A digestão é um processo complexo que envolve tanto processos químicos quanto físicos. Os processos químicos são responsáveis pela quebra das moléculas dos alimentos em moléculas menores, que podem ser absorvidas pelo organismo. Essa quebra é realizada pelas enzimas digestivas, que são produzidas por diferentes órgãos do sistema digestório, como o estômago, o pâncreas e o intestino delgado. Os processos físicos, por sua vez, são responsáveis por preparar os alimentos para a ação das enzimas. A mastigação, por exemplo, é um processo físico que ajuda a triturar os alimentos e a misturá-los com a saliva, que contém enzimas digestivas. A deglutição, por sua vez, é o processo pelo qual os alimentos são empurrados da boca para o esôfago, onde são levados até o estômago. As contrações dos órgãos também são processos físicos importantes na digestão. No estômago, por exemplo, as contrações ajudam a misturar os alimentos com o suco gástrico, que contém ácido clorídrico e enzimas digestivas. No intestino delgado, as contrações ajudam a empurrar os alimentos digeridos para frente, permitindo que as enzimas digestivas continuem a agir. Entre as diferentes espécies, os processos físicos e químicos da digestão podem variar bastante. Por exemplo, algumas espécies de aves não possuem dentes e, por isso, engolem os alimentos inteiros, que são depois triturados no estômago com a ajuda de pedrinhas. Já os ruminantes, como as vacas, possuem um sistema digestório especializado que lhes permite digerir alimentos fibrosos, como a grama, por meio da fermentação bacteriana no rúmen.
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