A principal diferença entre a genômica e a transcriptômica é que a genômica estuda o conjunto completo de genes e DNA de um organismo, enquanto a transcriptômica se concentra na análise dos genes que estão sendo expressos em um determinado momento, ou seja, o conjunto de transcritos de RNA mensageiro (mRNA) produzidos pelas células. A genômica é mais ampla e abrangente, enquanto a transcriptômica é mais específica e focada na expressão gênica.
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