Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
Mapas genéticos Teste de três pontos Distância entre os genes Frequência de recombinação Correlação positiva Unidades de recombinação - Centimorgam - cM • Centimorgan (cM) • Unidade de distância entre os genes • Correspondem a taxa de recombinação • Posição dos genes nos cromossomos • 1% de recombinação – 1cM • 15% de recombinação – 15cM Estimativa da Frequência de Recombinação a partir do Cruzamento Teste Frequência de recombinação = Freq. de Rec. = (23 + 19)/210 x 100 = 20% Nº de recombinantes Total de descendentes do cruzamento teste X 100 P1= oS/oS P2= Os/Os O –redondo o – alongado S- simples s – composta Logo, A distância entre os genes O e S é de 20cM Diagrama onde estão representados os genes e suas respectivas posições nos cromossomos. Mapa genético o s20 cM Ex.: Tomate • Solanum lycopersicum • 2n = 24 • 12 grupos de ligação Mapa genético Mapa genético (Rick, 1978) Marcadores morfólogicos - qualitativos Mapa genético • Teste de três pontos • Três genes ligados = três pontos • Dois genes • Recombinantes: Ab e aB – Não se percebe as duplas permutas • Três genes – Permite a detecção de duplas recombinações Teste de três pontos Mapa genético Teste de três pontos • Cruzamento teste • 3 genes ligados • Estimar a posição e ordem de três genes, tendo como base a relação de ligação entre eles. Mapa genético • Cruzamento teste - milho Ex.: ABC/abc x abc/abc A - folha verde B - folha brilhante C - pendão normal Teste de três pontos Fenótipo da descendência Genótipo Frequência observada Normal ABC 235 Brilhante, estéril Abc 62 Estéril ABc 40 Estéril, virescente aBc 4 Brilhante, estéril, virescente abc 270 Brilhante AbC 7 Brilhante, virescente abC 48 Virescente aBC 60 Total 726 a - folha virescente b – folha brilhante C - pendão estéril Etapas • Identificar os parentais • Permuta dupla • Descobrir qual o gene intermediário • Identificar os indivíduos da Região I e II • Calcular a frequência de recombinação da região I • Calcular a frequência de recombinação da região II • Construir o mapa Combinações paternas – ABC e abc – apresentaram maior frequência Fenótipo da descendência Genótipo Frequência observada Normal ABC 235 Brilhante, estéril Abc 62 Estéril ABc 40 Estéril, virescente aBc 4 Brilhante, estéril, virescente abc 270 Brilhante AbC 7 Brilhante, virescente abC 48 Virescente aBC 60 Total 726 Observações Teste de três pontos • Descendência com permuta dupla – Raros – Menos frequentes Fenótipo da descendência Genótipo Frequência observada Normal ABC 235 Brilhante, estéril Abc 62 Estéril ABc 40 Estéril, virescente aBc 4 Brilhante, estéril, virescente abc 270 Brilhante AbC 7 Brilhante, virescente abC 48 Virescente aBC 60 Total 726 Teste de três pontos • Comparando os parentais com os de permuta dupla pode-se concluir que a ordem dos genes é ABC • A permuta dupla só alterou o gene B – Posição intermediária Fenótipo da descendência Genótipo Frequência observada Normal ABC 235 Brilhante, estéril Abc 62 Estéril ABc 40 Estéril, virescente aBc 4 Brilhante, estéril, virescente abc 270 Brilhante AbC 7 Brilhante, virescente abC 48 Virescente aBC 60 Total 726 Teste de três pontos A - folha verde B - folha normal – s/brilho C - pendão normal a - folha virescente b – folha brilhante c - pendão estéril Fenótipo da descendência Genótip o Frequência observada Verde, sem brilho, normal ABC 235 Virescente, sem brilho, estéril aBc 4 Virescente, brilhante, estéril, abc 270 Verde, Brilhante, normal AbC 7 Total 726 Verde, sem brilho, normal (ABC) Virescente, brilhante, estéril (abc) Virescente , sem brilho, estéril (aBc) Verde, brilhante, normal (AbC) • Genótipos • Recombinantes da região I • Recombinantes da região II • Estimar as distâncias Teste de três pontos A B C a b c Região I Região II Vamos verificar os recombinante provenientes de uma única permuta em uma região ou outra. ABC abc Parentais • Recombinantes da região I A B C a b c Região I Região II B C a A b c aBC Abc • Recombinantes da região II A B C a b c Região I Região II A B c C a b ABc abC A B C a b c Região I Região II • Dupla permuta A C b AbC B a c aBc ABC abc Genótipo Freq. observada ABC 235 Abc 62 ABc 40 aBc 4 abc 270 AbC 7 abC 48 aBC 60 Total 726 Combinações parentais aBc AbC Permutas Duplas aBC Abc Permutas na região I ABc abC Permutas na região II a. Estimativa da distância da região I Distância entre os genes A e B. A B C a b c Região I Região II Considerar todos os recombinantes da região e os de dupla permuta! Genótipo Freq. observada ABC 235 Abc 62 ABc 40 aBc 4 abc 270 AbC 7 abC 48 aBC 60 Total 726 FR= (133/726) x 100= 18,3% 62 Abc + 4 aBc + 7 AbC + 60 aBC = 133 FR= (Recombinantes /n) x 100 Distância entre A e B é de 18,3 cM a. Estimativa da distância da região II A B C a b c Região I Região II Genótipo Freq. observada ABC 235 Abc 62 ABc 40 aBc 4 abc 270 AbC 7 abC 48 aBC 60 Total 726 Distância entre os genes B e C. Considerar todos os recombinantes da região e os de dupla permuta! FR= (Recombinantes /n) x 100 40 ABc + 4 aBc + 7 AbC + 48 abC = 99 FR= (99/726) x 100 = 13,6% Distância entre B e C é de 13,6 cM c. Estimativa da interferência • A permuta de uma região pode interferir na outra – Quanto mais próximos estiverem os pontos de permuta • Estimativa de interferência – Compara-se as frequências de permutas duplas observadas (FPDO) e esperadas (FPDE) A B C a b c Região I Região II FPDO = nº de duplos recombinantes x 100 nº total de descendentes c. Estimativa da interferência A B C a b c Região I Região II Genótipo Freq. observada ABC 235 Abc 62 ABc 40 aBc 4 abc 270 AbC 7 abC 48 aBC 60 Total 726 FPDO = 4 + 7 x 100 = 1,5% 726 Interferência (I) = 1- FDPO FDPE c. Estimativa da interferência FPDE = Distância da região I x Distância da região II 100 A B C a b c Região I Região II Distância entre A e B é de 18,3 cM Distância entre B e C é de 13,6 cM FPDE = 18,3 x 13,6 =2,5% 100 Interferência (I) = 1- FDPO = 1- 1,5 = 0,4 x 100= 40% FDPE 2,5 FPDO = 4 + 7 x 100 = 1,5% 726 FPDE = 18,3 x 13,6 =2,5% 100 c. Estimativa da interferência Conclui-se que 40% das frequências de permutas duplas esperadas não foram observadas Interferência (I) = 1- FDPO FDPE Esquema do Mapa genético para os três genes A - folha verde B - folha brilhante C - pendão normal a - folha virescente b – folha brilhante c - pendão estéril a b c18,3 Distância entre A e B é de 18,3 cM Distância entre B e C é de 13,6 cM 13,6 Ramalho et al., Genética na Agropecuária. Ed. UFLA. Mapa genético – teste dos três pontos Ex. 2: Drosophila melanogaster v: olhos vermilion cv: ausência de nervuras nas asas ct: margens das asas cortadas Genótipo Freq. observada v cv+ ct+ 580 v+ cv ct 592 v cv ct+ 45 v+ cv+ct 40 v cv ct 89 v+ cv+ct+ 94 v cv+ct 3 v+ cv ct+ 5 Total 1448 Genótipo Freq. observada v cv+ ct+ 580 v+ cv ct 592 v cv ct+ 45 v+ cv+ct 40 v cv ct 89 v+ cv+ct+ 94 v cv+ct 3 v+ cv ct+ 5 Total 1448 Cruzamento teste v+v ct+ct cv+cv x vv ctct cvcv Genótipo Freq. observada v cv+ ct+ 580 v+ cv ct 592 v cv ct+ 45 v+ cv+ct 40 v cv ct 89 v+ cv+ct+ 94 v cv+ct 3 v+ cv ct+ 5 Total 1448 Parentais Dupla permuta v cv+ ct+ v+ cv ct v cv+ ct v+ cv ct + ct – posição intermediária Genótipo Freq. observada v cv+ ct+ 580 v+ cv ct 592 v cv ct+ 45 v+ cv+ct 40 v cv ct 89 v+ cv+ct+ 94 v cv+ct 3 v+ cv ct+ 5 Total 1448 v+ ct+ cv+ Região I Região II v ct cv Recombinantes da região I v+ ct+ cv+ v ct cv Recombinantes da região II v ct+ cv v+ ct cv+ v+ ct+ cv+ Região I Região II v ct cv Estimativas da distância • Região 1 – v e ct Genótipo FO v cv+ ct+ 580 Parentais v+ cv ct 592 Parentais v cv ct+ 45 Rec. região II v+ cv+ct 40 Rec. regiãoII v cv ct 89 Rec. região I v+ cv+ct+ 94 Rec. região I v cv+ct 3 Duplarec. v+ cv ct+ 5 Dupla rec. Total 1448 FR= (89+94+3+5/1448) x 100 FR= 13,2% • Região 2 - ct e cv FR= (45+40+3+5/1448) x 100 FR= 6,4% v+ ct+ cv+ Região I Região II v ct cvFR= (Recombinantes /n) x 100 ct cvv 13,2 6,4 19,6 cM FR= 45+40+89+94+3+5/1448 x100= 19,6 Qual a posição dos genes nos cromossomos? Frequências de recombinação Em um cromossomo há a seguinte frequência de recombinação entre os genes a, b,c e d. • A-B - 45% • B-D – 5% • A-C – 20% • C-D – 20% • C-B – 25% • A-D – 40% Qual a posição dos genes nos cromossomos? ?
Compartilhar