Um sítio informativo em uma filogenia molecular é um local específico no genoma onde ocorrem variações genéticas que podem ser usadas para inferir relações evolutivas entre diferentes organismos. Essas variações podem ser mutações pontuais, inserções ou deleções de bases nucleotídicas. Esses sítios informativos são importantes para construir árvores filogenéticas e entender a relação de parentesco entre diferentes espécies ou populações.
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