Questionário montagem de genomas

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Responda às questões abaixo com base na resposta obtida no tutorial.
1 - Qual a razão de realizar análise pelo FastqC? Em sua opinião, a qualidade dos reads é adequada para a montagem? 
O FastqC é uma maneira fácil de visualizarmos a qualidade dos dados, com vários gráficos. Sim, é adequada, pois como vimos no primeiro gráfico do FastqC, todas as bases possuem qualidade superior a 30, que é o valor considerado bom.
2 - Por que devemos remover adaptadores dos reads? 
Porque eles são ferramentas para nos ajudar no sequenciamento, mas não fazem parte da sequência em si.
3 - Quanto(s) contig(s) fori(am) montado(s), e qual(is) o(s) seu(s) tamanho(s)?
Um. O tamanho é de 5441 pares de base.
4 - Considerando esta montagem, quais os valores de N50 e L50?
N50: 5441
L50: 1
5 - Qual o significado destes índices?
O N50 é o comprimento do menor contig de forma que a soma dos contigs até ele englobe 50% da soma total dos contigs. Quanto maior, melhor, quer dizer que engloba mais genes sem quebras.
O L50 significa o número de contigs acima do valor de N50. Quanto menor, melhor, pois significa que menos contigs foram necessários pra atingir 50%.