de aproximadamente 0,54nm ao longo da direção da fibra da lã. Quando ele submetia a lã ao vapor d’água e a esticava, o padrão de difração mostrava uma nova unidade estrutural repetitiva com espaçamento de 0,70nm. A lã submetida ao vapor d’água e deixada encolher, mostra um padrão de difração dos raios-X consistente com espaçamento original de 0,54nm. Embora estas observações sejam pistas importantes para a estrutura molecular da lã. Astbury não conseguiu interpretá-las na época. Dado o conhecimento atual sobre a estrutura da lã, interprete as observações de Astbury. 2 - Um polipeptídio isolado do cérebro tem a seguinte seqüência: Glu-His-Trp-Ser-Tyr-Gly-Leu-Arg-Pro-Gly Determine a carga líquida dessa molécula em pH 3, em pH 7,0 e em pH 11? Determine o PI (ponto isoelétrico) deste peptídio. 3 - Análise com raios X da estrutura terciária da mioglobina e de outras proteínas globulares pequenas e com uma única cadeia peptídica levaram a algumas generalizações sobre como as cadeias polipeptídicas de proteínas solúveis se enovelaram. Com isso em mente, indique a localização provável, no interior ou na superfície externa das moléculas de proteínas globulares nativas dos seguintes resíduos de aminoácidos: asp, leu, ser, val, glu, lis, asn, gli. 4 - O colágeno, a proteína mais abundante em mamíferos, tem composição em aminoácidos incomum. Diferentemente de outras proteínas, o colágeno é muito rico em prolina e hidroxiprolina Como a hidroxiprolina não é um dos 20 aminoácidos comumente encontrados em proteínas a sua incorporação no colágeno pode ocorrer de duas maneiras: 1. a prolina é hidroxilada por enzimas antes da sua incorporação ao colágeno; e 2. a prolina é hidroxilada depois de sua incorporação ao colágeno. Para testar estas hipóteses os seguintes experimentos foram realizados: quando [ 14 C]-prolina foi administrada a um rato e o colágeno da sua cauda isolado, encontrou-se que esta proteína recém-sintetizada era radioativa; entretanto, se [ 14 C]-hidroxiprolina foi administrada ao animal, nenhuma radioatividade foi encontrada no colágeno recém-sintetizado. Como estes experimentos diferenciam os dois mecanismos possíveis de introdução de hidroxiprolina na molécula do colágeno? 5 – Dois grupos de pesquisadores, trabalhando em laboratórios diferentes, determinaram a estrutura tridimensional de uma proteína X. O grupo A determinou a estrutura da proteína em pH = 7,0. O grupo B determinou a estrutura em pH = 9,5. Voce espera que os dois grupos encontrem estruturas idênticas ou diferentes para a proteína X? Explique. 6 - O que é uma proteína no seu estado nativo? Uma proteína, após alcançar esta conformação, se mantém sempre com a mesma estrutura? Explique. 7 – Descreva os quatro níveis de organização da estrutura das proteínas. Quais são as interações moleculares que estabilizam a estrutura das proteínas?
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