Para um patógeno infectar uma planta, é necessário que ele consiga penetrar e colonizar os tecidos do hospedeiro, retirar os nutrientes necessários...

Os patógenos utilizam as enzimas, toxinas e hormônios para infectar as plantas de diversas maneiras. As enzimas são usadas para degradar a parede celular da planta, permitindo que o patógeno penetre nos tecidos do hospedeiro. As toxinas são produzidas pelos patógenos para matar as células da planta e, assim, facilitar a colonização. Já os hormônios são usados para manipular a resposta da planta, fazendo com que ela não ative suas defesas naturais ou até mesmo promovendo o crescimento do patógeno. Por exemplo, algumas bactérias produzem enzimas que degradam a celulose, a hemicelulose e a pectina, que são componentes importantes da parede celular da planta. Isso permite que a bactéria penetre nos tecidos da planta e se multiplique. Alguns fungos produzem toxinas que matam as células da planta, como a aflatoxina, que é produzida pelo fungo Aspergillus flavus e pode causar doenças em plantas como o amendoim. Já alguns vírus produzem hormônios que promovem o crescimento do patógeno, como o ácido abscísico, que é produzido pelo vírus do mosaico do pepino e pode causar doenças em plantas como o pepino.